More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0252 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A0252  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  100 
 
 
347 aa  699    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3068  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  63.16 
 
 
344 aa  414  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558038  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3230  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  61.22 
 
 
346 aa  411  1e-114  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.282549  normal  0.671349 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1176  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  62.9 
 
 
344 aa  412  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0136787  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5063  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  62.57 
 
 
344 aa  408  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.392538  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4382  alcohol dehydrogenase  62.57 
 
 
344 aa  408  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5797  alcohol dehydrogenase  62.57 
 
 
344 aa  408  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0202299  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1742  D-xylulose reductase  61.45 
 
 
344 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.247806  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6746  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  58.38 
 
 
347 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.270529  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1076  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  61.45 
 
 
344 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.444364  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0234  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  61.45 
 
 
344 aa  403  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1235  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  61.45 
 
 
344 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.355726  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2609  zinc-binding alcohol dehydrogenase  58.91 
 
 
348 aa  404  1e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16590  xylitol dehydrogenase, zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  59.94 
 
 
346 aa  404  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1653  putative D-xylulose reductase  61.45 
 
 
344 aa  403  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2341  alcohol dehydrogenase  57.02 
 
 
348 aa  401  1e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.231034 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0351  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  61.45 
 
 
344 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.773676  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0068  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  61.45 
 
 
344 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.493904  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20290  xylitol dehydrogeanse  59.65 
 
 
347 aa  399  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.92253  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0849  alcohol dehydrogenase  57.6 
 
 
344 aa  398  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0438742 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5833  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  56.94 
 
 
347 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.119386  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2286  alcohol dehydrogenase  54.39 
 
 
344 aa  394  1e-109  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6662  alcohol dehydrogenase  58.77 
 
 
344 aa  395  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.838814  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3810  alcohol dehydrogenase  54.09 
 
 
348 aa  394  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0863215  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2163  alcohol dehydrogenase  59.06 
 
 
345 aa  394  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0551  D-xylulose reductase  56.43 
 
 
347 aa  379  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3580  hypothetical protein  53.47 
 
 
350 aa  358  8e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.885973 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1700  threonine dehydrogenase  51.17 
 
 
346 aa  354  1e-96  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.333284  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15800  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  51.46 
 
 
343 aa  347  1e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.109123  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2189  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.49 
 
 
346 aa  249  6e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2013  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.26 
 
 
344 aa  243  5e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.238084  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2056  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  42.19 
 
 
342 aa  238  1e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3492  hypothetical protein  38.89 
 
 
342 aa  231  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835811  normal  0.583011 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1714  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.78 
 
 
352 aa  229  4e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.25929 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09064  hypothetical protein similar to xylitol dehydrogenase (Broad)  38.3 
 
 
359 aa  224  1e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.715081 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2864  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  41.34 
 
 
359 aa  225  1e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2713  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.25 
 
 
333 aa  224  2e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2330  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.37 
 
 
352 aa  221  9.999999999999999e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.752502  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0732  L-iditol 2-dehydrogenase  36.21 
 
 
348 aa  220  1.9999999999999999e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02880  L-iditol 2-dehydrogenase, putative  38.08 
 
 
400 aa  219  5e-56  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2793  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.5 
 
 
356 aa  218  8.999999999999998e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630976  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2059  sorbitol dehydrogenase  36.36 
 
 
347 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.642486  hitchhiker  0.0031409 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28190  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  38.79 
 
 
345 aa  216  5e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00100  L-arabinitol 4-dehydrogenase, putative  35.98 
 
 
392 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.603371  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02960  L-arabinitol 4-dehydrogenase, putative  36.28 
 
 
392 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01743  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  34.84 
 
 
347 aa  207  2e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.778779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1868  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.84 
 
 
347 aa  207  2e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000261586  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01731  hypothetical protein  34.84 
 
 
347 aa  207  2e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.948294  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1998  sorbitol dehydrogenase  34.84 
 
 
347 aa  207  2e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.329256  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1858  alcohol dehydrogenase  34.56 
 
 
347 aa  206  6e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.368595  hitchhiker  0.0000214432 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2498  sorbitol dehydrogenase  34.56 
 
 
347 aa  206  7e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.503095  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2445  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.81 
 
