175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3903 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3903  zinc-binding alcohol dehydrogenase  100 
 
 
364 aa  723    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3977  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
364 aa  723    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3918  alcohol dehydrogenase  99.18 
 
 
364 aa  717    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0508514  normal  0.13428 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5611  glycosyl transferase group 1  48.4 
 
 
1079 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.115035 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2207  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  55.35 
 
 
367 aa  305  6e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0588831  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5686  glycosyl transferase group 1  48.97 
 
 
1080 aa  300  3e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0667  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.06 
 
 
357 aa  132  6.999999999999999e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.559998 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0767  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.87 
 
 
328 aa  86.7  6e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2316  alcohol dehydrogenase  30.38 
 
 
334 aa  82.8  0.000000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.947925  normal  0.395379 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1232  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.49 
 
 
343 aa  82  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1999  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.87 
 
 
336 aa  76.6  0.0000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.131571  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1678  putative dehydrogenase  29.37 
 
 
346 aa  75.1  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2745  putative dehydrogenase  30.15 
 
 
337 aa  74.7  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000542225  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2577  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.14 
 
 
342 aa  73.2  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2453  putative dehydrogenase  26.58 
 
 
332 aa  70.9  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0522  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.35 
 
 
338 aa  69.3  0.00000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0876145  normal  0.61344 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1178  putative dehydrogenase  26.52 
 
 
325 aa  68.9  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_38005  predicted protein  25.68 
 
 
1005 aa  68.9  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1296  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.7 
 
 
369 aa  67.8  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0642  dehydrogenase  26.97 
 
 
342 aa  67  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1527  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  24.19 
 
 
356 aa  67  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1679  dehydrogenase  26.84 
 
 
360 aa  66.2  0.0000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.445125  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0795  dehydrogenase  28.83 
 
 
340 aa  65.1  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0315  putative dehydrogenase  31.13 
 
 
329 aa  64.7  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3514  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.65 
 
 
345 aa  59.3  0.00000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.272765  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1308  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.11 
 
 
353 aa  58.9  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.277534  normal  0.0550571 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0357  zinc-dependent dehydrogenase  34.29 
 
 
349 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41760  2,3-butanediol dehydrogenase  32.09 
 
 
360 aa  57.8  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1325  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.03 
 
 
354 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.614702  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5781  alcohol dehydrogenase  32.76 
 
 
354 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.110473  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3953  alcohol dehydrogenase  32.76 
 
 
354 aa  57  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4523  alcohol dehydrogenase  31.9 
 
 
365 aa  57  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11719  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4416  alcohol dehydrogenase  32.76 
 
 
354 aa  57  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0164512  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1258  alcohol dehydrogenase  37.96 
 
 
344 aa  57  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0672332  normal  0.983976 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3845  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.9 
 
 
354 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.650761  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2063  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  35.57 
 
 
322 aa  56.6  0.0000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.860675 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0597  alcohol dehydrogenase  33.64 
 
 
362 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0643205 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01290  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  31.25 
 
 
350 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2333  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.25 
 
 
350 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.541435  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01301  hypothetical protein  31.25 
 
 
350 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1428  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  31.25 
 
 
350 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1523  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  31.25 
 
 
350 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0153  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.41 
 
 
323 aa  55.5  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.568823  normal  0.158485 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2312  alcohol dehydrogenase  31.25 
 
 
350 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1737  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.56 
 
 
347 aa  54.3  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0264649 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1958  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  32.12 
 
 
350 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.126859  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1809  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  30.56 
 
 
350 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3598  putative dehydrogenase  33.68 
 
 
337 aa  54.7  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.927271  hitchhiker  0.00450633 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4664  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.47 
 
 
307 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0202543  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10230  2,3-butanediol dehydrogenase  29.14 
 
 
363 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.219159  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4132  alcohol dehydrogenase  32.43 
 
 
364 aa  53.9  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00103108  normal  0.177919 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0934  2,3-butanediol dehydrogenase  29.14 
 
