More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_1567 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_0973  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  98.27 
 
 		 346 aa  703    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.465963 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02017  galactitol-1-phosphate dehydrogenase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  100 
 
 		 346 aa  714    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1567  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  100 
 
 		 346 aa  714    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0173762  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2379  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  100 
 
 		 346 aa  714    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2227  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  99.71 
 
 		 346 aa  712    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1147  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  99.42 
 
 		 346 aa  709    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3070  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  100 
 
 		 346 aa  714    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.862081  hitchhiker  0.00000818535 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1556  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  100 
 
 		 346 aa  714    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01983  hypothetical protein  100 
 
 		 346 aa  714    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3616  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  68.9 
 
 		 347 aa  513  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3450  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  68.6 
 
 		 347 aa  508  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3519  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  68.31 
 
 		 347 aa  510  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3448  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  68.6 
 
 		 347 aa  511  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3556  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  68.31 
 
 		 347 aa  506  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1141  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  53.78 
 
 		 347 aa  387  1e-106  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.261059  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3384  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.88 
 
 		 345 aa  266  5e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000451542  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1007  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.46 
 
 		 348 aa  252  7e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.706693  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3153  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.89 
 
 		 351 aa  224  2e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2683  alcohol dehydrogenase  36.55 
 
 		 347 aa  224  2e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.802614 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14560  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  38.12 
 
 		 352 aa  219  5e-56  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0972559 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0235  alcohol dehydrogenase  36.77 
 
 		 347 aa  214  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0241  alcohol dehydrogenase  36.77 
 
 		 347 aa  214  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1029  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.02 
 
 		 356 aa  202  6e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0432101  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4593  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  33.23 
 
 		 346 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.675343  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4595  hypothetical protein  33.03 
 
 		 348 aa  186  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1529  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.85 
 
 		 369 aa  183  3e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.237052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1805  alcohol dehydrogenase  31.66 
 
 		 355 aa  160  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.657982  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0038  alcohol dehydrogenase  31.19 
 
 		 340 aa  154  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41760  2,3-butanediol dehydrogenase  31.98 
 
 		 360 aa  153  2.9999999999999998e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1269  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.23 
 
 		 340 aa  152  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1258  alcohol dehydrogenase  31.9 
 
 		 344 aa  152  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0672332  normal  0.983976 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5001  alcohol dehydrogenase  36.11 
 
 		 373 aa  152  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1037  putative dehydrogenase  31.44 
 
 		 340 aa  150  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2189  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.03 
 
 		 346 aa  150  3e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2061  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  30.5 
 
 		 339 aa  150  4e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.929745 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01743  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  29.55 
 
 		 347 aa  149  7e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.778779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1868  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.55 
 
 		 347 aa  149  7e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000261586  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01731  hypothetical protein  29.55 
 
 		 347 aa  149  7e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.948294  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4416  alcohol dehydrogenase  31.83 
 
 		 354 aa  149  7e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0164512  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6416  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.74 
 
 		 343 aa  149  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.124082  normal  0.304265 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0803  putative dehydrogenase  30.84 
 
 		 343 aa  149  8e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.506069  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3219  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.46 
 
 		 347 aa  149  9e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3953  alcohol dehydrogenase  31.83 
 
 		 354 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1998  sorbitol dehydrogenase  29.25 
 
 		 347 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.329256  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1417  sorbitol dehydrogenase  29.46 
 
 		 347 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1858  alcohol dehydrogenase  29.25 
 
 		 347 aa  147  3e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.368595  hitchhiker  0.0000214432 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1614  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.23 
 
 		 338 aa  147  3e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000216473  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4509  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.14 
 
 		 343 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5306  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.84 
 
 		 329 aa  145  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2975  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  29.87 
 
 		 340 aa  145  1e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0388433  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0597  alcohol dehydrogenase  30.29 
 
 		 362 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0643205 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2498  sorbitol dehydrogenase  28.96 
 
