More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3523 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_3523  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  100 
 
 
349 aa  701    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.538037  normal  0.114116 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5333  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  60.29 
 
 
345 aa  419  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0397204  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0948  putative L-idonate 5-dehydrogenase oxidoreductase protein  58.72 
 
 
344 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.593328 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3728  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  57.97 
 
 
352 aa  403  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.854934  normal  0.447633 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3340  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  56.47 
 
 
356 aa  402  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0642  alcohol dehydrogenase  57.68 
 
 
352 aa  401  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6416  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  54.81 
 
 
343 aa  402  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.124082  normal  0.304265 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0609  alcohol dehydrogenase  57.97 
 
 
352 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0295083  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0159  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  57.68 
 
 
347 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.306594  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5030  zinc-binding dehydrogenase  54.94 
 
 
343 aa  393  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.959168  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4509  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  53.35 
 
 
343 aa  394  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2124  L-idonate 5-dehydrogenase, NAD-binding  55.1 
 
 
343 aa  379  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.321081  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5671  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  51.9 
 
 
343 aa  350  3e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3621  alcohol dehydrogenase  53.03 
 
 
347 aa  349  3e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3685  alcohol dehydrogenase  48.65 
 
 
347 aa  323  3e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.112233 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4821  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  48.95 
 
 
344 aa  320  3e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111851  normal  0.477759 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4771  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  48.05 
 
 
344 aa  317  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.107599 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4094  alcohol dehydrogenase  46.24 
 
 
358 aa  312  5.999999999999999e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.958788  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1590  alcohol dehydrogenase  50.44 
 
 
342 aa  310  2.9999999999999997e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00466455  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2436  alcohol dehydrogenase  46.38 
 
 
345 aa  300  4e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5063  alcohol dehydrogenase  47.26 
 
 
347 aa  290  3e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.724577  normal  0.863659 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1915  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  48.99 
 
 
349 aa  289  6e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.482777  normal  0.264492 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4724  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.84 
 
 
348 aa  288  1e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.383474  normal  0.446449 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2879  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.95 
 
 
345 aa  285  1.0000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.268542  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3565  alcohol dehydrogenase  44.06 
 
 
345 aa  281  8.000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0221  L-idonate 5-dehydrogenase  42.41 
 
 
343 aa  263  4e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3287  L-idonate 5-dehydrogenase  43.35 
 
 
344 aa  261  2e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1538  L-idonate 5-dehydrogenase  41.57 
 
 
347 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4769  L-idonate 5-dehydrogenase  41.46 
 
 
343 aa  253  5.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0966138  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4869  L-idonate 5-dehydrogenase  41.46 
 
 
343 aa  252  9.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0951463 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4832  L-idonate 5-dehydrogenase  41.46 
 
 
343 aa  251  9.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4739  L-idonate 5-dehydrogenase  41.46 
 
 
343 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.130148 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4888  L-idonate 5-dehydrogenase  41.46 
 
 
343 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.138899  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4523  L-idonate 5-dehydrogenase  41.14 
 
 
343 aa  250  2e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0181227  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04133  L-idonate 5-dehydrogenase, NAD-binding  40.82 
 
 
343 aa  249  7e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3730  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.82 
 
 
343 aa  249  7e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04097  hypothetical protein  40.82 
 
 
343 aa  249  7e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4748  L-idonate 5-dehydrogenase  40.19 
 
 
343 aa  246  4e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0944  L-idonate 5-dehydrogenase  39.56 
 
 
350 aa  233  3e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.272351  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3545  alcohol dehydrogenase  40.46 
 
 
345 aa  222  8e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.715464  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0472  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.9 
 
 
368 aa  207  2e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1003  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.69 
 
 
342 aa  206  6e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.124693 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02400  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  40.11 
 
 
345 aa  204  1e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.242832  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2056  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.17 
 
 
342 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1714  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.8 
 
 
352 aa  200  3.9999999999999996e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2451  alcohol dehydrogenase  38.97 
 
 
355 aa  197  3e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28190  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  36.84 
 
 
345 aa  197  3e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2786  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  35.55 
 
 
341 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2830  alcohol dehydrogenase  35.55 
 
