More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1874 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1874  GroES-related  100 
 
 		 335 aa  676    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.335289  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0286  alcohol dehydrogenase  44.44 
 
 		 337 aa  266  2.9999999999999995e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.425659  normal  0.323725 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2235  alcohol dehydrogenase  43.82 
 
 		 340 aa  265  5.999999999999999e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000256926  hitchhiker  0.0000000000711864 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4159  alcohol dehydrogenase  35.71 
 
 		 350 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.44287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0330  2,3-butanediol dehydrogenase  32.29 
 
 		 355 aa  182  1e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0934  2,3-butanediol dehydrogenase  34.83 
 
 		 363 aa  178  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41760  2,3-butanediol dehydrogenase  32.77 
 
 		 360 aa  175  8e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10230  2,3-butanediol dehydrogenase  34.27 
 
 		 363 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.219159  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0552  2,3-butanediol dehydrogenase  34.08 
 
 		 362 aa  172  5e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5781  alcohol dehydrogenase  32.2 
 
 		 354 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.110473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3845  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.2 
 
 		 354 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.650761  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4523  alcohol dehydrogenase  32.2 
 
 		 365 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0597  alcohol dehydrogenase  33.8 
 
 		 362 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0643205 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4416  alcohol dehydrogenase  31.92 
 
 		 354 aa  170  3e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0164512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3148  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.69 
 
 		 373 aa  170  4e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5133  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  35.48 
 
 		 373 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3953  alcohol dehydrogenase  31.92 
 
 		 354 aa  170  4e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5726  alcohol dehydrogenase  35.48 
 
 		 373 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1325  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.92 
 
 		 354 aa  169  5e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.614702  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0591  alcohol dehydrogenase  33.52 
 
 		 362 aa  169  7e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1043  alcohol dehydrogenase  31.92 
 
 		 353 aa  169  8e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4497  alcohol dehydrogenase  34.9 
 
 		 373 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0641  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.25 
 
 		 350 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0675  alcohol dehydrogenase  32.25 
 
 		 350 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000371622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0730  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  32.25 
 
 		 350 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.35905e-47 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0788  alcohol dehydrogenase  32.76 
 
 		 349 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.690483 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0705  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  32.25 
 
 		 350 aa  166  4e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00256645  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0742  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.54 
 
 		 350 aa  166  4e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000731787  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0585  zinc-containing alcohol dehydrogenase, long-chain  32.54 
 
 		 350 aa  166  4e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0307293  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0584  zinc-containing alcohol dehydrogenase, long-chain  32.54 
 
 		 350 aa  166  4e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0802  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  32.54 
 
 		 350 aa  166  4e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000206272  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4631  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  32.25 
 
 		 350 aa  166  4e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000566989  hitchhiker  0.000000000000161972 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5001  alcohol dehydrogenase  34.83 
 
 		 373 aa  166  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0589  alcohol dehydrogenase  32.54 
 
 		 350 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00429801  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0049  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.57 
 
 		 350 aa  166  6.9999999999999995e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0355  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.09 
 
 		 350 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02158  alcohol dehydrogenase, zinc-containing (AFU_orthologue; AFUA_2G15930)  32.76 
 
 		 353 aa  166  8e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.953823  normal  0.515496 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5304  alcohol dehydrogenase  33.71 
 
 		 373 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.183348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1737  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.38 
 
 		 347 aa  165  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0264649 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0912  threonine dehydrogenase related Zn-dependent dehydrogenase  31.43 
 
 		 349 aa  162  7e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00151014  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2269  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.14 
 
 		 335 aa  162  9e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.992449  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0125  alcohol dehydrogenase  32.47 
 
 		 350 aa  161  1e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0844378  normal  0.76692 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4132  alcohol dehydrogenase  31.4 
 
 		 364 aa  160  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00103108  normal  0.177919 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2445  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  30.65 
 
 		 347 aa  160  3e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.682207  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2189  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.22 
 
 		 346 aa  160  3e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10900  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  34.22 
 
 		 352 aa  159  6e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.867442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3545  alcohol dehydrogenase  34.38 
 
 		 345 aa  159  9e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.715464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0111  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.24 
 
 		 346 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.685432  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0475  alcohol dehydrogenase  32.02 
 
