188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1678 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_1678  putative dehydrogenase  100 
 
 
346 aa  709    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2453  putative dehydrogenase  57.45 
 
 
332 aa  352  8e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1178  putative dehydrogenase  54.1 
 
 
325 aa  339  5e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0767  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  57.66 
 
 
328 aa  330  2e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2745  putative dehydrogenase  54.06 
 
 
337 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000542225  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0795  dehydrogenase  46.42 
 
 
340 aa  297  1e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3598  putative dehydrogenase  56.52 
 
 
337 aa  292  5e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.927271  hitchhiker  0.00450633 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0315  putative dehydrogenase  52.89 
 
 
329 aa  287  2e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0642  dehydrogenase  45.94 
 
 
342 aa  279  6e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1679  dehydrogenase  50.61 
 
 
360 aa  259  4e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.445125  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2316  alcohol dehydrogenase  52.92 
 
 
334 aa  258  1e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.947925  normal  0.395379 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4664  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  51.16 
 
 
307 aa  249  6e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0202543  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2564  hypothetical protein  52.17 
 
 
326 aa  246  3e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.172199 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2751  hypothetical protein  51.88 
 
 
326 aa  246  6e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.794948  hitchhiker  0.00325802 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4783  alcohol dehydrogenase  52.08 
 
 
289 aa  190  4e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.230491 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1999  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.68 
 
 
336 aa  186  4e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.131571  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1078  putative dehydrogenase  38.85 
 
 
343 aa  186  4e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3514  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.13 
 
 
345 aa  176  6e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.272765  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0522  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.77 
 
 
338 aa  172  5.999999999999999e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0876145  normal  0.61344 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1232  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.39 
 
 
343 aa  167  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2577  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.46 
 
 
342 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_38005  predicted protein  27.57 
 
 
1005 aa  107  4e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1296  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.85 
 
 
369 aa  95.5  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4033  oxidoreductase domain protein  27.14 
 
 
699 aa  82.8  0.000000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0424149 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5686  glycosyl transferase group 1  25.48 
 
 
1080 aa  80.1  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5611  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
1079 aa  73.9  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.115035 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2207  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.27 
 
 
367 aa  70.1  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0588831  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4070  oxidoreductase domain protein  25.08 
 
 
734 aa  67  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2180  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  25.39 
 
 
327 aa  65.5  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1677  alcohol dehydrogenase  25.38 
 
 
318 aa  65.5  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.966295 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2561  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  27.85 
 
 
308 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2307  oxidoreductase domain-containing protein  27.23 
 
 
715 aa  63.9  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2331  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  23.1 
 
 
308 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.528911  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2642  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  26.52 
 
 
308 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00170598  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2606  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  27.62 
 
 
308 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000263757 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2765  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family superfamily  26.94 
 
 
213 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000378311 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3872  oxidoreductase domain protein  27.96 
 
 
715 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3133  alcohol dehydrogenase  27.9 
 
 
329 aa  60.5  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1685  alcohol dehydrogenase  35.07 
 
 
724 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0388  oxidoreductase domain protein  21.82 
 
 
721 aa  60.1  0.00000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.702394  normal  0.542029 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3794  zinc-binding alcohol dehydrogenase  23.4 
 
 
719 aa  59.7  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2412  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  27.07 
 
 
308 aa  59.3  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0431733  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2588  alcohol dehydrogenase  27.07 
 
 
308 aa  59.3  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2683  alcohol dehydrogenase  27.56 
 
 
347 aa  57.8  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.802614 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2604  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  27.5 
 
 
308 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000105247  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3128  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.76 
 
 
328 aa  56.6  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0667  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.44 
 
 
357 aa  56.2  0.0000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.559998 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3592  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.25 
 
 
347 aa  55.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.167683  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23420  putative zinc-binding dehydrogenase  21.75 
 
 
722 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123826  hitchhiker  0.00977209 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22030  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  26.62 
 
 
375 aa  53.9  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.255526  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3153  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  23.04 
 
