More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1529 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_1529  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  100 
 
 
369 aa  715    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.237052  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1805  alcohol dehydrogenase  58.43 
 
 
355 aa  405  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.657982  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1029  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.87 
 
 
356 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0432101  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4593  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  36.75 
 
 
346 aa  203  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.675343  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3153  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.1 
 
 
351 aa  199  7.999999999999999e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4595  hypothetical protein  36.49 
 
 
348 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3448  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  34.95 
 
 
347 aa  186  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3450  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  35.95 
 
 
347 aa  185  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0973  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  32.86 
 
 
346 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.465963 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3616  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  34.65 
 
 
347 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3519  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  34.65 
 
 
347 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02017  galactitol-1-phosphate dehydrogenase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  32.85 
 
 
346 aa  183  3e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1567  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.85 
 
 
346 aa  183  3e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0173762  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3070  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  32.85 
 
 
346 aa  183  3e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.862081  hitchhiker  0.00000818535 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01983  hypothetical protein  32.85 
 
 
346 aa  183  3e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1556  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  32.85 
 
 
346 aa  183  3e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2379  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  32.85 
 
 
346 aa  183  3e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2683  alcohol dehydrogenase  35.84 
 
 
347 aa  183  4.0000000000000006e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.802614 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1147  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  32.85 
 
 
346 aa  182  7e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3556  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  34.65 
 
 
347 aa  182  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2227  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  32.56 
 
 
346 aa  182  1e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1141  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  34.02 
 
 
347 aa  182  1e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.261059  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0235  alcohol dehydrogenase  32.09 
 
 
347 aa  177  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0241  alcohol dehydrogenase  32.09 
 
 
347 aa  177  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1007  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.14 
 
 
348 aa  170  3e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.706693  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14560  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  30.35 
 
 
352 aa  142  7e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0972559 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3384  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.3 
 
 
345 aa  139  7e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000451542  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3564  alcohol dehydrogenase  32.3 
 
 
347 aa  139  8.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.950821  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3998  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.72 
 
 
333 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.235514 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4724  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.43 
 
 
348 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.383474  normal  0.446449 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2008  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.63 
 
 
337 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.590492  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0797  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  27.93 
 
 
338 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.121673  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0178  alcohol dehydrogenase  32.34 
 
 
336 aa  127  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0475  alcohol dehydrogenase  29.33 
 
 
345 aa  127  4.0000000000000003e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1249  alcohol dehydrogenase  30.17 
 
 
335 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.257646  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4509  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.3 
 
 
343 aa  127  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1223  alcohol dehydrogenase  30.26 
 
 
335 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.135954  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5476  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.23 
 
 
335 aa  125  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.674809  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3661  alcohol dehydrogenase  27.54 
 
 
340 aa  125  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4119  alcohol dehydrogenase  27.61 
 
 
356 aa  124  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.362779  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3303  zinc-binding dehydrogenase family protein  28.8 
 
 
338 aa  124  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0731443 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3492  hypothetical protein  32 
 
 
342 aa  122  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835811  normal  0.583011 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1540  alcohol dehydrogenase  29.8 
 
 
336 aa  122  7e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.931266 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5447  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.84 
 
 
350 aa  122  8e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187392  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2070  alcohol dehydrogenase  30.18 
 
 
336 aa  122  8e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0739  zinc-containing alcohol dehydrogenase; sorbitol dehydrogenase (L-iditol 2-dehydrogenase)  26.67 
 
 
340 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.725171  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0565  alcohol dehydrogenase  31.34 
 
 
341 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.678248  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1644  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.34 
 
 
341 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.14571  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0660  alcohol dehydrogenase  31.34 
 
 
341 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1619  alcohol dehydrogenase  31.34 
 
 
341 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1670  alcohol dehydrogenase  31.34 
 
 
341 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2286  alcohol dehydrogenase  27.5 
 
 
344 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2235  alcohol dehydrogenase  31.34 
 
 
341 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3248  sorbitol dehydrogenase  27.14 
 
 
340 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0582225  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1614  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.65 
 
 
338 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000216473  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1010  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.38 
 
 
340 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5628  L-threonine 3-dehydrogenase  31.44 
 
 
341 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0490  alcohol dehydrogenase  31.44 
 
 
341 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.283915  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2451  alcohol dehydrogenase  33.53 
 
 
355 aa  120  3e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2636  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.05 
 
 
340 aa  120  3e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108984  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4159  alcohol dehydrogenase  35.04 
 
 
350 aa  120  3e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.44287  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4980  alcohol dehydrogenase  31.23 
 
 
357 aa  120  3.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.155342 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0472  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.61 
 
 
368 aa  120  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1258  alcohol dehydrogenase  30.27 
 
 
344 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0672332  normal  0.983976 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0154  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.72 
 
 
339 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00186872  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2269  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28 
 
 
335 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.992449  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2032  sorbitol dehydrogenase, putative  32.31 
 
 
350 aa  119  9.999999999999999e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000906358  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6089  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.68 
 
 
337 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3810  alcohol dehydrogenase  30.86 
 
 
348 aa  118  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0863215  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0065  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.64 
 
 
340 aa  119  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3340  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.87 
 
 
356 aa  118  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2436  alcohol dehydrogenase  32.59 
 
 
345 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3328  hypothetical protein  27.22 
 
 
338 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.463233 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0912  threonine dehydrogenase related Zn-dependent dehydrogenase  27.75 
 
 
349 aa  118  1.9999999999999998e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00151014  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0953  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.61 
 
 
336 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00776384  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5128  zinc-binding dehydrogenase  29.15 
 
 
337 aa  117  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0049  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.23 
 
 
350 aa  117  3e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02158  alcohol dehydrogenase, zinc-containing (AFU_orthologue; AFUA_2G15930)  28.65 
 
 
353 aa  116  5e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.953823  normal  0.515496 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1538  L-idonate 5-dehydrogenase  31.63 
 
 
347 aa  117  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03240  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  28.29 
 
 
358 aa  116  6.9999999999999995e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000129511  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6341  alcohol dehydrogenase  32.57 
 
 
336 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00479428  normal  0.719872 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0059  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.64 
 
 
340 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1530  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.92 
 
 
367 aa  115  7.999999999999999e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0540116  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6469  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.21 
 
 
345 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.940711  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6704  alcohol dehydrogenase  31.21 
 
 
345 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.710863  normal  0.158251 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0807  alcohol dehydrogenase  31.78 
 
 
346 aa  116  7.999999999999999e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0463124 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1421  alcohol dehydrogenase  30.86 
 
 
343 aa  115  8.999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1590  alcohol dehydrogenase  34.93 
 
 
342 aa  115  8.999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00466455  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1306  alcohol dehydrogenase  28.49 
 
 
348 aa  115  1.0000000000000001e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0357  zinc-dependent dehydrogenase  27.54 
 
 
349 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2235  alcohol dehydrogenase  29.23 
 
 
340 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000256926  hitchhiker  0.0000000000711864 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6310  alcohol dehydrogenase  30.92 
 
 
345 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.408904 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10900  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  32.24 
 
 
352 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.867442  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0556  alcohol dehydrogenase  30.34 
 
 
343 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.46957  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0638  alcohol dehydrogenase  30.34 
 
 
343 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.434534  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1668  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.34 
 
 
343 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1641  alcohol dehydrogenase  30.34 
 
 
343 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1692  alcohol dehydrogenase  30.34 
 
 
343 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0527  alcohol dehydrogenase  30.06 
 
 
343 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.361888  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5268  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.48 
 
 
346 aa  114  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>