More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2436 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_2436  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
345 aa  693    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3340  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  50.15 
 
 
356 aa  332  7.000000000000001e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6416  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  49.13 
 
 
343 aa  329  4e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.124082  normal  0.304265 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5030  zinc-binding dehydrogenase  49.57 
 
 
343 aa  328  9e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.959168  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4509  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  48.84 
 
 
343 aa  326  3e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2879  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  48.53 
 
 
345 aa  321  9.999999999999999e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.268542  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4724  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  46.55 
 
 
348 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.383474  normal  0.446449 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3728  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  48.97 
 
 
352 aa  316  5e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.854934  normal  0.447633 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3565  alcohol dehydrogenase  46.38 
 
 
345 aa  315  5e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0159  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  48.68 
 
 
347 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.306594  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0642  alcohol dehydrogenase  48.68 
 
 
352 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0609  alcohol dehydrogenase  48.68 
 
 
352 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0295083  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5333  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  49.57 
 
 
345 aa  309  4e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0397204  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2124  L-idonate 5-dehydrogenase, NAD-binding  49.28 
 
 
343 aa  306  2.0000000000000002e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.321081  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0948  putative L-idonate 5-dehydrogenase oxidoreductase protein  48.41 
 
 
344 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.593328 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5671  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  47.54 
 
 
343 aa  300  2e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1538  L-idonate 5-dehydrogenase  45.66 
 
 
347 aa  298  9e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1590  alcohol dehydrogenase  48.99 
 
 
342 aa  289  5.0000000000000004e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00466455  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3621  alcohol dehydrogenase  47.71 
 
 
347 aa  286  4e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0944  L-idonate 5-dehydrogenase  43.1 
 
 
350 aa  280  2e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.272351  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4094  alcohol dehydrogenase  43.02 
 
 
358 aa  277  2e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.958788  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3523  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  45.8 
 
 
349 aa  275  1.0000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.538037  normal  0.114116 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4523  L-idonate 5-dehydrogenase  42.68 
 
 
343 aa  271  1e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0181227  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04133  L-idonate 5-dehydrogenase, NAD-binding  42.68 
 
 
343 aa  271  1e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04097  hypothetical protein  42.68 
 
 
343 aa  271  1e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3730  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.68 
 
 
343 aa  271  1e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4748  L-idonate 5-dehydrogenase  42.37 
 
 
343 aa  270  2e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5063  alcohol dehydrogenase  43.73 
 
 
347 aa  270  2.9999999999999997e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.724577  normal  0.863659 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3287  L-idonate 5-dehydrogenase  40.58 
 
 
344 aa  269  4e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3545  alcohol dehydrogenase  44.93 
 
 
345 aa  268  1e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.715464  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4771  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  42.15 
 
 
344 aa  265  7e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.107599 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4769  L-idonate 5-dehydrogenase  41.41 
 
 
343 aa  265  8e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0966138  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0221  L-idonate 5-dehydrogenase  43.29 
 
 
343 aa  264  1e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4888  L-idonate 5-dehydrogenase  41.41 
 
 
343 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.138899  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4739  L-idonate 5-dehydrogenase  41.41 
 
 
343 aa  263  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.130148 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4832  L-idonate 5-dehydrogenase  41.41 
 
 
343 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4869  L-idonate 5-dehydrogenase  41.41 
 
 
343 aa  263  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0951463 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3685  alcohol dehydrogenase  43.31 
 
 
347 aa  261  1e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.112233 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1915  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  47.19 
 
 
349 aa  259  6e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.482777  normal  0.264492 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4821  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.31 
 
 
344 aa  257  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111851  normal  0.477759 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1003  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.42 
 
 
342 aa  238  1e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.124693 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5057  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  41.74 
 
 
340 aa  232  7.000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.73696  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02400  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  41.12 
 
 
345 aa  230  2e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.242832  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3277  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.77 
 
 
345 aa  227  3e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2056  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.35 
 
 
342 aa  225  7e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0472  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.07 
 
 
368 aa  223  3e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2451  alcohol dehydrogenase  39.36 
 
 
355 aa  213  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2330  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.96 
 
 
352 aa  210  2e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.752502  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28190  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  39.3 
 
 
345 aa  209  6e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1714  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.65 
 
 
352 aa  209  8e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3492  hypothetical protein  38.79 
 
 
342 aa  204  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835811  normal  0.583011 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0836  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.35 
 
 
347 aa  204  2e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2813  alcohol dehydrogenase  37.72 
 
