More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4454 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4454  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
345 aa  687    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.321717 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0807  alcohol dehydrogenase  86.05 
 
 
346 aa  590  1e-167  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0463124 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0173  alcohol dehydrogenase  43.4 
 
 
337 aa  272  7e-72  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.976128  normal  0.272839 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3010  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  42.4 
 
 
341 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6089  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  37.39 
 
 
337 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0771  alcohol dehydrogenase  34.49 
 
 
333 aa  202  5e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0619  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.86 
 
 
339 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0359  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.17 
 
 
329 aa  183  3e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.30751  normal  0.106797 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1400  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  37.61 
 
 
328 aa  181  2e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00260495 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3492  hypothetical protein  40.25 
 
 
342 aa  179  8e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835811  normal  0.583011 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28190  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  38.1 
 
 
345 aa  173  3.9999999999999995e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0388  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  29.32 
 
 
344 aa  172  6.999999999999999e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00875101  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4509  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.58 
 
 
343 aa  170  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2036  zinc-containing alcohol dehydrogenase  39.77 
 
 
327 aa  169  6e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.194095  normal  0.0749622 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0607  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  39.13 
 
 
324 aa  167  2e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.420026  normal  0.0271059 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2813  alcohol dehydrogenase  36.83 
 
 
341 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0594163  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2786  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  36.51 
 
 
341 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2830  alcohol dehydrogenase  36.51 
 
 
341 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.782331  normal  0.335133 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1714  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.26 
 
 
352 aa  167  4e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0389  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.89 
 
 
341 aa  166  5e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4724  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.26 
 
 
348 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.383474  normal  0.446449 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2330  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.43 
 
 
352 aa  165  1.0000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.752502  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0038  alcohol dehydrogenase  34.48 
 
 
340 aa  164  3e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0732  L-iditol 2-dehydrogenase  31.27 
 
 
348 aa  162  9e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0475  alcohol dehydrogenase  32.19 
 
 
345 aa  160  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2056  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.64 
 
 
342 aa  161  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2436  alcohol dehydrogenase  35.34 
 
 
345 aa  159  6e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1707  threonine dehydrogenase or related Zn-dependent dehydrogenase  31.21 
 
 
336 aa  158  1e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.508276  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2013  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.17 
 
 
344 aa  157  2e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.238084  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02580  sorbitol dehydrogenase, putative  29.54 
 
 
416 aa  155  1e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2189  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.99 
 
 
346 aa  155  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2180  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  32.69 
 
 
327 aa  155  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4523  alcohol dehydrogenase  33.42 
 
 
365 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11719  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09064  hypothetical protein similar to xylitol dehydrogenase (Broad)  31.45 
 
 
359 aa  154  2e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.715081 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1780  threonine dehydrogenase or related Zn-dependent dehydrogenase  30.37 
 
 
337 aa  154  2e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1258  alcohol dehydrogenase  36.6 
 
 
344 aa  154  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0672332  normal  0.983976 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5781  alcohol dehydrogenase  33.51 
 
 
354 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.110473  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4132  alcohol dehydrogenase  33.15 
 
 
364 aa  153  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00103108  normal  0.177919 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0742  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  30.84 
 
 
350 aa  153  4e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000731787  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0585  zinc-containing alcohol dehydrogenase, long-chain  30.84 
 
 
350 aa  153  4e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0307293  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0584  zinc-containing alcohol dehydrogenase, long-chain  30.84 
 
 
350 aa  153  4e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2879  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.76 
 
 
345 aa  153  4e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.268542  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0802  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  30.84 
 
 
350 aa  153  4e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000206272  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0705  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  30.84 
 
 
350 aa  153  5e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00256645  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0603  threonine dehydrogenase related Zn-dependent dehydrogenase  30.03 
 
 
338 aa  153  5e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000710686  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4631  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  30.84 
 
 
350 aa  153  5e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000566989  hitchhiker  0.000000000000161972 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02666  sorbitol/xylitol dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02000)  34.92 
 
 
373 aa  152  5.9999999999999996e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3845  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.51 
 
