More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1044 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007925  RPC_1044  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  100 
 
 
335 aa  674    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4106  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  70.57 
 
 
336 aa  481  1e-135  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.82135  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4137  alcohol dehydrogenase  70.27 
 
 
336 aa  481  1e-135  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.31521  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4352  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  69.67 
 
 
336 aa  476  1e-133  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0153  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.24 
 
 
323 aa  184  1.0000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.568823  normal  0.158485 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0388  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.52 
 
 
344 aa  173  2.9999999999999996e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00875101  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2063  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  39.4 
 
 
322 aa  172  1e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.860675 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1787  putative dehydrogenase  33.95 
 
 
339 aa  164  3e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.496797  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01549  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  33.64 
 
 
339 aa  164  3e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0963058  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01539  hypothetical protein  33.64 
 
 
339 aa  164  3e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.161589  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2063  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.33 
 
 
339 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00265684  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2050  putative dehydrogenase  33.33 
 
 
339 aa  163  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0249357  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1620  putative dehydrogenase  33.02 
 
 
339 aa  162  7e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00863317  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0038  alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
340 aa  162  9e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1037  putative dehydrogenase  32.09 
 
 
340 aa  162  9e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0803  putative dehydrogenase  32.09 
 
 
343 aa  162  1e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.506069  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4159  alcohol dehydrogenase  44.29 
 
 
350 aa  161  2e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.44287  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02158  alcohol dehydrogenase, zinc-containing (AFU_orthologue; AFUA_2G15930)  31.14 
 
 
353 aa  159  8e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.953823  normal  0.515496 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1608  putative dehydrogenase  33.12 
 
 
339 aa  156  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1617  putative dehydrogenase  33.12 
 
 
339 aa  157  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2811  alcohol dehydrogenase  34.82 
 
 
347 aa  156  4e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.133999  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2828  alcohol dehydrogenase  34.82 
 
 
343 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.155527  normal  0.0877096 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1676  putative dehydrogenase  33.12 
 
 
339 aa  156  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2784  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34.82 
 
 
342 aa  156  6e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.551512  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0981  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.54 
 
 
342 aa  154  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1666  putative dehydrogenase  32.81 
 
 
339 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.747821  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3010  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  36.43 
 
 
341 aa  154  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13100  L-threonine 3-dehydrogenase  28.26 
 
 
336 aa  150  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3998  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.36 
 
 
333 aa  149  9e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.235514 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3564  alcohol dehydrogenase  32.4 
 
 
347 aa  148  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.950821  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0389  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.54 
 
 
341 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4598  putative dehydrogenase  33.33 
 
 
343 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.703201 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0885  alcohol dehydrogenase  31.25 
 
 
333 aa  147  2.0000000000000003e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2061  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  34.06 
 
 
339 aa  147  3e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0577  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.2 
 
 
342 aa  147  4.0000000000000006e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.105265  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3903  alcohol dehydrogenase  33 
 
 
338 aa  145  6e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2551  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.48 
 
 
341 aa  146  6e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0163607  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5131  putative dehydrogenase  33.03 
 
 
343 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.869856  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09288  conserved hypothetical protein  31.52 
 
 
382 aa  145  1e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2180  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  31.75 
 
 
327 aa  145  1e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1933  putative dehydrogenase  30.94 
 
 
339 aa  145  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.121666  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1269  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.21 
 
 
340 aa  144  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0685  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.43 
 
 
338 aa  144  2e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1707  threonine dehydrogenase or related Zn-dependent dehydrogenase  30.62 
 
 
336 aa  143  3e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.508276  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10900  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  32.3 
 
 
352 aa  142  6e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.867442  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1823  alcohol dehydrogenase  32.12 
 
 
350 aa  142  8e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00496203  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1421  alcohol dehydrogenase  33.23 
 
 
343 aa  142  9e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0125  alcohol dehydrogenase  29.82 
 
