More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_7154 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_7154  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
351 aa  699    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0462629  normal  0.0194652 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1877  alcohol dehydrogenase  39.45 
 
 
364 aa  249  4e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.115652 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2325  alcohol dehydrogenase  34.13 
 
 
385 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0569732  normal  0.0442784 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2286  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34.13 
 
 
385 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.775062  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2333  alcohol dehydrogenase  34.13 
 
 
385 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.255092 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000625  zinc-binding dehydrogenase  31.83 
 
 
352 aa  191  2e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2276  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.81 
 
 
388 aa  190  2.9999999999999997e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13758  dehydrogenase  34.36 
 
 
397 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0782561 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5762  alcohol dehydrogenase  33.51 
 
 
386 aa  182  8.000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.117069  normal  0.104571 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0310  alcohol dehydrogenase  30.99 
 
 
358 aa  179  7e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4773  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.28 
 
 
338 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3714  alcohol dehydrogenase  30.99 
 
 
358 aa  178  1e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0557081 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4859  alcohol dehydrogenase  35.28 
 
 
338 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5159  alcohol dehydrogenase  35.83 
 
 
338 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.821329 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1008  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.32 
 
 
387 aa  175  8e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0305  alcohol dehydrogenase  31.55 
 
 
358 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0851572 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2235  alcohol dehydrogenase  28.8 
 
 
340 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000256926  hitchhiker  0.0000000000711864 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0286  alcohol dehydrogenase  26.65 
 
 
337 aa  96.7  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.425659  normal  0.323725 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1874  GroES-related  26.27 
 
 
335 aa  93.6  4e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.335289  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5001  alcohol dehydrogenase  26.21 
 
 
373 aa  93.2  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0299  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.78 
 
 
336 aa  90.5  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3492  hypothetical protein  27.17 
 
 
342 aa  87  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835811  normal  0.583011 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2793  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.37 
 
 
356 aa  86.7  6e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630976  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0270  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.23 
 
 
336 aa  85.1  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3845  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  25.67 
 
 
354 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.650761  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4416  alcohol dehydrogenase  25.67 
 
 
354 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0164512  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4523  alcohol dehydrogenase  25.67 
 
 
365 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11719  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5781  alcohol dehydrogenase  25.67 
 
 
354 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.110473  normal 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4159  alcohol dehydrogenase  26.16 
 
 
350 aa  84.3  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.44287  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0934  2,3-butanediol dehydrogenase  24.6 
 
 
363 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3953  alcohol dehydrogenase  25.4 
 
 
354 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1325  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  24.87 
 
 
354 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.614702  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3148  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  27.84 
 
 
373 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10230  2,3-butanediol dehydrogenase  24.13 
 
 
363 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.219159  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1029  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.39 
 
 
356 aa  80.9  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0432101  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0293  L-threonine 3-dehydrogenase  28.5 
 
 
347 aa  81.3  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3142  alcohol dehydrogenase  25.93 
 
 
373 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0742  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  25.35 
 
 
350 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000731787  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0619  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  25.14 
 
 
339 aa  80.1  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4631  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  25.07 
 
 
350 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000566989  hitchhiker  0.000000000000161972 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0585  zinc-containing alcohol dehydrogenase, long-chain  25.35 
 
 
350 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0307293  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0584  zinc-containing alcohol dehydrogenase, long-chain  25.35 
 
 
350 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0359  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  22.86 
 
 
366 aa  79.7  0.00000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0705  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  25.07 
 
 
350 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00256645  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0802  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  25.35 
 
 
350 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000206272  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6841  alcohol dehydrogenase  26.55 
 
 
358 aa  79.3  0.00000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4724  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  23.43 
 
 
348 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.383474  normal  0.446449 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0730  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  25.92 
 
 
350 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.35905e-47 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0641  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  25.92 
 
 
350 aa  79  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22030  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  26.91 
 
 
375 aa  79.3  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.255526  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0675  alcohol dehydrogenase  25.92 
 
 
350 aa  79  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000371622  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3651  alcohol dehydrogenase  28.62 
 
