More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2240 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2240  zinc-binding alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 355 aa  715    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0360217 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1833  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  71.75 
 
 		 354 aa  527  1e-149  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3460  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  69.77 
 
 		 354 aa  515  1.0000000000000001e-145  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00073426  hitchhiker  0.00463895 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4352  alcohol dehydrogenase  57.06 
 
 		 354 aa  415  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0435  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  58.86 
 
 		 351 aa  393  1e-108  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.692768  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0548  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  55.71 
 
 		 350 aa  376  1e-103  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0899798  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2188  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  56 
 
 		 349 aa  357  1.9999999999999998e-97  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.228893  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2137  alcohol dehydrogenase  50.28 
 
 		 351 aa  343  2.9999999999999997e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0423941 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07420  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  47.22 
 
 		 357 aa  325  8.000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5645  alcohol dehydrogenase  46.78 
 
 		 357 aa  323  4e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.419975 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1356  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  45.23 
 
 		 366 aa  320  3e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2064  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  47.06 
 
 		 357 aa  318  9e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3188  alcohol dehydrogenase  44.69 
 
 		 366 aa  317  2e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.182482  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2008  alcohol dehydrogenase protein  43.56 
 
 		 364 aa  310  2e-83  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0669  alcohol dehydrogenase  45.94 
 
 		 374 aa  310  2.9999999999999997e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.704397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3852  alcohol dehydrogenase  43.87 
 
 		 365 aa  309  5e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3514  alcohol dehydrogenase  45.82 
 
 		 373 aa  308  9e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0967  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.32 
 
 		 366 aa  305  8.000000000000001e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.635093  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1049  alcohol dehydrogenase  43.32 
 
 		 366 aa  305  8.000000000000001e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.050805 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0265  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.14 
 
 		 371 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.901967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2536  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.68 
 
 		 357 aa  303  4.0000000000000003e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.563542  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3346  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  45.94 
 
 		 357 aa  302  5.000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.62296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3465  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.05 
 
 		 366 aa  302  7.000000000000001e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.901244  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0203  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.35 
 
 		 357 aa  301  8.000000000000001e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0325811 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3032  alcohol dehydrogenase  44.26 
 
 		 357 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.289929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0653  alcohol dehydrogenase  45.61 
 
 		 352 aa  291  1e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1415  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.58 
 
 		 352 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.275014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2770  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.91 
 
 		 356 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.656616 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2344  alcohol dehydrogenase (NADP+)  44 
 
 		 352 aa  271  1e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.100089  normal  0.0840348 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1378  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.74 
 
 		 352 aa  254  2.0000000000000002e-66  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0764  hypothetical protein  42.09 
 
 		 357 aa  253  3e-66  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0197136 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1228  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.86 
 
 		 352 aa  245  8e-64  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.966969 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1399  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.6 
 
 		 352 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3075  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  41.25 
 
 		 347 aa  229  6e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0570  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.05 
 
 		 346 aa  224  2e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5564  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.21 
 
 		 346 aa  223  3e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.175264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4290  alcohol dehydrogenase  37.8 
 
 		 346 aa  218  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.590215 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5816  alcohol dehydrogenase  37.5 
 
 		 346 aa  216  5e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.136095 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1091  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  36.98 
 
 		 342 aa  216  5.9999999999999996e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3822  alcohol dehydrogenase  37.06 
 
 		 346 aa  215  8e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.529285 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5892  alcohol dehydrogenase  37.69 
 
 		 346 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.032769  normal  0.939128 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2366  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.1 
 
 		 347 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.0010665  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1860  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  36.9 
 
 		 346 aa  211  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2090  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.96 
 
 		 351 aa  209  7e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000167964 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0709  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  37.2 
 
 		 346 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.470076  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1234  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  37.2 
 
 		 346 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.61884  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1718  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  37.2 
 
 		 346 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2432  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  37.2 
 
 		 346 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1160  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  37.2 
 
 		 346 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0753  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  37.2 
 
