More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2683 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_2683  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
347 aa  710    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.802614 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1029  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.26 
 
 
356 aa  253  3e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0432101  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3616  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  41.07 
 
 
347 aa  249  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3448  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  41.07 
 
 
347 aa  249  7e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3519  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  40.75 
 
 
347 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0241  alcohol dehydrogenase  37.79 
 
 
347 aa  248  2e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3450  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  41.69 
 
 
347 aa  247  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0235  alcohol dehydrogenase  37.79 
 
 
347 aa  248  2e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3556  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  40.75 
 
 
347 aa  244  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3153  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.39 
 
 
351 aa  238  1e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02017  galactitol-1-phosphate dehydrogenase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  36.55 
 
 
346 aa  232  8.000000000000001e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1567  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.55 
 
 
346 aa  232  8.000000000000001e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0173762  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2379  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  36.55 
 
 
346 aa  232  8.000000000000001e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01983  hypothetical protein  36.55 
 
 
346 aa  232  8.000000000000001e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1556  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  36.55 
 
 
346 aa  232  8.000000000000001e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3070  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  36.55 
 
 
346 aa  232  8.000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.862081  hitchhiker  0.00000818535 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2227  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  36.26 
 
 
346 aa  231  2e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0973  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  36.55 
 
 
346 aa  230  3e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.465963 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1147  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  36.26 
 
 
346 aa  229  4e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1007  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.76 
 
 
348 aa  229  5e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.706693  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4595  hypothetical protein  33.63 
 
 
348 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1141  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  36.92 
 
 
347 aa  219  5e-56  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.261059  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4593  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  33.04 
 
 
346 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.675343  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1529  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.84 
 
 
369 aa  196  5.000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.237052  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3384  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.21 
 
 
345 aa  194  2e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000451542  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1805  alcohol dehydrogenase  36.47 
 
 
355 aa  190  4e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.657982  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14560  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  31.98 
 
 
352 aa  182  8.000000000000001e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0972559 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2008  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.39 
 
 
337 aa  170  4e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.590492  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0299  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.72 
 
 
336 aa  168  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0270  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.72 
 
 
336 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1933  putative dehydrogenase  30.35 
 
 
339 aa  162  8.000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.121666  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0803  putative dehydrogenase  29.48 
 
 
343 aa  162  9e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.506069  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4724  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.52 
 
 
348 aa  161  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.383474  normal  0.446449 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10900  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  35.29 
 
 
352 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.867442  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1037  putative dehydrogenase  28.45 
 
 
340 aa  159  5e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0173  alcohol dehydrogenase  32.66 
 
 
337 aa  159  7e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.976128  normal  0.272839 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3148  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.7 
 
 
373 aa  159  7e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2268  alcohol dehydrogenase  30.62 
 
 
358 aa  158  1e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.396502  hitchhiker  0.0088894 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0742  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  30.83 
 
 
350 aa  158  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000731787  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0589  alcohol dehydrogenase  31.11 
 
 
350 aa  157  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00429801  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1714  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.85 
 
 
352 aa  157  3e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0641  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  30.83 
 
 
350 aa  157  3e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0675  alcohol dehydrogenase  30.83 
 
 
350 aa  157  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000371622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0730  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  30.83 
 
 
350 aa  157  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.35905e-47 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0585  zinc-containing alcohol dehydrogenase, long-chain  30.83 
 
 
350 aa  157  4e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0307293  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0584  zinc-containing alcohol dehydrogenase, long-chain  30.83 
 
 
350 aa  157  4e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0802  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  30.83 
 
 
350 aa  157  4e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000206272  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28190  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  33.97 
 
 
345 aa  156  4e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0552  2,3-butanediol dehydrogenase  33.24 
 
 
362 aa  156  6e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4631  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  30.83 
 
 
350 aa  156  6e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000566989  hitchhiker  0.000000000000161972 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0705  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  30.83 
 
