More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_0305 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_0310  alcohol dehydrogenase  88.55 
 
 
358 aa  657    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3714  alcohol dehydrogenase  88.83 
 
 
358 aa  660    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0557081 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0305  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
358 aa  735    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0851572 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000625  zinc-binding dehydrogenase  68.66 
 
 
352 aa  513  1e-144  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1877  alcohol dehydrogenase  38.69 
 
 
364 aa  258  1e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.115652 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4773  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.45 
 
 
338 aa  243  5e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5159  alcohol dehydrogenase  41.16 
 
 
338 aa  243  5e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.821329 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4859  alcohol dehydrogenase  41.45 
 
 
338 aa  243  5e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13758  dehydrogenase  36.6 
 
 
397 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0782561 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2276  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.39 
 
 
388 aa  224  3e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2325  alcohol dehydrogenase  33.51 
 
 
385 aa  219  6e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0569732  normal  0.0442784 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2286  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.51 
 
 
385 aa  219  6e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.775062  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2333  alcohol dehydrogenase  33.51 
 
 
385 aa  219  6e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.255092 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1008  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.38 
 
 
387 aa  217  2.9999999999999998e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5762  alcohol dehydrogenase  35.66 
 
 
386 aa  211  2e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.117069  normal  0.104571 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7154  alcohol dehydrogenase  31.55 
 
 
351 aa  174  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0462629  normal  0.0194652 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2235  alcohol dehydrogenase  33.15 
 
 
340 aa  149  8e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000256926  hitchhiker  0.0000000000711864 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0355  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.77 
 
 
350 aa  145  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03240  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  29.4 
 
 
358 aa  142  8e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000129511  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3324  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.34 
 
 
350 aa  139  7.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0421123  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3661  alcohol dehydrogenase  27.71 
 
 
340 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4159  alcohol dehydrogenase  29.14 
 
 
350 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.44287  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4034  alcohol dehydrogenase  31.34 
 
 
357 aa  132  7.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0388  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  27.76 
 
 
344 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00875101  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4980  alcohol dehydrogenase  29.24 
 
 
357 aa  132  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.155342 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3248  sorbitol dehydrogenase  26.57 
 
 
340 aa  130  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0582225  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4931  alcohol dehydrogenase  32.59 
 
 
337 aa  130  3e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4509  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.67 
 
 
343 aa  129  5.0000000000000004e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2793  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.92 
 
 
356 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630976  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0739  zinc-containing alcohol dehydrogenase; sorbitol dehydrogenase (L-iditol 2-dehydrogenase)  26.86 
 
 
340 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.725171  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4523  alcohol dehydrogenase  32.24 
 
 
365 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11719  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1795  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  28.89 
 
 
378 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.208532  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1325  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.23 
 
 
354 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.614702  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0364  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  29.17 
 
 
378 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00599  conserved hypothetical protein  27.87 
 
 
369 aa  128  2.0000000000000002e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.932146  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1810  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  29.17 
 
 
378 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1099  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  29.17 
 
 
378 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.488512  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2072  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  29.17 
 
 
378 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0808  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  29.17 
 
 
378 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1010  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.63 
 
 
340 aa  127  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0459  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  28.89 
 
 
378 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.479531  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5781  alcohol dehydrogenase  32.23 
 
 
354 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.110473  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22030  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  27.78 
 
 
375 aa  127  3e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.255526  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3845  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.23 
 
 
354 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.650761  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4416  alcohol dehydrogenase  31.11 
 
 
354 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0164512  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3492  hypothetical protein  29.25 
 
 
342 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835811  normal  0.583011 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0286  alcohol dehydrogenase  29.62 
 
 
337 aa  124  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.425659  normal  0.323725 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2055  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.17 
 
 
363 aa  124  4e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3953  alcohol dehydrogenase  30.83 
 
 
354 aa  123  5e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2567  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  29.36 
 
 
371 aa  123  6e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.134706  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0742  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  29.89 
 
