272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2316 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_2316  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
334 aa  664    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.947925  normal  0.395379 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4664  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  62.16 
 
 
307 aa  311  9e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0202543  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1178  putative dehydrogenase  49.38 
 
 
325 aa  297  2e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2453  putative dehydrogenase  50.47 
 
 
332 aa  288  1e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0767  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  53.65 
 
 
328 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1678  putative dehydrogenase  52.92 
 
 
346 aa  277  2e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2745  putative dehydrogenase  50.16 
 
 
337 aa  273  3e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000542225  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0795  dehydrogenase  45.28 
 
 
340 aa  264  1e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0642  dehydrogenase  44.69 
 
 
342 aa  254  1.0000000000000001e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3598  putative dehydrogenase  49.84 
 
 
337 aa  252  6e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.927271  hitchhiker  0.00450633 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0315  putative dehydrogenase  47.63 
 
 
329 aa  248  2e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4783  alcohol dehydrogenase  61.94 
 
 
289 aa  247  2e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.230491 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1679  dehydrogenase  48.63 
 
 
360 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.445125  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1078  putative dehydrogenase  39.2 
 
 
343 aa  211  2e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2751  hypothetical protein  48.72 
 
 
326 aa  204  2e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.794948  hitchhiker  0.00325802 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2564  hypothetical protein  48.08 
 
 
326 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.172199 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1232  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.88 
 
 
343 aa  186  4e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1999  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.04 
 
 
336 aa  179  8e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.131571  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0522  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.61 
 
 
338 aa  178  1e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0876145  normal  0.61344 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3514  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.65 
 
 
345 aa  178  1e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.272765  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2577  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.14 
 
 
342 aa  173  5e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_38005  predicted protein  29.39 
 
 
1005 aa  117  1.9999999999999998e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2207  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.52 
 
 
367 aa  104  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0588831  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5611  glycosyl transferase group 1  28.98 
 
 
1079 aa  97.8  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.115035 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5686  glycosyl transferase group 1  28.16 
 
 
1080 aa  92.4  9e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1296  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.15 
 
 
369 aa  92  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23420  putative zinc-binding dehydrogenase  24.14 
 
 
722 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123826  hitchhiker  0.00977209 
 
 
-
 
NC_003296  RS02345  hypothetical protein  28.14 
 
 
713 aa  76.3  0.0000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.435396 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0667  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.19 
 
 
357 aa  71.6  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.559998 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4033  oxidoreductase domain protein  25.25 
 
 
699 aa  70.9  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0424149 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0808  alcohol dehydrogenase  24.27 
 
 
712 aa  68.9  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0388  oxidoreductase domain protein  25.72 
 
 
721 aa  67.4  0.0000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.702394  normal  0.542029 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3592  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.4 
 
 
347 aa  63.9  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.167683  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4931  alcohol dehydrogenase  29.72 
 
 
337 aa  64.3  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0992  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.27 
 
 
326 aa  61.2  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4677  alcohol dehydrogenase  29.95 
 
 
347 aa  60.5  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15095  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0108  alcohol dehydrogenase  28.31 
 
 
338 aa  60.1  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.476377  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3696  chlorophyll synthesis pathway, BchC  37.23 
 
 
312 aa  59.7  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.503769  hitchhiker  0.00324331 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2180  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  32.33 
 
 
327 aa  59.3  0.00000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3918  alcohol dehydrogenase  27.25 
 
 
364 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0508514  normal  0.13428 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2606  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  21.15 
 
 
308 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000263757 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1109  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  24.45 
 
 
318 aa  57.8  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1527  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  23.08 
 
 
356 aa  57  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3903  zinc-binding alcohol dehydrogenase  27.54 
 
 
364 aa  57  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3492  hypothetical protein  27.41 
 
 
342 aa  56.6  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835811  normal  0.583011 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3977  alcohol dehydrogenase  27.54 
 
 
364 aa  57  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2412  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  20.76 
 
 
308 aa  55.5  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0431733  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2588  alcohol dehydrogenase  20.76 
 