 
354 aa  152  7e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.650761  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2008  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.04 
 
 
337 aa  152  8e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.590492  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0589  alcohol dehydrogenase  30.84 
 
 
350 aa  152  8e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00429801  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2269  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.14 
 
 
335 aa  151  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.992449  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0641  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  30.53 
 
 
350 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1325  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.24 
 
 
354 aa  150  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.614702  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0675  alcohol dehydrogenase  30.53 
 
 
350 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000371622  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2975  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.24 
 
 
340 aa  150  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0388433  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3340  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.33 
 
 
356 aa  150  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0609  alcohol dehydrogenase  34.38 
 
 
352 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0295083  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0730  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  30.53 
 
 
350 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.35905e-47 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2740  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.33 
 
 
344 aa  150  3e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.120973 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4416  alcohol dehydrogenase  31.96 
 
 
354 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0164512  normal 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4159  alcohol dehydrogenase  32.49 
 
 
350 aa  150  4e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.44287  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0021  Zn-binding dehydrogenase  29.28 
 
 
352 aa  150  4e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0554419  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1654  zinc-type alcohol dehydrogenase  32.63 
 
 
341 aa  149  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.959787  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1794  zinc-type alcohol dehydrogenase  32.63 
 
 
341 aa  149  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1646  zinc-type alcohol dehydrogenase  32.63 
 
 
341 aa  149  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3953  alcohol dehydrogenase  31.68 
 
 
354 aa  149  7e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3728  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.1 
 
 
352 aa  149  8e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.854934  normal  0.447633 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3303  zinc-binding dehydrogenase family protein  31.61 
 
 
338 aa  149  9e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0731443 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10900  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  35.74 
 
 
352 aa  149  9e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.867442  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4187  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.53 
 
 
335 aa  149  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1455  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.19 
 
 
351 aa  147  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.124496 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2647  dehydrogenase  30.97 
 
 
338 aa  147  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0114296  normal  0.147618 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5133  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  35.91 
 
 
373 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0351  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  37.57 
 
 
357 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.798846  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4497  alcohol dehydrogenase  35.91 
 
 
373 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5726  alcohol dehydrogenase  35.91 
 
 
373 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3148  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.8 
 
 
373 aa  147  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0159  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.81 
 
 
347 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.306594  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0698  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.8 
 
 
349 aa  147  3e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0642  alcohol dehydrogenase  33.81 
 
 
352 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4479  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.53 
 
 
347 aa  146  4.0000000000000006e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.522798  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2119  dehydrogenase starvation-sensing protein  29.36 
 
 
340 aa  146  5e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2220  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.3 
 
 
343 aa  146  6e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.135715 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0330  2,3-butanediol dehydrogenase  30.52 
 
 
355 aa  146  6e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0944  L-idonate 5-dehydrogenase  32.83 
 
 
350 aa  146  6e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.272351  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0788  alcohol dehydrogenase  31.2 
 
 
349 aa  146  6e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.690483 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2124  L-idonate 5-dehydrogenase, NAD-binding  33.92 
 
 
343 aa  145  8.000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.321081  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1713  zinc-type alcohol dehydrogenase  32.5 
 
 
341 aa  145  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1628  zinc-type alcohol dehydrogenase  32.13 
 
 
341 aa  145  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1538  L-idonate 5-dehydrogenase  31.91 
 
 
347 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2565  L-threonine 3-dehydrogenase  34.03 
 
 
354 aa  144  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2811  alcohol dehydrogenase  35.02 
 
 
347 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.133999  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0934  2,3-butanediol dehydrogenase  31.78 
 
 
363 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1409  alcohol dehydrogenase  31.83 
 
 
337 aa  144  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3875  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.65 
 
 
344 aa  144  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.177678  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1029  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.32 
 
 
356 aa  144  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0432101  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5306  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.65 
 
 
329 aa  144  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09288  conserved hypothetical protein  30.09 
 
 
382 aa  144  3e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2784  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34.68 
 
 
342 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.551512  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2828  alcohol dehydrogenase  34.68 
 
 
343 aa  143  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.155527  normal  0.0877096 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>