 
347 aa  202  5e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.682207  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1417  sorbitol dehydrogenase  33.99 
 
 
347 aa  202  5e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3219  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.9 
 
 
347 aa  202  9e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1455  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.8 
 
 
351 aa  200  3.9999999999999996e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.124496 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00942  hypothetical protein similar to L-arabitol dehydrogenase (Eurofung)  33.72 
 
 
386 aa  195  1e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2813  alcohol dehydrogenase  36.31 
 
 
341 aa  193  3e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0594163  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2786  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  36.31 
 
 
341 aa  193  4e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2830  alcohol dehydrogenase  36.31 
 
 
341 aa  193  4e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.782331  normal  0.335133 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08109  conserved hypothetical protein  36.36 
 
 
583 aa  192  5e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.401765  normal  0.665757 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86924  D-xylulose reductase (Xylitol dehydrogenase) (XDH)  33.33 
 
 
363 aa  191  1e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0948  putative L-idonate 5-dehydrogenase oxidoreductase protein  37.27 
 
 
344 aa  184  3e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.593328 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1590  alcohol dehydrogenase  36.31 
 
 
342 aa  181  2e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00466455  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02666  sorbitol/xylitol dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02000)  35.44 
 
 
373 aa  180  2.9999999999999997e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4509  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.05 
 
 
343 aa  179  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6416  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.05 
 
 
343 aa  177  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.124082  normal  0.304265 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3621  alcohol dehydrogenase  36.61 
 
 
347 aa  177  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01050  sorbitol dehydrogenase, putative  36.17 
 
 
379 aa  176  5e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.917438  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3545  alcohol dehydrogenase  37.18 
 
 
345 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.715464  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5671  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.96 
 
 
343 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3565  alcohol dehydrogenase  35.55 
 
 
345 aa  172  1e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2124  L-idonate 5-dehydrogenase, NAD-binding  36.62 
 
 
343 aa  170  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.321081  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04336  L-arabinitol 4-dehydrogenase (AFU_orthologue; AFUA_1G11020)  32.34 
 
 
427 aa  169  8e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2879  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.68 
 
 
345 aa  167  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.268542  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4509  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.58 
 
 
343 aa  166  4e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01090  xylitol dehydrogenase, putative  31.96 
 
 
375 aa  166  4e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0609  alcohol dehydrogenase  32.46 
 
 
352 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0295083  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5333  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.13 
 
 
345 aa  164  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0397204  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3728  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.35 
 
 
352 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.854934  normal  0.447633 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08552  alcohol dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01490)  35.87 
 
 
363 aa  164  3e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.580046 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0642  alcohol dehydrogenase  32.16 
 
 
352 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0159  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.12 
 
 
347 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.306594  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5001  alcohol dehydrogenase  34.34 
 
 
373 aa  162  6e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4980  alcohol dehydrogenase  34.46 
 
 
357 aa  162  6e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.155342 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3148  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.57 
 
 
373 aa  162  9e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00774  zinc-dependent alcohol dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14390)  31.2 
 
 
400 aa  160  2e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5030  zinc-binding dehydrogenase  32.21 
 
 
343 aa  159  6e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.959168  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0049  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.66 
 
 
350 aa  158  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5133  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.95 
 
 
373 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7649  zinc-binding dehydrogenase  31.83 
 
 
357 aa  159  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.298467  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4497  alcohol dehydrogenase  33.95 
 
 
373 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5726  alcohol dehydrogenase  33.95 
 
 
373 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4289  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.11 
 
 
360 aa  157  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.70382 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4132  alcohol dehydrogenase  33.52 
 
 
364 aa  157  4e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00103108  normal  0.177919 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02400  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  34.67 
 
 
345 aa  154  1e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.242832  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13100  L-threonine 3-dehydrogenase  30.12 
 
 
336 aa  155  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5304  alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
373 aa  154  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.183348  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2436  alcohol dehydrogenase  32.28 
 
 
345 aa  154  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4040  alcohol dehydrogenase  34.09 
 
 
356 aa  153  4e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.286744  normal  0.0364126 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0235  alcohol dehydrogenase  30.75 
 
 
347 aa  153  4e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>