More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A3616 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A3519  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  99.42 
 
 
347 aa  710    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3450  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  99.14 
 
 
347 aa  707    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3556  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  99.14 
 
 
347 aa  706    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3448  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  99.42 
 
 
347 aa  709    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3616  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  100 
 
 
347 aa  713    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0973  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  69.19 
 
 
346 aa  514  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.465963 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01983  hypothetical protein  68.9 
 
 
346 aa  513  1e-144  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02017  galactitol-1-phosphate dehydrogenase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  68.9 
 
 
346 aa  513  1e-144  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1567  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  68.9 
 
 
346 aa  513  1e-144  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0173762  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3070  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  68.9 
 
 
346 aa  513  1e-144  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.862081  hitchhiker  0.00000818535 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2227  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  68.6 
 
 
346 aa  511  1e-144  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2379  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  68.9 
 
 
346 aa  513  1e-144  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1556  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  68.9 
 
 
346 aa  513  1e-144  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1147  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  68.6 
 
 
346 aa  510  1e-143  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1141  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  56.94 
 
 
347 aa  422  1e-117  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.261059  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3384  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.8 
 
 
345 aa  293  3e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000451542  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1007  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.49 
 
 
348 aa  270  2.9999999999999997e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.706693  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2683  alcohol dehydrogenase  41.07 
 
 
347 aa  241  9e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.802614 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3153  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.25 
 
 
351 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1029  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.45 
 
 
356 aa  230  3e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0432101  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14560  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  41 
 
 
352 aa  229  4e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0972559 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0241  alcohol dehydrogenase  34.17 
 
 
347 aa  213  3.9999999999999995e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0235  alcohol dehydrogenase  34.17 
 
 
347 aa  213  3.9999999999999995e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4595  hypothetical protein  32.62 
 
 
348 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4593  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  31.97 
 
 
346 aa  185  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.675343  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1529  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.65 
 
 
369 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.237052  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1805  alcohol dehydrogenase  34.8 
 
 
355 aa  180  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.657982  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3492  hypothetical protein  34.81 
 
 
342 aa  175  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835811  normal  0.583011 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4509  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.93 
 
 
343 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4416  alcohol dehydrogenase  33.03 
 
 
354 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0164512  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3953  alcohol dehydrogenase  33.03 
 
 
354 aa  167  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6416  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.34 
 
 
343 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.124082  normal  0.304265 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1325  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.43 
 
 
354 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.614702  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41760  2,3-butanediol dehydrogenase  32.73 
 
 
360 aa  165  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5781  alcohol dehydrogenase  32.23 
 
 
354 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.110473  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3845  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.23 
 
 
354 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.650761  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1538  L-idonate 5-dehydrogenase  33.33 
 
 
347 aa  164  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4523  alcohol dehydrogenase  32.23 
 
 
365 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11719  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0038  alcohol dehydrogenase  30.15 
 
 
340 aa  162  7e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2189  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.9 
 
 
346 aa  161  1e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1258  alcohol dehydrogenase  32.56 
 
 
344 aa  160  3e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0672332  normal  0.983976 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10230  2,3-butanediol dehydrogenase  32.84 
 
 
363 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.219159  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2975  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  30.17 
 
 
340 aa  159  8e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0388433  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0591  alcohol dehydrogenase  31.87 
 
 
362 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0597  alcohol dehydrogenase  31.96 
 
 
362 aa  157  4e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0643205 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5306  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.1 
 
 
329 aa  156  6e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3661  alcohol dehydrogenase  31.84 
 
 
340 aa  155  7e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0803  putative dehydrogenase  31.25 
 
 
343 aa  154  1e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.506069  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0552  2,3-butanediol dehydrogenase  31.96 
 
 
362 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4132  alcohol dehydrogenase  32.84 
 
 
364 aa  155  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00103108  normal  0.177919 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0934  2,3-butanediol dehydrogenase  31.96 
 
 
363 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3248  sorbitol dehydrogenase  31.09 
 
 
340 aa  153  4e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0582225  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01050  sorbitol dehydrogenase, putative  29.89 
 