 
350 aa  122  8e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000731787  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02158  alcohol dehydrogenase, zinc-containing (AFU_orthologue; AFUA_2G15930)  28.74 
 
 
353 aa  122  9e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.953823  normal  0.515496 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2180  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  29.05 
 
 
327 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2217  alcohol dehydrogenase  29.67 
 
 
357 aa  122  9.999999999999999e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7649  zinc-binding dehydrogenase  28.9 
 
 
357 aa  122  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.298467  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4389  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.25 
 
 
356 aa  122  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.189858  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4132  alcohol dehydrogenase  30.88 
 
 
364 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00103108  normal  0.177919 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0359  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  27.22 
 
 
366 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4631  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  28.89 
 
 
350 aa  120  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000566989  hitchhiker  0.000000000000161972 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0585  zinc-containing alcohol dehydrogenase, long-chain  28.45 
 
 
350 aa  120  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0307293  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0584  zinc-containing alcohol dehydrogenase, long-chain  28.45 
 
 
350 aa  120  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0705  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  28.89 
 
 
350 aa  120  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00256645  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0802  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  28.45 
 
 
350 aa  120  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000206272  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0589  alcohol dehydrogenase  29.17 
 
 
350 aa  120  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00429801  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0270  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.85 
 
 
336 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1258  alcohol dehydrogenase  26.78 
 
 
344 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0672332  normal  0.983976 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1690  threonine dehydrogenase or related Zn-dependent dehydrogenase  29.36 
 
 
339 aa  119  9e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0641  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  28.89 
 
 
350 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0299  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.09 
 
 
336 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0675  alcohol dehydrogenase  28.89 
 
 
350 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000371622  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2959  alcohol dehydrogenase  28.93 
 
 
373 aa  119  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0730  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  28.89 
 
 
350 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.35905e-47 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4724  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.65 
 
 
348 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.383474  normal  0.446449 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1874  GroES-related  29.06 
 
 
335 aa  117  3.9999999999999997e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.335289  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3288  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  26.94 
 
 
371 aa  116  6e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0951  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  26.94 
 
 
371 aa  116  6e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.286052  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3421  alcohol dehydrogenase  26.94 
 
 
371 aa  116  6e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.219023  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0597  alcohol dehydrogenase  28.53 
 
 
362 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0643205 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2683  alcohol dehydrogenase  30.03 
 
 
347 aa  116  6.9999999999999995e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.802614 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2554  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  27.81 
 
 
362 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2593  alcohol dehydrogenase  27.81 
 
 
362 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0149814  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2599  alcohol dehydrogenase  27.81 
 
 
362 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.139182  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09288  conserved hypothetical protein  27.12 
 
 
382 aa  115  1.0000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0293  L-threonine 3-dehydrogenase  30.35 
 
 
347 aa  115  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0591  alcohol dehydrogenase  28.8 
 
 
362 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4497  alcohol dehydrogenase  29.05 
 
 
373 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5133  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  29.3 
 
 
373 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5726  alcohol dehydrogenase  29.3 
 
 
373 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3903  alcohol dehydrogenase  29.75 
 
 
338 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10230  2,3-butanediol dehydrogenase  28.65 
 
 
363 aa  113  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.219159  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2976  alcohol dehydrogenase  29.48 
 
 
358 aa  113  6e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1029  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.7 
 
 
356 aa  113  6e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0432101  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01050  sorbitol dehydrogenase, putative  27.07 
 
 
379 aa  112  8.000000000000001e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.917438  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0552  2,3-butanediol dehydrogenase  28.53 
 
 
362 aa  112  9e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2958  L-threonine 3-dehydrogenase  26.11 
 
 
345 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.108215  normal  0.634974 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0503  alcohol dehydrogenase  26.98 
 
 
362 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472686 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0784  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.93 
 
 
353 aa  112  1.0000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3256  alcohol dehydrogenase  28.3 
 
 
345 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0472  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.15 
 
 
368 aa  111  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0619  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.89 
 
 
339 aa  110  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>