More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_2050 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01549  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  99.41 
 
 		 339 aa  689    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0963058  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2063  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  99.71 
 
 		 339 aa  689    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00265684  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2050  putative dehydrogenase  100 
 
 		 339 aa  693    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0249357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1620  putative dehydrogenase  97.94 
 
 		 339 aa  680    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00863317  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01539  hypothetical protein  99.41 
 
 		 339 aa  689    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.161589  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1787  putative dehydrogenase  98.53 
 
 		 339 aa  685    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.496797  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1933  putative dehydrogenase  76.4 
 
 		 339 aa  570  1e-161  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.121666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1653  starvation sensing protein RspB  97.89 
 
 		 288 aa  566  1e-160  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00258422  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1676  putative dehydrogenase  74.93 
 
 		 339 aa  554  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1608  putative dehydrogenase  74.93 
 
 		 339 aa  554  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1617  putative dehydrogenase  75.22 
 
 		 339 aa  556  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1666  putative dehydrogenase  74.34 
 
 		 339 aa  551  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.747821  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1037  putative dehydrogenase  74.34 
 
 		 340 aa  526  1e-148  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0803  putative dehydrogenase  73.75 
 
 		 343 aa  523  1e-147  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.506069  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1269  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  71.68 
 
 		 340 aa  521  1e-147  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2636  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  71.6 
 
 		 340 aa  517  1.0000000000000001e-145  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108984  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3564  alcohol dehydrogenase  64.09 
 
 		 347 aa  473  1e-132  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.950821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2119  dehydrogenase starvation-sensing protein  59.94 
 
 		 340 aa  429  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4598  putative dehydrogenase  53.51 
 
 		 343 aa  387  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.703201 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5131  putative dehydrogenase  53.51 
 
 		 343 aa  385  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.869856  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0765  putative dehydrogenase  52.34 
 
 		 343 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0512  putative dehydrogenase  52.34 
 
 		 343 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345922  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0584  putative dehydrogenase  52.34 
 
 		 343 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.24761  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0695  putative dehydrogenase  52.34 
 
 		 343 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.375651  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2097  putative dehydrogenase  52.34 
 
 		 343 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2002  putative dehydrogenase  52.34 
 
 		 343 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1649  putative dehydrogenase  52.34 
 
 		 343 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2975  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  43.36 
 
 		 340 aa  299  5e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0388433  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0038  alcohol dehydrogenase  44.87 
 
 		 340 aa  298  6e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0981  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45.32 
 
 		 342 aa  296  4e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1614  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.71 
 
 		 338 aa  237  2e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000216473  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2008  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.86 
 
 		 337 aa  219  7.999999999999999e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.590492  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1713  zinc-type alcohol dehydrogenase  32.35 
 
 		 341 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1646  zinc-type alcohol dehydrogenase  32.35 
 
 		 341 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1794  zinc-type alcohol dehydrogenase  32.35 
 
 		 341 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1654  zinc-type alcohol dehydrogenase  32.35 
 
 		 341 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.959787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1628  zinc-type alcohol dehydrogenase  32.35 
 
 		 341 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0388  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.25 
 
 		 344 aa  182  9.000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00875101  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0797  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  36.15 
 
 		 338 aa  182  1e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.121673  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2445  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.85 
 
 		 347 aa  179  7e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.682207  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2061  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  31.52 
 
 		 339 aa  176  8e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0059  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.95 
 
 		 340 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1409  alcohol dehydrogenase  33.54 
 
 		 337 aa  173  3.9999999999999995e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0178  alcohol dehydrogenase  33.73 
 
 		 336 aa  171  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2180  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  32.82 
 
 		 327 aa  171  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4119  alcohol dehydrogenase  34.89 
 
 		 356 aa  169  7e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.362779  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2269  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.1 
 
 		 335 aa  169  7e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.992449  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0065  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.48 
 
 		 340 aa  169  7e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3303  zinc-binding dehydrogenase family protein  30.9 
 
 		 338 aa  168  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0731443 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3328  hypothetical protein  32.92 
 
