More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_38005 on replicon NC_011682
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011682  PHATRDRAFT_38005  predicted protein  100 
 
 		 1005 aa  2081    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3514  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.61 
 
 		 345 aa  184  7e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.272765  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0522  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.5 
 
 		 338 aa  167  1.0000000000000001e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0876145  normal  0.61344 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1232  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.83 
 
 		 343 aa  158  6e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1999  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.73 
 
 		 336 aa  154  1e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.131571  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2577  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.64 
 
 		 342 aa  139  4e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0767  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.38 
 
 		 328 aa  122  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0795  dehydrogenase  28.71 
 
 		 340 aa  113  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4664  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.51 
 
 		 307 aa  110  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0202543  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2453  putative dehydrogenase  27.68 
 
 		 332 aa  109  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2316  alcohol dehydrogenase  30.27 
 
 		 334 aa  107  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.947925  normal  0.395379 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1679  dehydrogenase  32.4 
 
 		 360 aa  107  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.445125  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0642  dehydrogenase  27.66 
 
 		 342 aa  105  6e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2745  putative dehydrogenase  27.85 
 
 		 337 aa  102  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000542225  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0315  putative dehydrogenase  31.13 
 
 		 329 aa  101  7e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1178  putative dehydrogenase  28.52 
 
 		 325 aa  100  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1296  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.76 
 
 		 369 aa  98.6  5e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1078  putative dehydrogenase  30.1 
 
 		 343 aa  98.2  7e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1678  putative dehydrogenase  27.57 
 
 		 346 aa  97.4  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3598  putative dehydrogenase  30.71 
 
 		 337 aa  85.1  0.000000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.927271  hitchhiker  0.00450633 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2307  oxidoreductase domain-containing protein  23.99 
 
 		 715 aa  78.6  0.0000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1677  alcohol dehydrogenase  27.17 
 
 		 318 aa  77.4  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.966295 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0667  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.22 
 
 		 357 aa  77.4  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.559998 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1527  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  24.01 
 
 		 356 aa  75.9  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3331  alcohol dehydrogenase  25.56 
 
 		 719 aa  71.6  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.127059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2095  L-threonine 3-dehydrogenase  25.77 
 
 		 345 aa  70.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1862  L-threonine 3-dehydrogenase  24.93 
 
 		 345 aa  67.4  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.494321  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1783  L-threonine 3-dehydrogenase  25.21 
 
 		 345 aa  67.4  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.817669  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10900  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  29.08 
 
 		 352 aa  67  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.867442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2207  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  24 
 
 		 367 aa  66.6  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0588831  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2751  hypothetical protein  27.72 
 
 		 326 aa  65.5  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.794948  hitchhiker  0.00325802 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2076  L-threonine 3-dehydrogenase  24.58 
 
 		 342 aa  65.5  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0654334  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2564  hypothetical protein  27.38 
 
 		 326 aa  64.7  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.172199 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2797  L-threonine 3-dehydrogenase  28.05 
 
 		 343 aa  64.7  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.242425  normal  0.760351 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2661  L-threonine 3-dehydrogenase  25.71 
 
 		 346 aa  63.9  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1431  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.88 
 
 		 400 aa  63.9  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.115342  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1000  putative alcohol dehydrogenase  29.17 
 
 		 352 aa  63.5  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0355  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.57 
 
 		 350 aa  63.5  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2923  L-threonine 3-dehydrogenase  28 
 
 		 349 aa  63.2  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3324  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.02 
 
 		 350 aa  63.9  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0421123  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02345  hypothetical protein  25.68 
 
 		 713 aa  62.8  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.435396 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0388  oxidoreductase domain protein  24.5 
 
 		 721 aa  62.8  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.702394  normal  0.542029 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23420  putative zinc-binding dehydrogenase  24.79 
 
 		 722 aa  62.4  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123826  hitchhiker  0.00977209 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2931  L-threonine 3-dehydrogenase  25.14 
 
 		 343 aa  62  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.217588  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1123  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  24.82 
 
 		 353 aa  61.2  0.00000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05001  L-threonine 3-dehydrogenase  27.39 
 
 		 360 aa  61.2  0.00000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1132  alcohol dehydrogenase  24.48 
 
 		 353 aa  60.5  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2698  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  24.82 
 
 		 364 aa  60.8  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02437  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  24.82 
 
 		 353 aa  60.5  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4497  alcohol dehydrogenase  24.83 
 
 		 373 aa  60.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2697  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  24.48 
 
 		 364 aa  60.1  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3939  L-threonine 3-dehydrogenase  26.43 
 
 		 341 aa  60.1  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.27746  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0097  L-threonine 3-dehydrogenase  29.87 
 