 		 345 aa  157  3e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3661  alcohol dehydrogenase  31.87 
 
 		 340 aa  157  3e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0944  L-idonate 5-dehydrogenase  36.15 
 
 		 350 aa  156  4e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.272351  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13100  L-threonine 3-dehydrogenase  33.22 
 
 		 336 aa  156  6e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3998  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.2 
 
 		 333 aa  155  7e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.235514 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2740  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.95 
 
 		 344 aa  155  8e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.120973 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0745  threonine dehydrogenase or related Zn-dependent dehydrogenase  32.09 
 
 		 360 aa  155  8e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0389  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.52 
 
 		 341 aa  155  9e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4094  alcohol dehydrogenase  34.42 
 
 		 358 aa  155  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.958788  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0739  zinc-containing alcohol dehydrogenase; sorbitol dehydrogenase (L-iditol 2-dehydrogenase)  31.25 
 
 		 340 aa  154  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.725171  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0357  zinc-dependent dehydrogenase  30.37 
 
 		 349 aa  154  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3324  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.03 
 
 		 350 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0421123  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1258  alcohol dehydrogenase  33.13 
 
 		 344 aa  152  5e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0672332  normal  0.983976 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3142  alcohol dehydrogenase  34.83 
 
 		 373 aa  152  8e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00599  conserved hypothetical protein  31.91 
 
 		 369 aa  151  1e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.932146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0685  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.4 
 
 		 338 aa  151  1e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4773  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.16 
 
 		 338 aa  151  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0299  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.46 
 
 		 336 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4859  alcohol dehydrogenase  31.16 
 
 		 338 aa  151  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2032  sorbitol dehydrogenase, putative  32.18 
 
 		 350 aa  150  2e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000906358  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5159  alcohol dehydrogenase  31.62 
 
 		 338 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.821329 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0038  alcohol dehydrogenase  30.23 
 
 		 340 aa  150  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0153  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.07 
 
 		 323 aa  150  3e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.568823  normal  0.158485 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5063  alcohol dehydrogenase  35.71 
 
 		 347 aa  150  4e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.724577  normal  0.863659 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3248  sorbitol dehydrogenase  30.7 
 
 		 340 aa  149  6e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0582225  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0270  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.16 
 
 		 336 aa  149  9e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0388  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  30.25 
 
 		 344 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00875101  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0351  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.33 
 
 		 357 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.798846  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1010  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.65 
 
 		 340 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01539  hypothetical protein  29.38 
 
 		 339 aa  147  3e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.161589  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01549  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  29.38 
 
 		 339 aa  147  3e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0963058  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0537  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.41 
 
 		 325 aa  147  3e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00294504  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2268  alcohol dehydrogenase  29.66 
 
 		 358 aa  147  3e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.396502  hitchhiker  0.0088894 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2063  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.38 
 
 		 339 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00265684  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4724  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.29 
 
 		 348 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.383474  normal  0.446449 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2050  putative dehydrogenase  29.38 
 
 		 339 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0249357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5306  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.88 
 
 		 329 aa  146  5e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1787  putative dehydrogenase  29.1 
 
 		 339 aa  146  5e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.496797  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2063  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  34.6 
 
 		 322 aa  145  7.0000000000000006e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.860675 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1000  putative alcohol dehydrogenase  34.41 
 
 		 352 aa  145  9e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5131  putative dehydrogenase  28.27 
 
 		 343 aa  144  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.869856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2647  dehydrogenase  28.95 
 
 		 338 aa  145  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0114296  normal  0.147618 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1620  putative dehydrogenase  29.08 
 
 		 339 aa  145  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00863317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4598  putative dehydrogenase  28.27 
 
 		 343 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.703201 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0638  alcohol dehydrogenase  33.04 
 
 		 343 aa  144  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.434534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1668  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.04 
 
 		 343 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1538  L-idonate 5-dehydrogenase  34.25 
 
 		 347 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5456  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.04 
 
 		 343 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.077084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0556  alcohol dehydrogenase  33.04 
 
 		 343 aa  144  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.46957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2436  alcohol dehydrogenase  31.14 
 
 		 345 aa  144  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1641  alcohol dehydrogenase  33.04 
 
 		 343 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5853  alcohol dehydrogenase  33.04 
 
 		 343 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00833857  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>