 
363 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0552  2,3-butanediol dehydrogenase  32.71 
 
 
362 aa  52.8  0.000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09288  conserved hypothetical protein  32.56 
 
 
382 aa  52.4  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2059  sorbitol dehydrogenase  30.36 
 
 
347 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.642486  hitchhiker  0.0031409 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2784  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  44.12 
 
 
342 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.551512  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0394  threonine dehydrogenase or related Zn-dependent dehydrogenase  24.61 
 
 
345 aa  52  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1794  alcohol dehydrogenase  42.17 
 
 
343 aa  52.8  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0373035  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2828  alcohol dehydrogenase  44.12 
 
 
343 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.155527  normal  0.0877096 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2811  alcohol dehydrogenase  44.12 
 
 
347 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.133999  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0591  alcohol dehydrogenase  31.78 
 
 
362 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2161  alcohol dehydrogenase  24.25 
 
 
350 aa  52  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.270526 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0299  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.41 
 
 
336 aa  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0330  2,3-butanediol dehydrogenase  31.19 
 
 
355 aa  51.2  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2124  L-idonate 5-dehydrogenase, NAD-binding  34.95 
 
 
343 aa  51.2  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.321081  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1417  sorbitol dehydrogenase  29.46 
 
 
347 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0270  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.45 
 
 
336 aa  50.4  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2330  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.05 
 
 
352 aa  50.8  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.752502  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6366  alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
207 aa  50.8  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1727  zinc-binding dehydrogenase  27.59 
 
 
352 aa  50.4  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5063  alcohol dehydrogenase  34.55 
 
 
347 aa  50.4  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.724577  normal  0.863659 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1941  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.19 
 
 
317 aa  50.4  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3340  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.86 
 
 
356 aa  50.1  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0849  alcohol dehydrogenase  30.89 
 
 
344 aa  50.1  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0438742 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2032  sorbitol dehydrogenase, putative  30.91 
 
 
350 aa  49.7  0.00008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000906358  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3010  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  35.64 
 
 
341 aa  49.7  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3025  putative alcohol dehydrogenase  38.16 
 
 
380 aa  49.3  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1078  putative dehydrogenase  23.72 
 
 
343 aa  48.9  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1043  alcohol dehydrogenase  32.46 
 
 
353 aa  49.3  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0885  alcohol dehydrogenase  32.28 
 
 
333 aa  48.9  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2551  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.73 
 
 
341 aa  48.1  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0163607  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_74116  Sorbitol dehydrogenase  26.85 
 
 
378 aa  48.1  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.145167 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3128  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.12 
 
 
328 aa  48.1  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2217  alcohol dehydrogenase  33.02 
 
 
357 aa  48.1  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1837  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.84 
 
 
389 aa  48.5  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.607752  normal  0.577621 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4094  alcohol dehydrogenase  27.94 
 
 
358 aa  48.1  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.958788  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1032  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.66 
 
 
362 aa  48.5  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.420541  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3219  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.1 
 
 
347 aa  48.1  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4677  alcohol dehydrogenase  38.53 
 
 
347 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15095  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01745  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  30.39 
 
 
358 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.741595  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01733  hypothetical protein  30.39 
 
 
358 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1529  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.49 
 
 
369 aa  47.4  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.237052  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01743  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  27.68 
 
 
347 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.778779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1868  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.68 
 
 
347 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000261586  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2498  sorbitol dehydrogenase  27.68 
 
 
347 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.503095  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01731  hypothetical protein  27.68 
 
 
347 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.948294  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0745  threonine dehydrogenase or related Zn-dependent dehydrogenase  33.02 
 
 
360 aa  47.4  0.0004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0880  alcohol dehydrogenase  37.27 
 
 
351 aa  47.4  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.173388  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1092  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.38 
 
 
351 aa  47.4  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0446  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.52 
 
 
365 aa  47.4  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000698288  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>