 		 341 aa  60.5  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0317813  hitchhiker  0.00132916 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02401  hypothetical protein  24.82 
 
 		 353 aa  60.5  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3133  alcohol dehydrogenase  29.7 
 
 		 329 aa  59.7  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8852  L-threonine 3-dehydrogenase  25.75 
 
 		 342 aa  59.3  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5611  glycosyl transferase group 1  23.49 
 
 		 1079 aa  58.9  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.115035 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5133  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  24.83 
 
 		 373 aa  58.9  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5001  alcohol dehydrogenase  23.91 
 
 		 373 aa  58.5  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5726  alcohol dehydrogenase  24.83 
 
 		 373 aa  58.9  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0064  L-threonine 3-dehydrogenase  26.52 
 
 		 341 aa  58.5  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00353875  unclonable  0.000000014689 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1029  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  24.35 
 
 		 356 aa  58.5  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0432101  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001213  L-threonine 3-dehydrogenase  26.96 
 
 		 343 aa  58.5  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4673  L-threonine 3-dehydrogenase  27.71 
 
 		 341 aa  58.2  0.0000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2008  alcohol dehydrogenase protein  25.41 
 
 		 364 aa  58.5  0.0000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3901  L-threonine 3-dehydrogenase  27.71 
 
 		 341 aa  58.5  0.0000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00409651  normal  0.55097 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3993  L-threonine 3-dehydrogenase  27.71 
 
 		 341 aa  58.2  0.0000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00526956  normal  0.0228585 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4105  L-threonine 3-dehydrogenase  27.71 
 
 		 341 aa  58.5  0.0000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287848  normal  0.406165 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4341  L-threonine 3-dehydrogenase  27.27 
 
 		 341 aa  58.2  0.0000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.183698  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2272  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  26.85 
 
 		 374 aa  58.2  0.0000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4481  L-threonine 3-dehydrogenase  27.27 
 
 		 341 aa  57.8  0.0000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.155025  normal  0.0226787 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2700  L-threonine 3-dehydrogenase  25 
 
 		 345 aa  57.8  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4286  L-threonine 3-dehydrogenase  27.27 
 
 		 341 aa  57.8  0.0000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000588728 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0449  L-threonine 3-dehydrogenase  26.55 
 
 		 361 aa  58.2  0.0000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.333655 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2830  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  24.46 
 
 		 364 aa  57.8  0.0000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0808  alcohol dehydrogenase  25.34 
 
 		 712 aa  58.2  0.0000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0049  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.03 
 
 		 350 aa  57.8  0.0000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0057  L-threonine 3-dehydrogenase  27.27 
 
 		 341 aa  57.8  0.0000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0451496  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01301  hypothetical protein  25.48 
 
 		 350 aa  57.4  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1428  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  25.48 
 
 		 350 aa  57.4  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01290  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  25.48 
 
 		 350 aa  57.4  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2333  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  25.48 
 
 		 350 aa  57.4  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.541435  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3886  alcohol dehydrogenase  26.72 
 
 		 330 aa  57.4  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.025285  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2958  L-threonine 3-dehydrogenase  25 
 
 		 345 aa  57.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.108215  normal  0.634974 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3148  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.85 
 
 		 373 aa  57.4  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2312  alcohol dehydrogenase  25.48 
 
 		 350 aa  57.4  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5645  alcohol dehydrogenase  27.7 
 
 		 357 aa  57.8  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.419975 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0100  L-threonine 3-dehydrogenase  27.27 
 
 		 341 aa  57.8  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.173553 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1809  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  25.48 
 
 		 350 aa  57.8  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2064  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  31.31 
 
 		 357 aa  57.4  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1523  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  25.48 
 
 		 350 aa  57.4  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3902  L-threonine 3-dehydrogenase  27.27 
 
 		 341 aa  57.8  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00646337  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0089  L-threonine 3-dehydrogenase  27.39 
 
 		 341 aa  56.6  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2032  sorbitol dehydrogenase, putative  28.85 
 
 		 350 aa  56.6  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000906358  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0353  L-threonine 3-dehydrogenase  27.39 
 
 		 343 aa  57  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3794  zinc-binding alcohol dehydrogenase  27.27 
 
 		 719 aa  57  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0175  L-threonine 3-dehydrogenase  26.6 
 
 		 341 aa  57  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.348381  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0806  L-threonine 3-dehydrogenase  23.21 
 
 		 345 aa  55.8  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.384791  normal  0.0311544 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1958  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  24.84 
 
 		 350 aa  56.2  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.126859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2137  alcohol dehydrogenase  25 
 
 		 351 aa  55.8  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0423941 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>