 
350 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0844378  normal  0.76692 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2473  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.31 
 
 
344 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000066055  normal  0.0147407 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0173  alcohol dehydrogenase  31.38 
 
 
337 aa  141  1.9999999999999998e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.976128  normal  0.272839 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1644  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.77 
 
 
341 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.14571  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0565  alcohol dehydrogenase  34.77 
 
 
341 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.678248  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3769  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.47 
 
 
341 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.109016  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0299  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.65 
 
 
336 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0660  alcohol dehydrogenase  34.77 
 
 
341 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1670  alcohol dehydrogenase  34.77 
 
 
341 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0788  alcohol dehydrogenase  29.61 
 
 
349 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.690483 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1619  alcohol dehydrogenase  34.77 
 
 
341 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2235  alcohol dehydrogenase  34.77 
 
 
341 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0065  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.94 
 
 
340 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2647  dehydrogenase  32.7 
 
 
338 aa  140  3.9999999999999997e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0114296  normal  0.147618 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1794  alcohol dehydrogenase  30.82 
 
 
343 aa  140  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0373035  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5628  L-threonine 3-dehydrogenase  34.77 
 
 
341 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0490  alcohol dehydrogenase  34.77 
 
 
341 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.283915  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0584  putative dehydrogenase  31.06 
 
 
343 aa  139  6e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.24761  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2002  putative dehydrogenase  31.06 
 
 
343 aa  139  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0765  putative dehydrogenase  31.06 
 
 
343 aa  139  7e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0512  putative dehydrogenase  31.06 
 
 
343 aa  139  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345922  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2975  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  30.37 
 
 
340 aa  139  7e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0388433  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1649  putative dehydrogenase  31.06 
 
 
343 aa  139  7e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2119  dehydrogenase starvation-sensing protein  31.35 
 
 
340 aa  139  7e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0695  putative dehydrogenase  31.06 
 
 
343 aa  139  7e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.375651  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2097  putative dehydrogenase  31.06 
 
 
343 aa  139  7e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0355  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.55 
 
 
350 aa  138  1e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0330  2,3-butanediol dehydrogenase  29.97 
 
 
355 aa  138  1e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2636  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.43 
 
 
340 aa  138  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108984  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2008  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.44 
 
 
337 aa  137  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.590492  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0155  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.37 
 
 
338 aa  137  3.0000000000000003e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.152307 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1653  starvation sensing protein RspB  34.39 
 
 
288 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00258422  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0270  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.65 
 
 
336 aa  137  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0603  threonine dehydrogenase related Zn-dependent dehydrogenase  29.33 
 
 
338 aa  136  6.0000000000000005e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000710686  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0059  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.36 
 
 
340 aa  135  7.000000000000001e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0148  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.59 
 
 
338 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0329198 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1780  threonine dehydrogenase or related Zn-dependent dehydrogenase  30.1 
 
 
337 aa  135  9.999999999999999e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3697  alcohol dehydrogenase  30.61 
 
 
340 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587402 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4119  alcohol dehydrogenase  28.12 
 
 
356 aa  135  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.362779  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04201  hypothetical protein  30.09 
 
 
340 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.774265  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04235  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  30.09 
 
 
340 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.767219  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3639  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.09 
 
 
340 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4898  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  29.48 
 
 
340 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4951  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  30.3 
 
 
340 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0102074  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5871  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  30.3 
 
 
340 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5306  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.75 
 
 
329 aa  134  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1409  alcohol dehydrogenase  30 
 
 
337 aa  134  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4903  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  30.3 
 
 
340 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.363717  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4590  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  30.09 
 
 
340 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00423136  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0944  L-idonate 5-dehydrogenase  33.54 
 
 
350 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.272351  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3153  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.71 
 
 
351 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3324  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.45 
 
 
350 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0421123  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2189  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.48 
 
 
346 aa  133  3.9999999999999996e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>