145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4783 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4783  alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 289 aa  557  1e-158  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.230491 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4664  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  76.66 
 
 		 307 aa  391  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0202543  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2316  alcohol dehydrogenase  61.94 
 
 		 334 aa  295  4e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.947925  normal  0.395379 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2453  putative dehydrogenase  53.77 
 
 		 332 aa  277  1e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1178  putative dehydrogenase  53.47 
 
 		 325 aa  269  4e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1678  putative dehydrogenase  52.08 
 
 		 346 aa  250  2e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0767  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  52.92 
 
 		 328 aa  248  1e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2745  putative dehydrogenase  50 
 
 		 337 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000542225  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0795  dehydrogenase  45.33 
 
 		 340 aa  234  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0642  dehydrogenase  45.27 
 
 		 342 aa  229  5e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1679  dehydrogenase  51.54 
 
 		 360 aa  224  9e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.445125  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3598  putative dehydrogenase  52.96 
 
 		 337 aa  224  1e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.927271  hitchhiker  0.00450633 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0315  putative dehydrogenase  49.65 
 
 		 329 aa  218  6e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1078  putative dehydrogenase  41.03 
 
 		 343 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2564  hypothetical protein  50.87 
 
 		 326 aa  192  5e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.172199 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2751  hypothetical protein  51.39 
 
 		 326 aa  186  3e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.794948  hitchhiker  0.00325802 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0522  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.54 
 
 		 338 aa  146  4.0000000000000006e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0876145  normal  0.61344 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1999  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.38 
 
 		 336 aa  146  5e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.131571  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1232  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.79 
 
 		 343 aa  139  7e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3514  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.77 
 
 		 345 aa  128  9.000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.272765  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2577  zinc-binding alcohol dehydrogenase  38.3 
 
 		 342 aa  126  5e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_38005  predicted protein  28.62 
 
 		 1005 aa  103  3e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5611  glycosyl transferase group 1  30.48 
 
 		 1079 aa  93.2  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.115035 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2207  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.84 
 
 		 367 aa  75.1  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0588831  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5686  glycosyl transferase group 1  26.89 
 
 		 1080 aa  67.8  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1296  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.46 
 
 		 369 aa  62.4  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0667  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.66 
 
 		 357 aa  57.4  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.559998 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0614  alcohol dehydrogenase  27.81 
 
 		 318 aa  58.2  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0116847  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02345  hypothetical protein  24.11 
 
 		 713 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.435396 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4070  oxidoreductase domain protein  25.08 
 
 		 734 aa  56.2  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0343  alcohol dehydrogenase  32.28 
 
 		 312 aa  55.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00472318 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3044  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.91 
 
 		 338 aa  53.9  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.165067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3643  alcohol dehydrogenase  36.43 
 
 		 347 aa  53.5  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.826426  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0633  alcohol dehydrogenase  25.83 
 
 		 317 aa  53.5  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3696  chlorophyll synthesis pathway, BchC  34.55 
 
 		 312 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.503769  hitchhiker  0.00324331 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0388  oxidoreductase domain protein  23.62 
 
 		 721 aa  52.4  0.000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.702394  normal  0.542029 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0770  alcohol dehydrogenase  39.1 
 
 		 321 aa  52  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00613196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0270  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28 
 
 		 336 aa  51.6  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2330  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.19 
 
 		 352 aa  51.6  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.752502  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3153  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  23.29 
 
 		 351 aa  51.6  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4187  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.04 
 
 		 335 aa  50.1  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1654  zinc-type alcohol dehydrogenase  26.36 
 
 		 341 aa  50.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.959787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1794  zinc-type alcohol dehydrogenase  26.36 
 
 		 341 aa  50.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1713  zinc-type alcohol dehydrogenase  26.36 
 
 		 341 aa  49.7  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1646  zinc-type alcohol dehydrogenase  26.36 
 
 		 341 aa  50.1  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1628  zinc-type alcohol dehydrogenase  26.36 
 
 		 341 aa  50.1  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2830  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  28.48 
 
 		 364 aa  49.7  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02437  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  28.48 
 