 
308 aa  55.5  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0343  alcohol dehydrogenase  30.91 
 
 
312 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472318 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1685  alcohol dehydrogenase  31.53 
 
 
724 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2561  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  21.51 
 
 
308 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3643  alcohol dehydrogenase  37.25 
 
 
347 aa  53.5  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.826426  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2713  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.49 
 
 
333 aa  53.5  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10900  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  35.42 
 
 
352 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.867442  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0521  putative Zn-containing dehydrogenase  33 
 
 
332 aa  53.1  0.000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4070  oxidoreductase domain protein  23.97 
 
 
734 aa  52.8  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1144  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  27.04 
 
 
323 aa  52.8  0.000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.129111 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3261  alcohol dehydrogenase  30 
 
 
327 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0255944 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3903  alcohol dehydrogenase  28.84 
 
 
338 aa  52.4  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1000  putative alcohol dehydrogenase  34.27 
 
 
352 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2173  alcohol dehydrogenase  33.16 
 
 
315 aa  52.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0299508  decreased coverage  0.00992206 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2604  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  21.01 
 
 
308 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000105247  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2498  sorbitol dehydrogenase  28.46 
 
 
347 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.503095  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6438  2-desacetyl-2-hydroxyethyl bacteriochlorophyllide A dehydrogenase  27.68 
 
 
313 aa  51.2  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3794  zinc-binding alcohol dehydrogenase  25.15 
 
 
719 aa  51.2  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0844  threonine dehydrogenase  31.69 
 
 
347 aa  52  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0614  alcohol dehydrogenase  23.46 
 
 
318 aa  51.6  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0116847  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2330  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.14 
 
 
352 aa  51.2  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.752502  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2331  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  22.85 
 
 
308 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.528911  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1958  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  27.88 
 
 
350 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.126859  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2072  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  26.81 
 
 
422 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.055624  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4187  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.95 
 
 
335 aa  51.2  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2432  alcohol dehydrogenase  27.91 
 
 
376 aa  50.8  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.193672 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1540  alcohol dehydrogenase  30 
 
 
336 aa  50.8  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.931266 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1677  alcohol dehydrogenase  26.36 
 
 
318 aa  50.8  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.966295 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0301  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  26.81 
 
 
430 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0487501  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2307  oxidoreductase domain-containing protein  22.67 
 
 
715 aa  51.2  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0860  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  26.81 
 
 
363 aa  50.4  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.183529  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1195  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  26.81 
 
 
353 aa  50.4  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.184304  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13100  L-threonine 3-dehydrogenase  25 
 
 
336 aa  50.4  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2451  alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
355 aa  50.4  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3331  alcohol dehydrogenase  24.29 
 
 
719 aa  50.8  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.127059  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1639  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  26.81 
 
 
363 aa  50.4  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.514454  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2642  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  22.47 
 
 
308 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00170598  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1911  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  26.81 
 
 
363 aa  50.1  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.197112  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1924  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  26.81 
 
 
363 aa  50.1  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2227  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  22.43 
 
 
346 aa  50.1  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3519  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  24.59 
 
 
347 aa  49.7  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3616  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  24.59 
 
 
347 aa  49.7  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0472  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.71 
 
 
368 aa  50.1  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2189  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  19.61 
 
 
346 aa  50.1  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3448  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  24.59 
 
 
347 aa  50.1  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3556  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  24.59 
 
 
347 aa  50.1  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0973  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  22.9 
 
 
346 aa  50.1  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.465963 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3450  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  24.59 
 
 
347 aa  50.1  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0732  L-iditol 2-dehydrogenase  23.92 
 
 
348 aa  49.7  0.00007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0633  alcohol dehydrogenase  21.75 
 
 
317 aa  49.7  0.00007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1567  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  22.43 
 
 
346 aa  49.7  0.00008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0173762  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1428  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  27.4 
 
 
350 aa  49.7  0.00008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1523  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  27.4 
 
 
350 aa  49.7  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>