More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13758 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_13758  dehydrogenase  100 
 
 
397 aa  803    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0782561 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5762  alcohol dehydrogenase  64.45 
 
 
386 aa  495  1e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.117069  normal  0.104571 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2286  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  61.64 
 
 
385 aa  468  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.775062  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2333  alcohol dehydrogenase  61.64 
 
 
385 aa  468  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.255092 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2325  alcohol dehydrogenase  61.64 
 
 
385 aa  468  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0569732  normal  0.0442784 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2276  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  58.02 
 
 
388 aa  443  1e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1008  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  56.52 
 
 
387 aa  414  1e-114  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1877  alcohol dehydrogenase  46.17 
 
 
364 aa  331  1e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.115652 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0310  alcohol dehydrogenase  35.82 
 
 
358 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0305  alcohol dehydrogenase  36.6 
 
 
358 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0851572 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5159  alcohol dehydrogenase  40.05 
 
 
338 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.821329 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000625  zinc-binding dehydrogenase  36.06 
 
 
352 aa  234  2.0000000000000002e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4773  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40.05 
 
 
338 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3714  alcohol dehydrogenase  36.08 
 
 
358 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0557081 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4859  alcohol dehydrogenase  40.05 
 
 
338 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7154  alcohol dehydrogenase  34.97 
 
 
351 aa  186  5e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0462629  normal  0.0194652 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2235  alcohol dehydrogenase  29.89 
 
 
340 aa  156  7e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000256926  hitchhiker  0.0000000000711864 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0585  zinc-containing alcohol dehydrogenase, long-chain  28.89 
 
 
350 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0307293  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0584  zinc-containing alcohol dehydrogenase, long-chain  28.89 
 
 
350 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0705  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  28.64 
 
 
350 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00256645  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0802  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  28.89 
 
 
350 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000206272  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4631  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  28.64 
 
 
350 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000566989  hitchhiker  0.000000000000161972 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0742  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  28.89 
 
 
350 aa  131  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000731787  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0641  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  27.89 
 
 
350 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0589  alcohol dehydrogenase  28.89 
 
 
350 aa  130  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00429801  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0675  alcohol dehydrogenase  27.89 
 
 
350 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000371622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0730  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  27.89 
 
 
350 aa  130  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.35905e-47 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0355  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.14 
 
 
350 aa  130  6e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5133  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  29.88 
 
 
373 aa  123  7e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5726  alcohol dehydrogenase  29.88 
 
 
373 aa  123  7e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00599  conserved hypothetical protein  27.75 
 
 
369 aa  122  9.999999999999999e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.932146  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4497  alcohol dehydrogenase  31.16 
 
 
373 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09288  conserved hypothetical protein  27.52 
 
 
382 aa  121  1.9999999999999998e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3148  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  30.25 
 
 
373 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3324  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.89 
 
 
350 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0421123  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1010  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.09 
 
 
340 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5001  alcohol dehydrogenase  31.09 
 
 
373 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0597  alcohol dehydrogenase  29.16 
 
 
362 aa  119  7e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0643205 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0552  2,3-butanediol dehydrogenase  29.41 
 
 
362 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0591  alcohol dehydrogenase  29.16 
 
 
362 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0739  zinc-containing alcohol dehydrogenase; sorbitol dehydrogenase (L-iditol 2-dehydrogenase)  25.58 
 
 
340 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.725171  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5304  alcohol dehydrogenase  30.3 
 
 
373 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.183348  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3661  alcohol dehydrogenase  26.09 
 
 
340 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0330  2,3-butanediol dehydrogenase  29 
 
 
355 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0784  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.34 
 
 
353 aa  114  2.0000000000000002e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10230  2,3-butanediol dehydrogenase  29.16 
 
 
363 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.219159  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10900  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  28.12 
 
 
352 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.867442  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1874  GroES-related  27.54 
 
 
335 aa  112  8.000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.335289  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2959  alcohol dehydrogenase  27.37 
 
 
373 aa  110  4.0000000000000004e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1043  alcohol dehydrogenase  27.58 
 
 
353 aa  109  7.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0389  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.88 
 
 
341 aa  109  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4159  alcohol dehydrogenase  27.64 
 
 
350 aa  109  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.44287  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0934  2,3-butanediol dehydrogenase  28.06 
 