 
341 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.782331  normal  0.335133 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2793  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.71 
 
 
356 aa  196  6e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630976  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5057  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.65 
 
 
340 aa  195  9e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.73696  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2813  alcohol dehydrogenase  35.26 
 
 
341 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0594163  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3277  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.07 
 
 
345 aa  194  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2713  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.59 
 
 
333 aa  194  3e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3492  hypothetical protein  39.2 
 
 
342 aa  192  6e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835811  normal  0.583011 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2864  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  35.8 
 
 
359 aa  192  7e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0836  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.04 
 
 
347 aa  190  2.9999999999999997e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09064  hypothetical protein similar to xylitol dehydrogenase (Broad)  34.36 
 
 
359 aa  186  8e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.715081 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2013  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36 
 
 
344 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.238084  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21210  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  40.87 
 
 
336 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01050  sorbitol dehydrogenase, putative  33.33 
 
 
379 aa  178  1e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.917438  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2330  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.13 
 
 
352 aa  173  3.9999999999999995e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.752502  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01090  xylitol dehydrogenase, putative  35 
 
 
375 aa  173  5e-42  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0849  alcohol dehydrogenase  33.13 
 
 
344 aa  172  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0438742 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2131  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.28 
 
 
349 aa  172  1e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2609  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.81 
 
 
348 aa  172  1e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2189  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30 
 
 
346 aa  170  3e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0252  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.76 
 
 
347 aa  169  6e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10900  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  33.98 
 
 
352 aa  169  9e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.867442  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3580  hypothetical protein  35.37 
 
 
350 aa  166  4e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.885973 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1325  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.52 
 
 
354 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.614702  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0742  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  30.59 
 
 
350 aa  166  8e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000731787  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0585  zinc-containing alcohol dehydrogenase, long-chain  30.59 
 
 
350 aa  166  8e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0307293  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0584  zinc-containing alcohol dehydrogenase, long-chain  30.59 
 
 
350 aa  166  8e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0802  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  30.59 
 
 
350 aa  166  8e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000206272  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0705  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  30.59 
 
 
350 aa  165  9e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00256645  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4631  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  30.59 
 
 
350 aa  165  9e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000566989  hitchhiker  0.000000000000161972 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0589  alcohol dehydrogenase  30.59 
 
 
350 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00429801  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02580  sorbitol dehydrogenase, putative  29.82 
 
 
416 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0732  L-iditol 2-dehydrogenase  29.17 
 
 
348 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6746  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.83 
 
 
347 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.270529  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5781  alcohol dehydrogenase  33.24 
 
 
354 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.110473  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3845  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.24 
 
 
354 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.650761  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4289  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.09 
 
 
360 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.70382 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4523  alcohol dehydrogenase  33.24 
 
 
365 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11719  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3230  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.26 
 
 
346 aa  164  3e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.282549  normal  0.671349 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0730  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  30.31 
 
 
350 aa  163  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.35905e-47 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0641  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  30.31 
 
 
350 aa  163  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0675  alcohol dehydrogenase  30.31 
 
 
350 aa  163  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000371622  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4132  alcohol dehydrogenase  33.91 
 
 
364 aa  162  6e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00103108  normal  0.177919 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86924  D-xylulose reductase (Xylitol dehydrogenase) (XDH)  33.24 
 
 
363 aa  162  6e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1176  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  32.38 
 
 
344 aa  162  9e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0136787  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02960  L-arabinitol 4-dehydrogenase, putative  30.63 
 
 
392 aa  161  1e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0934  2,3-butanediol dehydrogenase  32.87 
 
 
363 aa  161  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1347  alcohol dehydrogenase  29.94 
 
 
343 aa  162  1e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.71457  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3068  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.38 
 
 
344 aa  161  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558038  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1000  putative alcohol dehydrogenase  33.98 
 
 
352 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10230  2,3-butanediol dehydrogenase  32.3 
 
 
363 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.219159  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0388  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  30.21 
 
 
344 aa  160  3e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00875101  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00100  L-arabinitol 4-dehydrogenase, putative  30.93 
 
 
392 aa  159  6e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.603371  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>