 		 346 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.574599  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4901  alcohol dehydrogenase  36.36 
 
 		 360 aa  208  1e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1565  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  36.61 
 
 		 349 aa  207  3e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.965017  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0322  alcohol dehydrogenase  35.49 
 
 		 347 aa  206  7e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.65143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3657  alcohol dehydrogenase  36.61 
 
 		 347 aa  203  4e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.573189  normal  0.2926 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1221  alcohol dehydrogenase  35.23 
 
 		 343 aa  201  9.999999999999999e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4548  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.31 
 
 		 355 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00643704 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4415  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.31 
 
 		 345 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.742114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1928  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.81 
 
 		 370 aa  200  3e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3962  alcohol dehydrogenase  35 
 
 		 351 aa  200  3e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1827  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.88 
 
 		 345 aa  199  6e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0642635 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1073  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  35.51 
 
 		 351 aa  199  6e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1089  alcohol dehydrogenase  35.51 
 
 		 351 aa  199  6e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.25524  normal  0.164937 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2034  hypothetical protein  34.1 
 
 		 346 aa  197  2.0000000000000003e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4879  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.99 
 
 		 346 aa  195  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.539752  normal  0.655263 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1334  alcohol dehydrogenase  34.6 
 
 		 344 aa  194  1e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1727  zinc-binding dehydrogenase  35.67 
 
 		 352 aa  194  2e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0219  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.83 
 
 		 350 aa  192  8e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0194  zinc-dependent alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  35.12 
 
 		 345 aa  192  9e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0924  putative zinc-dependent alcohol dehydrogenase (oxidoreductase)  34.23 
 
 		 345 aa  191  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.175832  normal  0.685768 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1380  alcohol dehydrogenase  34.84 
 
 		 348 aa  188  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.378076  normal  0.439071 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4997  alcohol dehydrogenase  34.18 
 
 		 348 aa  187  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1619  alcohol dehydrogenase  33.6 
 
 		 384 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.682346 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3239  alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  35.59 
 
 		 356 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.901238  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1637  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  29.94 
 
 		 351 aa  183  5.0000000000000004e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000634163  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1100  alcohol dehydrogenase  38.71 
 
 		 299 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0318515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1713  alcohol dehydrogenase  35.21 
 
 		 343 aa  177  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.738221  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3120  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.4 
 
 		 410 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0553  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.98 
 
 		 382 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.81642  hitchhiker  0.000850612 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0010  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.06 
 
 		 346 aa  172  1e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.133832  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0592  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  41.41 
 
 		 401 aa  171  2e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1112  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36 
 
 		 351 aa  171  2e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.257407  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1142  alcohol dehydrogenase  31.92 
 
 		 417 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.517956  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1174  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.43 
 
 		 410 aa  168  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2760  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  31.92 
 
 		 425 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4753  alcohol dehydrogenase  39.3 
 
 		 402 aa  167  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.209038  normal  0.806258 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0041  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.03 
 
 		 405 aa  167  2e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.950338 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2916  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  31.92 
 
 		 492 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.843639  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1778  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.72 
 
 		 382 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.080092  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4200  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.9 
 
 		 385 aa  162  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0573  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31 
 
 		 389 aa  160  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2283  alcohol dehydrogenase  29.64 
 
 		 422 aa  158  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0243543  hitchhiker  0.000541864 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5047  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.08 
 
 		 385 aa  157  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557083  hitchhiker  0.00205277 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0215  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.87 
 
 		 346 aa  157  2e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0696766 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2540  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.11 
 
 		 384 aa  156  6e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.14774  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0475  alcohol dehydrogenase  31.1 
 
 		 345 aa  155  7e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2370  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.93 
 
 		 389 aa  155  7e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.456638  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1793  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.85 
 
 		 382 aa  155  9e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3148  putative alcohol dehydrogenase  30.73 
 
 		 415 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.559418  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4212  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.07 
 
 		 376 aa  154  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000750849  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5660  alcohol dehydrogenase  37.5 
 
 		 401 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>