 
351 aa  53.9  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0301  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  24.65 
 
 
430 aa  53.9  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0487501  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2072  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  24.65 
 
 
422 aa  53.5  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.055624  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0614  alcohol dehydrogenase  31.5 
 
 
318 aa  53.5  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0116847  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1639  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  24.65 
 
 
363 aa  53.1  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.514454  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0860  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  24.65 
 
 
363 aa  53.1  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.183529  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1195  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  24.65 
 
 
353 aa  52.8  0.000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.184304  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1527  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  22.41 
 
 
356 aa  52.8  0.000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1911  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  24.65 
 
 
363 aa  52.8  0.000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.197112  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1924  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  24.65 
 
 
363 aa  52.8  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1794  alcohol dehydrogenase  34.48 
 
 
343 aa  52.8  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0373035  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0633  alcohol dehydrogenase  30.71 
 
 
317 aa  52.4  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02345  hypothetical protein  23.11 
 
 
713 aa  51.6  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.435396 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1286  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  25.6 
 
 
346 aa  52  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.659297 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4187  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.52 
 
 
335 aa  51.6  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2436  alcohol dehydrogenase  24.56 
 
 
345 aa  52  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0598  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.67 
 
 
314 aa  50.8  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.122264  normal  0.243738 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3261  alcohol dehydrogenase  29.51 
 
 
327 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0255944 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4289  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.57 
 
 
360 aa  50.8  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.70382 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4931  alcohol dehydrogenase  23.56 
 
 
337 aa  50.1  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4579  alcohol dehydrogenase  25.56 
 
 
373 aa  50.1  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2063  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  29.06 
 
 
322 aa  50.1  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.860675 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1506  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  26.09 
 
 
408 aa  50.1  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000397792  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1762  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  26.47 
 
 
355 aa  50.1  0.00006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0108342  hitchhiker  0.000113364 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1610  alcohol dehydrogenase  26.09 
 
 
408 aa  50.1  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0475  alcohol dehydrogenase  23.78 
 
 
345 aa  49.7  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3364  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  27.27 
 
 
367 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0600954 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2051  chlorophyll synthesis pathway, BchC  29.11 
 
 
315 aa  48.5  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0614897 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1659  alcohol dehydrogenase  25.41 
 
 
339 aa  48.1  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.741659  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1654  zinc-type alcohol dehydrogenase  27.78 
 
 
341 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.959787  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0299  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  23.39 
 
 
336 aa  47.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1628  zinc-type alcohol dehydrogenase  27.78 
 
 
341 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1713  zinc-type alcohol dehydrogenase  27.78 
 
 
341 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3331  alcohol dehydrogenase  22.64 
 
 
719 aa  47.4  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.127059  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1646  zinc-type alcohol dehydrogenase  27.78 
 
 
341 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1794  zinc-type alcohol dehydrogenase  27.78 
 
 
341 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1903  phosphonate catabolism associated alcohol dehydrogenase  26.62 
 
 
387 aa  47.4  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0359  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  25.18 
 
 
366 aa  47.4  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0808  alcohol dehydrogenase  23.13 
 
 
712 aa  47.4  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1615  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  26.85 
 
 
368 aa  47  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0192054 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7277  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.65 
 
 
351 aa  47  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0153  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.78 
 
 
323 aa  47  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.568823  normal  0.158485 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2975  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.46 
 
 
340 aa  47  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0388433  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3492  hypothetical protein  26.26 
 
 
342 aa  47  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835811  normal  0.583011 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3155  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.71 
 
 
342 aa  47  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03240  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  25.19 
 
 
358 aa  47  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000129511  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3465  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  24.18 
 
 
366 aa  46.6  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.901244  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2551  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  24.32 
 
 
341 aa  46.6  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0163607  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2008  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.44 
 
 
337 aa  46.6  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.590492  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1611  chlorophyll synthesis pathway, BchC  28.19 
 
 
327 aa  46.6  0.0007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>