 		 338 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.463233 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1044  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.33 
 
 		 335 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3320  hypothetical protein  31.97 
 
 		 338 aa  163  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.915678 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2056  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.91 
 
 		 342 aa  162  6e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1421  alcohol dehydrogenase  31.32 
 
 		 343 aa  162  9e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0887  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.73 
 
 		 362 aa  162  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0214815  normal  0.703076 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3244  hypothetical protein  31.66 
 
 		 338 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3425  hypothetical protein  31.66 
 
 		 338 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.955308  hitchhiker  0.00600667 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0155  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.63 
 
 		 338 aa  160  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.152307 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2713  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.77 
 
 		 333 aa  160  3e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0389  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.23 
 
 		 341 aa  160  3e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0154  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.24 
 
 		 339 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00186872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0475  alcohol dehydrogenase  31.07 
 
 		 345 aa  160  4e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2811  alcohol dehydrogenase  31.02 
 
 		 347 aa  159  6e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.133999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0021  Zn-binding dehydrogenase  30.29 
 
 		 352 aa  159  8e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0554419  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4898  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  31.12 
 
 		 340 aa  159  8e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07150  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  32.26 
 
 		 340 aa  159  8e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.439183  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2813  alcohol dehydrogenase  30.28 
 
 		 341 aa  159  8e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0594163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3550  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.16 
 
 		 362 aa  159  9e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4817  alcohol dehydrogenase  31.16 
 
 		 362 aa  159  9e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.562057  normal  0.226619 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5466  alcohol dehydrogenase  31.16 
 
 		 362 aa  159  9e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.763797  normal  0.0829425 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04235  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  31.49 
 
 		 340 aa  158  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.767219  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4590  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  31.49 
 
 		 340 aa  158  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00423136  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3639  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.49 
 
 		 340 aa  158  1e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4903  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  31.09 
 
 		 340 aa  158  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.363717  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04201  hypothetical protein  31.49 
 
 		 340 aa  158  1e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.774265  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4951  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  31.09 
 
 		 340 aa  158  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0102074  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3786  alcohol dehydrogenase  31.16 
 
 		 369 aa  157  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0107971 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2784  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.11 
 
 		 342 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.551512  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3769  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.35 
 
 		 341 aa  157  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.109016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2828  alcohol dehydrogenase  31.11 
 
 		 343 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.155527  normal  0.0877096 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3697  alcohol dehydrogenase  30.79 
 
 		 340 aa  157  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587402 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5128  zinc-binding dehydrogenase  33.04 
 
 		 337 aa  157  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5871  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  31.09 
 
 		 340 aa  156  4e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2739  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.15 
 
 		 337 aa  156  4e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.112956  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3998  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.58 
 
 		 333 aa  156  4e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.235514 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4706  alcohol dehydrogenase  32.19 
 
 		 341 aa  156  6e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4721  alcohol dehydrogenase  30.88 
 
 		 362 aa  155  7e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.36355 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4198  alcohol dehydrogenase  30.59 
 
 		 362 aa  155  9e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0201  L-threonine 3-dehydrogenase  32.37 
 
 		 342 aa  155  1e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1995  L-threonine 3-dehydrogenase  32.37 
 
 		 348 aa  155  1e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.271324  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3875  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.35 
 
 		 344 aa  155  1e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.177678  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0705  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  32.33 
 
 		 350 aa  154  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00256645  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0589  alcohol dehydrogenase  32.33 
 
 		 350 aa  154  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00429801  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0742  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.33 
 
 		 350 aa  154  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000731787  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2786  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  29.75 
 
 		 341 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4631  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  32.33 
 
 		 350 aa  154  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000566989  hitchhiker  0.000000000000161972 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2830  alcohol dehydrogenase  29.75 
 
 		 341 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.782331  normal  0.335133 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0585  zinc-containing alcohol dehydrogenase, long-chain  32.33 
 
 		 350 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0307293  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0584  zinc-containing alcohol dehydrogenase, long-chain  32.33 
 
 		 350 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0802  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  32.33 
 
 		 350 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000206272  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>