 
365 aa  78.6  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198781  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0589  alcohol dehydrogenase  25.75 
 
 
350 aa  79  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00429801  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3964  zinc-binding alcohol dehydrogenase  26.48 
 
 
344 aa  78.2  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.356681 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2224  L-threonine 3-dehydrogenase  25 
 
 
344 aa  77  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2240  zinc-binding alcohol dehydrogenase  27.35 
 
 
355 aa  77.4  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0360217 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2786  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  26.46 
 
 
341 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2089  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  25 
 
 
385 aa  77  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41760  2,3-butanediol dehydrogenase  23.26 
 
 
360 aa  77  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2830  alcohol dehydrogenase  26.46 
 
 
341 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.782331  normal  0.335133 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4497  alcohol dehydrogenase  26.7 
 
 
373 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3300  alcohol dehydrogenase  27.04 
 
 
337 aa  77  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0441476 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2813  alcohol dehydrogenase  26.74 
 
 
341 aa  76.6  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0594163  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5133  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  26.7 
 
 
373 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0355  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  25.76 
 
 
350 aa  76.6  0.0000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5726  alcohol dehydrogenase  26.7 
 
 
373 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4160  L-threonine 3-dehydrogenase  24.7 
 
 
342 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4132  alcohol dehydrogenase  24.1 
 
 
364 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00103108  normal  0.177919 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0552  2,3-butanediol dehydrogenase  23.26 
 
 
362 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02400  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  27.35 
 
 
345 aa  75.1  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.242832  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0597  alcohol dehydrogenase  22.99 
 
 
362 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0643205 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2740  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  24.59 
 
 
344 aa  75.5  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.120973 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1028  L-threonine 3-dehydrogenase  28.04 
 
 
347 aa  74.7  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1654  zinc-type alcohol dehydrogenase  24.86 
 
 
341 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.959787  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02960  L-arabinitol 4-dehydrogenase, putative  24.52 
 
 
392 aa  74.7  0.000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1794  zinc-type alcohol dehydrogenase  24.86 
 
 
341 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7003  L-threonine 3-dehydrogenase  24.7 
 
 
343 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0591  alcohol dehydrogenase  23.26 
 
 
362 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1646  zinc-type alcohol dehydrogenase  24.86 
 
 
341 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5304  alcohol dehydrogenase  26.42 
 
 
373 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.183348  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3661  alcohol dehydrogenase  23.32 
 
 
340 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3224  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  22.88 
 
 
357 aa  74.3  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1628  zinc-type alcohol dehydrogenase  24.86 
 
 
341 aa  74.3  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2958  L-threonine 3-dehydrogenase  24.41 
 
 
345 aa  74.3  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.108215  normal  0.634974 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3523  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  30.13 
 
 
349 aa  73.9  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.538037  normal  0.114116 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0780  L-threonine 3-dehydrogenase  28.12 
 
 
348 aa  73.9  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0119  L-threonine 3-dehydrogenase  25.52 
 
 
341 aa  73.9  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2463  alcohol dehydrogenase  24.86 
 
 
338 aa  73.6  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1003  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.89 
 
 
342 aa  73.6  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.124693 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0111  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  25.13 
 
 
346 aa  72.8  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.685432  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3020  L-threonine 3-dehydrogenase  24.7 
 
 
343 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0089  L-threonine 3-dehydrogenase  25.59 
 
 
341 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4044  L-threonine 3-dehydrogenase  25.59 
 
 
341 aa  72.4  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.100127  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02880  L-iditol 2-dehydrogenase, putative  24.3 
 
 
400 aa  72.4  0.00000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0449  L-threonine 3-dehydrogenase  25.9 
 
 
361 aa  72.4  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.333655 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0351  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  27.42 
 
 
357 aa  72.4  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.798846  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0021  Zn-binding dehydrogenase  22.88 
 
 
352 aa  72  0.00000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0554419  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0472  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.12 
 
 
368 aa  72  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2700  L-threonine 3-dehydrogenase  24.3 
 
 
345 aa  72  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2217  alcohol dehydrogenase  24.34 
 
 
357 aa  72  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>