More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0577 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0577  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  100 
 
 		 342 aa  703    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.105265  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1421  alcohol dehydrogenase  53.39 
 
 		 343 aa  364  1e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4119  alcohol dehydrogenase  41.64 
 
 		 356 aa  283  2.0000000000000002e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.362779  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2739  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.59 
 
 		 337 aa  278  9e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.112956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5642  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.06 
 
 		 337 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.493922 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1260  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.29 
 
 		 339 aa  275  1.0000000000000001e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.785941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3317  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  41.94 
 
 		 338 aa  272  5.000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.621516  hitchhiker  0.0000240679 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1736  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  40.47 
 
 		 349 aa  270  2.9999999999999997e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0797  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  37.83 
 
 		 338 aa  268  1e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.121673  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0178  alcohol dehydrogenase  40.29 
 
 		 336 aa  254  2.0000000000000002e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5476  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.12 
 
 		 335 aa  248  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.674809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1223  alcohol dehydrogenase  39.17 
 
 		 335 aa  245  9e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.135954  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1249  alcohol dehydrogenase  39.17 
 
 		 335 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.257646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5128  zinc-binding dehydrogenase  39.18 
 
 		 337 aa  240  2.9999999999999997e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6310  alcohol dehydrogenase  39.24 
 
 		 345 aa  236  4e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.408904 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3230  alcohol dehydrogenase  39.12 
 
 		 338 aa  235  7e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6469  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  39.24 
 
 		 345 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.940711  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6704  alcohol dehydrogenase  39.24 
 
 		 345 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.710863  normal  0.158251 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0154  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.53 
 
 		 339 aa  233  5e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00186872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0148  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.64 
 
 		 338 aa  232  8.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0329198 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2070  alcohol dehydrogenase  35.96 
 
 		 336 aa  223  4e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1409  alcohol dehydrogenase  36.09 
 
 		 337 aa  220  3e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4903  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  36.73 
 
 		 340 aa  218  8.999999999999998e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.363717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4951  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  36.73 
 
 		 340 aa  218  8.999999999999998e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0102074  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04235  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  36.73 
 
 		 340 aa  218  1e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.767219  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3639  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.73 
 
 		 340 aa  218  1e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3697  alcohol dehydrogenase  36.73 
 
 		 340 aa  218  1e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587402 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5871  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  36.73 
 
 		 340 aa  218  1e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6341  alcohol dehydrogenase  36.71 
 
 		 336 aa  218  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00479428  normal  0.719872 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04201  hypothetical protein  36.73 
 
 		 340 aa  218  1e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.774265  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4590  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  36.73 
 
 		 340 aa  218  1e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00423136  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4898  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  37.22 
 
 		 340 aa  216  4e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1540  alcohol dehydrogenase  36.62 
 
 		 336 aa  214  9.999999999999999e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.931266 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0065  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.78 
 
 		 340 aa  215  9.999999999999999e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0059  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.78 
 
 		 340 aa  213  5.999999999999999e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0262  alcohol dehydrogenase  36.87 
 
 		 327 aa  210  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1608  putative Zn-dependent dehydrogenase  36.87 
 
 		 330 aa  210  3e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.587808  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3303  zinc-binding dehydrogenase family protein  33.33 
 
 		 338 aa  202  6e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0731443 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0286  alcohol dehydrogenase  35.88 
 
 		 330 aa  197  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3328  hypothetical protein  32.94 
 
 		 338 aa  192  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.463233 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4931  alcohol dehydrogenase  36.39 
 
 		 337 aa  191  1e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3320  hypothetical protein  33.53 
 
 		 338 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.915678 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3244  hypothetical protein  33.24 
 
 		 338 aa  186  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3425  hypothetical protein  33.24 
 
 		 338 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.955308  hitchhiker  0.00600667 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4706  alcohol dehydrogenase  33.75 
 
 		 341 aa  183  5.0000000000000004e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3903  alcohol dehydrogenase  35.22 
 
 		 338 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0021  Zn-binding dehydrogenase  32.02 
 
 		 352 aa  174  1.9999999999999998e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0554419  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2008  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.39 
 