 
363 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0388  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  25.19 
 
 
344 aa  108  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00875101  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0049  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.07 
 
 
350 aa  107  4e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3248  sorbitol dehydrogenase  24.47 
 
 
340 aa  107  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0582225  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1000  putative alcohol dehydrogenase  27.86 
 
 
352 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1029  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  25.81 
 
 
356 aa  104  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0432101  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4389  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.68 
 
 
356 aa  105  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.189858  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02158  alcohol dehydrogenase, zinc-containing (AFU_orthologue; AFUA_2G15930)  26.67 
 
 
353 aa  104  3e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.953823  normal  0.515496 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1092  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.21 
 
 
351 aa  103  5e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0286  alcohol dehydrogenase  27.11 
 
 
337 aa  102  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.425659  normal  0.323725 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41760  2,3-butanediol dehydrogenase  28.61 
 
 
360 aa  102  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4132  alcohol dehydrogenase  28.57 
 
 
364 aa  102  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00103108  normal  0.177919 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0125  alcohol dehydrogenase  33.94 
 
 
350 aa  101  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0844378  normal  0.76692 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0880  alcohol dehydrogenase  29.12 
 
 
351 aa  101  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.173388  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5781  alcohol dehydrogenase  27.58 
 
 
354 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.110473  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0788  alcohol dehydrogenase  33.19 
 
 
349 aa  100  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.690483 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3845  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  27.58 
 
 
354 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.650761  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0233  alcohol dehydrogenase  25.95 
 
 
351 aa  100  5e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4523  alcohol dehydrogenase  27.58 
 
 
365 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11719  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0239  alcohol dehydrogenase  25.95 
 
 
351 aa  100  5e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3142  alcohol dehydrogenase  30.85 
 
 
373 aa  100  6e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1325  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  28.02 
 
 
354 aa  99.8  8e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.614702  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3230  alcohol dehydrogenase  37.79 
 
 
338 aa  98.2  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4094  alcohol dehydrogenase  27.83 
 
 
358 aa  98.2  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.958788  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0293  L-threonine 3-dehydrogenase  32.31 
 
 
347 aa  98.2  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4416  alcohol dehydrogenase  27.76 
 
 
354 aa  97.8  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0164512  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5030  zinc-binding dehydrogenase  28.11 
 
 
343 aa  97.8  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.959168  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3953  alcohol dehydrogenase  27.76 
 
 
354 aa  97.4  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2032  sorbitol dehydrogenase, putative  26.02 
 
 
350 aa  96.7  7e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000906358  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3625  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.03 
 
 
358 aa  96.7  7e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00723934  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07590  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  29.32 
 
 
357 aa  96.3  8e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1762  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  29.96 
 
 
355 aa  96.3  9e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0108342  hitchhiker  0.000113364 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1506  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  29.96 
 
 
408 aa  95.9  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000397792  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1610  alcohol dehydrogenase  29.96 
 
 
408 aa  95.9  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2647  dehydrogenase  24.74 
 
 
338 aa  95.5  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0114296  normal  0.147618 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0153  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.81 
 
 
323 aa  95.1  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.568823  normal  0.158485 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2069  alcohol dehydrogenase  27.18 
 
 
352 aa  94  4e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1590  alcohol dehydrogenase  28.77 
 
 
342 aa  93.6  5e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00466455  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3303  zinc-binding dehydrogenase family protein  30.17 
 
 
338 aa  93.6  6e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0731443 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0619  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  25.26 
 
 
339 aa  93.2  7e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0912  threonine dehydrogenase related Zn-dependent dehydrogenase  26.55 
 
 
349 aa  93.2  7e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00151014  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_74116  Sorbitol dehydrogenase  32.39 
 
 
378 aa  92.8  9e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.145167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3300  alcohol dehydrogenase  28.53 
 
 
337 aa  92.8  9e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0441476 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2554  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  30.31 
 
 
362 aa  92.8  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3492  hypothetical protein  26.74 
 
 
342 aa  92.4  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835811  normal  0.583011 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2593  alcohol dehydrogenase  30.31 
 
 
362 aa  92.8  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0149814  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2599  alcohol dehydrogenase  30.31 
 
 
362 aa  92.8  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.139182  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2380  alcohol dehydrogenase  27.62 
 
 
354 aa  92.4  1e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.209062 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>