 
341 aa  204  3e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0594163  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2786  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  37.43 
 
 
341 aa  202  5e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2830  alcohol dehydrogenase  37.43 
 
 
341 aa  202  5e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.782331  normal  0.335133 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01050  sorbitol dehydrogenase, putative  35.63 
 
 
379 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.917438  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2131  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.53 
 
 
349 aa  197  2.0000000000000003e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2713  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.32 
 
 
333 aa  197  3e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2793  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.81 
 
 
356 aa  197  3e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630976  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09064  hypothetical protein similar to xylitol dehydrogenase (Broad)  34.23 
 
 
359 aa  195  8.000000000000001e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.715081 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21210  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  39.44 
 
 
336 aa  195  9e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0732  L-iditol 2-dehydrogenase  30.5 
 
 
348 aa  193  3e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2013  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.98 
 
 
344 aa  192  1e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.238084  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4289  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.35 
 
 
360 aa  189  4e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.70382 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2189  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.53 
 
 
346 aa  185  1.0000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02666  sorbitol/xylitol dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02000)  36.45 
 
 
373 aa  182  7e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3993  L-threonine 3-dehydrogenase  31.45 
 
 
341 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00526956  normal  0.0228585 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4673  L-threonine 3-dehydrogenase  31.45 
 
 
341 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3901  L-threonine 3-dehydrogenase  31.64 
 
 
341 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00409651  normal  0.55097 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4105  L-threonine 3-dehydrogenase  31.64 
 
 
341 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287848  normal  0.406165 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3902  L-threonine 3-dehydrogenase  31.45 
 
 
341 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00646337  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4144  L-threonine 3-dehydrogenase  30.65 
 
 
341 aa  174  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.498759  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2269  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.17 
 
 
335 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.992449  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0072  L-threonine 3-dehydrogenase  30.65 
 
 
341 aa  174  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3939  L-threonine 3-dehydrogenase  31.78 
 
 
341 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.27746  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4341  L-threonine 3-dehydrogenase  31.16 
 
 
341 aa  172  5e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.183698  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0064  L-threonine 3-dehydrogenase  32.09 
 
 
341 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00353875  unclonable  0.000000014689 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0097  L-threonine 3-dehydrogenase  31.94 
 
 
341 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0317813  hitchhiker  0.00132916 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02580  sorbitol dehydrogenase, putative  30.32 
 
 
416 aa  172  9e-42  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3710  L-threonine 3-dehydrogenase  31.78 
 
 
341 aa  172  1e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.187743  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4481  L-threonine 3-dehydrogenase  31.16 
 
 
341 aa  172  1e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.155025  normal  0.0226787 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0066  L-threonine 3-dehydrogenase  30.36 
 
 
341 aa  171  1e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4286  L-threonine 3-dehydrogenase  31.16 
 
 
341 aa  172  1e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000588728 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3580  hypothetical protein  34.6 
 
 
350 aa  171  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.885973 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0057  L-threonine 3-dehydrogenase  31.16 
 
 
341 aa  172  1e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0451496  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08109  conserved hypothetical protein  34.06 
 
 
583 aa  171  2e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.401765  normal  0.665757 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0739  L-threonine 3-dehydrogenase  31.25 
 
 
340 aa  171  2e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001213  L-threonine 3-dehydrogenase  31.48 
 
 
343 aa  170  3e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0062  L-threonine 3-dehydrogenase  31.93 
 
 
340 aa  170  3e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0757  L-threonine 3-dehydrogenase  31.25 
 
 
340 aa  169  4e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0106  L-threonine 3-dehydrogenase  31.45 
 
 
341 aa  170  4e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.588963  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05001  L-threonine 3-dehydrogenase  31.29 
 
 
360 aa  170  4e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4823  L-threonine 3-dehydrogenase  29.76 
 
 
341 aa  169  5e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000204753 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01090  xylitol dehydrogenase, putative  33.43 
 
 
375 aa  169  7e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02960  L-arabinitol 4-dehydrogenase, putative  31.62 
 
 
392 aa  169  7e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0353  L-threonine 3-dehydrogenase  30.67 
 
 
343 aa  169  8e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0100  L-threonine 3-dehydrogenase  31.46 
 
 
341 aa  168  1e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.173553 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4094  L-threonine 3-dehydrogenase  30.36 
 
 
341 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4033  L-threonine 3-dehydrogenase  30.36 
 
 
341 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3926  L-threonine 3-dehydrogenase  30.36 
 
 
341 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>