 		 337 aa  172  5e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.590492  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07150  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  32.55 
 
 		 340 aa  171  1e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.439183  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2269  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.03 
 
 		 335 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.992449  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0038  alcohol dehydrogenase  33.23 
 
 		 340 aa  160  3e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1614  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.81 
 
 		 338 aa  154  1e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000216473  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0981  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.65 
 
 		 342 aa  152  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0389  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.7 
 
 		 341 aa  150  2e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1654  zinc-type alcohol dehydrogenase  29.78 
 
 		 341 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.959787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2002  putative dehydrogenase  30.03 
 
 		 343 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0765  putative dehydrogenase  30.03 
 
 		 343 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1794  zinc-type alcohol dehydrogenase  29.78 
 
 		 341 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0512  putative dehydrogenase  30.03 
 
 		 343 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345922  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1646  zinc-type alcohol dehydrogenase  29.78 
 
 		 341 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1628  zinc-type alcohol dehydrogenase  29.78 
 
 		 341 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2097  putative dehydrogenase  30.03 
 
 		 343 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1649  putative dehydrogenase  30.03 
 
 		 343 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1713  zinc-type alcohol dehydrogenase  29.87 
 
 		 341 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0695  putative dehydrogenase  30.03 
 
 		 343 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.375651  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0584  putative dehydrogenase  29.74 
 
 		 343 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.24761  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5131  putative dehydrogenase  30.03 
 
 		 343 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.869856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1044  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.2 
 
 		 335 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2636  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.57 
 
 		 340 aa  145  7.0000000000000006e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108984  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1787  putative dehydrogenase  29.6 
 
 		 339 aa  145  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.496797  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01549  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  29.23 
 
 		 339 aa  144  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0963058  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4106  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  31.82 
 
 		 336 aa  144  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.82135  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4598  putative dehydrogenase  29.74 
 
 		 343 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.703201 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01539  hypothetical protein  29.23 
 
 		 339 aa  144  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.161589  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0388  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  27.57 
 
 		 344 aa  144  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00875101  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2063  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.23 
 
 		 339 aa  144  3e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00265684  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4137  alcohol dehydrogenase  31.52 
 
 		 336 aa  143  3e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.31521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1620  putative dehydrogenase  29.86 
 
 		 339 aa  143  4e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00863317  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0803  putative dehydrogenase  29.89 
 
 		 343 aa  143  5e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.506069  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1608  putative dehydrogenase  29.24 
 
 		 339 aa  143  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2647  dehydrogenase  29.45 
 
 		 338 aa  142  7e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0114296  normal  0.147618 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4352  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  31.21 
 
 		 336 aa  142  8e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1676  putative dehydrogenase  29.24 
 
 		 339 aa  142  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1617  putative dehydrogenase  29.24 
 
 		 339 aa  142  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2551  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.1 
 
 		 341 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0163607  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2050  putative dehydrogenase  28.94 
 
 		 339 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0249357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1037  putative dehydrogenase  28.74 
 
 		 340 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3564  alcohol dehydrogenase  30.06 
 
 		 347 aa  140  3e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.950821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1933  putative dehydrogenase  29.36 
 
 		 339 aa  140  3e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.121666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2975  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  29.69 
 
 		 340 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0388433  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1666  putative dehydrogenase  28.95 
 
 		 339 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.747821  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3998  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.68 
 
 		 333 aa  138  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.235514 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3769  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.41 
 
 		 341 aa  137  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.109016  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1269  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.32 
 
 		 340 aa  135  8e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6309  alcohol dehydrogenase  30.99 
 
 		 337 aa  135  8e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.33332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0953  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.06 
 
 		 336 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00776384  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0173  alcohol dehydrogenase  31.27 
 
 		 337 aa  134  3e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.976128  normal  0.272839 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4846  alcohol dehydrogenase  28.53 
 
 		 346 aa  134  3e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.475925  normal  0.0130408 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0153  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.41 
 
 		 323 aa  132  6e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.568823  normal  0.158485 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1043  alcohol dehydrogenase  29.46 
 
 		 353 aa  132  6e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>