 
379 aa  153  5e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.917438  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13100  L-threonine 3-dehydrogenase  31.03 
 
 
336 aa  153  5e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0739  zinc-containing alcohol dehydrogenase; sorbitol dehydrogenase (L-iditol 2-dehydrogenase)  31.84 
 
 
340 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.725171  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1010  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.56 
 
 
340 aa  152  8e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1037  putative dehydrogenase  30.95 
 
 
340 aa  152  8.999999999999999e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00067  L-threonine 3-dehydrogenase  28.86 
 
 
341 aa  151  2e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86924  D-xylulose reductase (Xylitol dehydrogenase) (XDH)  30.23 
 
 
363 aa  151  2e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1714  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.17 
 
 
352 aa  150  3e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3793  L-threonine 3-dehydrogenase  27.97 
 
 
341 aa  150  4e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00257874  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5001  alcohol dehydrogenase  31.49 
 
 
373 aa  150  4e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01743  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  31.91 
 
 
347 aa  149  6e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.778779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1868  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.91 
 
 
347 aa  149  6e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000261586  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01731  hypothetical protein  31.91 
 
 
347 aa  149  6e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.948294  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4846  alcohol dehydrogenase  31.4 
 
 
346 aa  149  6e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.475925  normal  0.0130408 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2180  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  30.75 
 
 
327 aa  149  8e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1998  sorbitol dehydrogenase  31.91 
 
 
347 aa  149  8e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.329256  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3998  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.05 
 
 
333 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.235514 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1417  sorbitol dehydrogenase  31.61 
 
 
347 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1858  alcohol dehydrogenase  31.91 
 
 
347 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.368595  hitchhiker  0.0000214432 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1590  alcohol dehydrogenase  34.86 
 
 
342 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00466455  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4367  L-threonine 3-dehydrogenase  28.28 
 
 
343 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02666  sorbitol/xylitol dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02000)  32.19 
 
 
373 aa  147  3e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2436  alcohol dehydrogenase  30.7 
 
 
345 aa  147  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0330  2,3-butanediol dehydrogenase  29.61 
 
 
355 aa  147  3e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3148  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.4 
 
 
373 aa  147  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0944  L-idonate 5-dehydrogenase  30.92 
 
 
350 aa  147  3e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.272351  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2793  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.84 
 
 
356 aa  146  5e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630976  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2056  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.93 
 
 
342 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3545  alcohol dehydrogenase  33.63 
 
 
345 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.715464  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5447  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.61 
 
 
350 aa  145  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187392  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4086  L-threonine 3-dehydrogenase  27.98 
 
 
343 aa  145  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1713  zinc-type alcohol dehydrogenase  30.09 
 
 
341 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0444  L-threonine 3-dehydrogenase  29.59 
 
 
344 aa  145  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0732  L-iditol 2-dehydrogenase  31.2 
 
 
348 aa  145  1e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3901  L-threonine 3-dehydrogenase  27.33 
 
 
341 aa  145  1e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00409651  normal  0.55097 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3993  L-threonine 3-dehydrogenase  27.33 
 
 
341 aa  145  1e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00526956  normal  0.0228585 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4105  L-threonine 3-dehydrogenase  27.33 
 
 
341 aa  145  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287848  normal  0.406165 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0705  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  30 
 
 
350 aa  144  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00256645  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0641  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  30.17 
 
 
350 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2498  sorbitol dehydrogenase  31.31 
 
 
347 aa  144  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.503095  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3616  L-threonine 3-dehydrogenase  28.2 
 
 
342 aa  144  2e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00121447  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1794  zinc-type alcohol dehydrogenase  29.79 
 
 
341 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1654  zinc-type alcohol dehydrogenase  29.79 
 
 
341 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.959787  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3710  L-threonine 3-dehydrogenase  28.14 
 
 
341 aa  144  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.187743  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0730  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  30.17 
 
 
350 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.35905e-47 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2394  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30 
 
 
341 aa  144  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0233  L-threonine 3-dehydrogenase  29.64 
 
 
345 aa  144  2e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.43371 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3902  L-threonine 3-dehydrogenase  27.33 
 
 
341 aa  144  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00646337  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>