 		 347 aa  144  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.503095  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2636  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.63 
 
 		 340 aa  144  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108984  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1325  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.23 
 
 		 354 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.614702  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3492  hypothetical protein  31.72 
 
 		 342 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835811  normal  0.583011 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4132  alcohol dehydrogenase  31.68 
 
 		 364 aa  144  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00103108  normal  0.177919 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3845  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.23 
 
 		 354 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.650761  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10230  2,3-butanediol dehydrogenase  30.88 
 
 		 363 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.219159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5781  alcohol dehydrogenase  31.23 
 
 		 354 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.110473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4523  alcohol dehydrogenase  31.23 
 
 		 365 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2931  L-threonine 3-dehydrogenase  28.69 
 
 		 343 aa  144  3e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.217588  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0155  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.29 
 
 		 338 aa  144  3e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.152307 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0591  alcohol dehydrogenase  30.29 
 
 		 362 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0552  2,3-butanediol dehydrogenase  30.29 
 
 		 362 aa  143  5e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0934  2,3-butanediol dehydrogenase  30.88 
 
 		 363 aa  143  5e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1933  putative dehydrogenase  31.34 
 
 		 339 aa  143  5e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.121666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2059  sorbitol dehydrogenase  27.89 
 
 		 347 aa  142  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.642486  hitchhiker  0.0031409 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4724  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.09 
 
 		 348 aa  143  6e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.383474  normal  0.446449 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09064  hypothetical protein similar to xylitol dehydrogenase (Broad)  29.48 
 
 		 359 aa  141  9.999999999999999e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.715081 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2056  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.46 
 
 		 342 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5304  alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 		 373 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.183348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2008  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.53 
 
 		 337 aa  140  3e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.590492  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0330  2,3-butanediol dehydrogenase  31.12 
 
 		 355 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3148  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.08 
 
 		 373 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1620  putative dehydrogenase  31.83 
 
 		 339 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00863317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3564  alcohol dehydrogenase  30.48 
 
 		 347 aa  139  6e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.950821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2269  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.81 
 
 		 335 aa  139  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.992449  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2050  putative dehydrogenase  31.53 
 
 		 339 aa  138  1e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0249357  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01549  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  31.44 
 
 		 339 aa  138  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0963058  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2063  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.53 
 
 		 339 aa  137  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00265684  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1787  putative dehydrogenase  31.53 
 
 		 339 aa  137  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.496797  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01539  hypothetical protein  31.44 
 
 		 339 aa  138  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.161589  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01050  sorbitol dehydrogenase, putative  30.23 
 
 		 379 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.917438  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5133  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.31 
 
 		 373 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5726  alcohol dehydrogenase  31.31 
 
 		 373 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4846  alcohol dehydrogenase  30.29 
 
 		 346 aa  137  4e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.475925  normal  0.0130408 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1538  L-idonate 5-dehydrogenase  30.7 
 
 		 347 aa  136  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2180  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  30.28 
 
 		 327 aa  136  5e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3142  alcohol dehydrogenase  36.11 
 
 		 373 aa  136  5e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2394  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.24 
 
 		 341 aa  135  7.000000000000001e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0603  threonine dehydrogenase related Zn-dependent dehydrogenase  29.64 
 
 		 338 aa  135  9e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000710686  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0475  alcohol dehydrogenase  27.97 
 
 		 345 aa  134  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0270  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.27 
 
 		 336 aa  134  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3545  alcohol dehydrogenase  32.79 
 
 		 345 aa  134  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.715464  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3340  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.69 
 
 		 356 aa  133  3.9999999999999996e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4086  L-threonine 3-dehydrogenase  28.21 
 
 		 343 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4497  alcohol dehydrogenase  30.7 
 
 		 373 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1714  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.12 
 
 		 352 aa  133  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4721  alcohol dehydrogenase  29.38 
 
 		 362 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.36355 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13100  L-threonine 3-dehydrogenase  29.88 
 
 		 336 aa  133  5e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>