 
350 aa  156  6e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00256645  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0591  alcohol dehydrogenase  32.97 
 
 
362 aa  155  7e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2180  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  29.75 
 
 
327 aa  155  8e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2975  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.56 
 
 
340 aa  155  1e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0388433  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2189  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.79 
 
 
346 aa  155  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2055  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.44 
 
 
363 aa  154  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2565  L-threonine 3-dehydrogenase  31.93 
 
 
354 aa  154  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13100  L-threonine 3-dehydrogenase  30.17 
 
 
336 aa  154  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0597  alcohol dehydrogenase  32.97 
 
 
362 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0643205 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5131  putative dehydrogenase  29.89 
 
 
343 aa  153  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.869856  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4598  putative dehydrogenase  29.6 
 
 
343 aa  153  4e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.703201 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2002  putative dehydrogenase  30.17 
 
 
343 aa  153  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3492  hypothetical protein  34.58 
 
 
342 aa  153  5e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835811  normal  0.583011 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01549  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  29.48 
 
 
339 aa  152  7e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0963058  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0765  putative dehydrogenase  30.17 
 
 
343 aa  152  7e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0512  putative dehydrogenase  30.17 
 
 
343 aa  152  7e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345922  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01539  hypothetical protein  29.48 
 
 
339 aa  152  7e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.161589  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1649  putative dehydrogenase  30.17 
 
 
343 aa  152  7e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2097  putative dehydrogenase  30.17 
 
 
343 aa  152  7e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1787  putative dehydrogenase  29.48 
 
 
339 aa  152  7e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.496797  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0695  putative dehydrogenase  30.17 
 
 
343 aa  152  7e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.375651  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2050  putative dehydrogenase  29.19 
 
 
339 aa  152  8e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0249357  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0887  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.42 
 
 
362 aa  152  8e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0214815  normal  0.703076 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3786  alcohol dehydrogenase  31.4 
 
 
369 aa  152  8e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0107971 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2063  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.19 
 
 
339 aa  152  8.999999999999999e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00265684  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2056  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.49 
 
 
342 aa  152  8.999999999999999e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1620  putative dehydrogenase  29.19 
 
 
339 aa  151  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00863317  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0503  alcohol dehydrogenase  30.73 
 
 
362 aa  150  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472686 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0475  alcohol dehydrogenase  30.99 
 
 
345 aa  151  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0155  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.3 
 
 
338 aa  150  2e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.152307 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5133  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.7 
 
 
373 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5726  alcohol dehydrogenase  33.7 
 
 
373 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0584  putative dehydrogenase  29.89 
 
 
343 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.24761  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5304  alcohol dehydrogenase  33.42 
 
 
373 aa  150  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.183348  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4497  alcohol dehydrogenase  33.42 
 
 
373 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2793  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.86 
 
 
356 aa  149  7e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630976  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1269  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.9 
 
 
340 aa  149  7e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2269  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.09 
 
 
335 aa  149  7e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.992449  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2061  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  30.66 
 
 
339 aa  149  8e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3564  alcohol dehydrogenase  27.92 
 
 
347 aa  149  8e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.950821  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4509  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.94 
 
 
343 aa  149  9e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4721  alcohol dehydrogenase  31.13 
 
 
362 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.36355 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0038  alcohol dehydrogenase  30.81 
 
 
340 aa  149  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4198  alcohol dehydrogenase  31.4 
 
 
362 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3233  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.49 
 
 
365 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0470623  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2394  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.63 
 
 
341 aa  147  3e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1617  putative dehydrogenase  28.16 
 
 
339 aa  146  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2636  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.97 
 
 
340 aa  146  5e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108984  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4846  alcohol dehydrogenase  31.64 
 
 
346 aa  146  5e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.475925  normal  0.0130408 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1666  putative dehydrogenase  28.16 
 
 
339 aa  146  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.747821  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>