 		 353 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1123  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.48 
 
 		 353 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3128  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.93 
 
 		 328 aa  48.9  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1685  alcohol dehydrogenase  27.45 
 
 		 724 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0808  alcohol dehydrogenase  20.82 
 
 		 712 aa  48.5  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02401  hypothetical protein  28.48 
 
 		 353 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2697  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  28.48 
 
 		 364 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3592  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.45 
 
 		 347 aa  48.5  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.167683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1132  alcohol dehydrogenase  28.48 
 
 		 353 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2698  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  28.48 
 
 		 364 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2180  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  35.4 
 
 		 327 aa  48.1  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23420  putative zinc-binding dehydrogenase  23.51 
 
 		 722 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123826  hitchhiker  0.00977209 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3921  alcohol dehydrogenase  35.83 
 
 		 317 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1258  alcohol dehydrogenase  26.99 
 
 		 344 aa  48.1  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0672332  normal  0.983976 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2227  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  23.91 
 
 		 346 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4677  alcohol dehydrogenase  37.24 
 
 		 347 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0389  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  22.86 
 
 		 341 aa  48.1  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1527  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  24.15 
 
 		 356 aa  47.4  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4033  oxidoreductase domain protein  25.18 
 
 		 699 aa  47.4  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0424149 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4226  alcohol dehydrogenase  28.05 
 
 		 352 aa  47.4  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1147  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  23.91 
 
 		 346 aa  47.4  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4609  putative dehydrogenase  38.17 
 
 		 337 aa  47.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.377103  normal  0.118781 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2331  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  21.69 
 
 		 308 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.528911  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0521  putative Zn-containing dehydrogenase  30.17 
 
 		 332 aa  47  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2713  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.35 
 
 		 333 aa  46.6  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02017  galactitol-1-phosphate dehydrogenase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  23.91 
 
 		 346 aa  46.6  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1567  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  23.91 
 
 		 346 aa  46.6  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0173762  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3492  hypothetical protein  28.73 
 
 		 342 aa  46.6  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835811  normal  0.583011 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1062  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.06 
 
 		 319 aa  46.6  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0715122  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2379  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  23.91 
 
 		 346 aa  46.6  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1556  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  23.91 
 
 		 346 aa  46.6  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3070  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  23.91 
 
 		 346 aa  46.6  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.862081  hitchhiker  0.00000818535 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01983  hypothetical protein  23.91 
 
 		 346 aa  46.6  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0299  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  25.11 
 
 		 336 aa  46.2  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0087  alcohol dehydrogenase  35.03 
 
 		 325 aa  46.2  0.0006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0992  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.5 
 
 		 326 aa  46.2  0.0006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0429  alcohol dehydrogenase  38.32 
 
 		 336 aa  46.2  0.0007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0511556  normal  0.882763 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1190  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.06 
 
 		 319 aa  45.8  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.842933  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1121  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.06 
 
 		 319 aa  45.8  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00941244  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2604  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  20.61 
 
 		 308 aa  45.8  0.0009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000105247  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2436  alcohol dehydrogenase  30.51 
 
 		 345 aa  45.8  0.0009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3903  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.45 
 
 		 364 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3331  alcohol dehydrogenase  25.45 
 
 		 719 aa  45.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.127059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3977  alcohol dehydrogenase  35.45 
 
 		 364 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2173  alcohol dehydrogenase  29.74 
 
 		 315 aa  45.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0299508  decreased coverage  0.00992206 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3918  alcohol dehydrogenase  35.45 
 
 		 364 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0508514  normal  0.13428 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1970  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.51 
 
 		 341 aa  45.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2432  alcohol dehydrogenase  28.88 
 
 		 376 aa  45.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.193672 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1540  alcohol dehydrogenase  32.11 
 
 		 336 aa  45.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.931266 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0973  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  23.91 
 
 		 346 aa  45.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.465963 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2851  chlorophyll synthesis pathway, BchC  30.93 
 
 		 312 aa  45.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.754242 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3556  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  23.19 
 
 		 347 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3448  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  23.19 
 
 		 347 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>