108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1679 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1679  dehydrogenase  100 
 
 		 360 aa  701    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.445125  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2745  putative dehydrogenase  68.63 
 
 		 337 aa  402  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000542225  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0315  putative dehydrogenase  69.14 
 
 		 329 aa  385  1e-106  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0795  dehydrogenase  54.55 
 
 		 340 aa  351  1e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0642  dehydrogenase  58.44 
 
 		 342 aa  348  7e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1178  putative dehydrogenase  55.9 
 
 		 325 aa  343  2e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2751  hypothetical protein  70.19 
 
 		 326 aa  343  2e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.794948  hitchhiker  0.00325802 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2564  hypothetical protein  69.25 
 
 		 326 aa  337  9.999999999999999e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.172199 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2453  putative dehydrogenase  55.14 
 
 		 332 aa  316  5e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0767  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  55.96 
 
 		 328 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1678  putative dehydrogenase  49.55 
 
 		 346 aa  295  6e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3598  putative dehydrogenase  55.8 
 
 		 337 aa  282  7.000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.927271  hitchhiker  0.00450633 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4664  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  54.25 
 
 		 307 aa  266  5e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0202543  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2316  alcohol dehydrogenase  48.63 
 
 		 334 aa  244  1.9999999999999999e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.947925  normal  0.395379 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1078  putative dehydrogenase  37.76 
 
 		 343 aa  203  3e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4783  alcohol dehydrogenase  51.54 
 
 		 289 aa  194  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.230491 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1999  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.58 
 
 		 336 aa  160  3e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.131571  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2577  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.71 
 
 		 342 aa  152  8e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0522  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.43 
 
 		 338 aa  145  1e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0876145  normal  0.61344 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1232  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.84 
 
 		 343 aa  141  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3514  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.67 
 
 		 345 aa  141  1.9999999999999998e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.272765  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_38005  predicted protein  32.23 
 
 		 1005 aa  137  3.0000000000000003e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2207  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.9 
 
 		 367 aa  80.9  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0588831  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5611  glycosyl transferase group 1  26.49 
 
 		 1079 aa  67  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.115035 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5686  glycosyl transferase group 1  23.92 
 
 		 1080 aa  62.8  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4677  alcohol dehydrogenase  30.77 
 
 		 347 aa  62  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1527  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  22 
 
 		 356 aa  62  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2606  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  22.15 
 
 		 308 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000263757 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1628  zinc-type alcohol dehydrogenase  26.69 
 
 		 341 aa  59.3  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0614  alcohol dehydrogenase  32.52 
 
 		 318 aa  58.5  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0116847  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2851  chlorophyll synthesis pathway, BchC  30.19 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.754242 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1646  zinc-type alcohol dehydrogenase  26.32 
 
 		 341 aa  56.6  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1654  zinc-type alcohol dehydrogenase  26.32 
 
 		 341 aa  56.6  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.959787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1794  zinc-type alcohol dehydrogenase  26.32 
 
 		 341 aa  56.6  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1296  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  25.07 
 
 		 369 aa  56.6  0.0000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2331  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  22.09 
 
 		 308 aa  56.2  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.528911  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3133  alcohol dehydrogenase  30.41 
 
 		 329 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4724  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.22 
 
 		 348 aa  55.8  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.383474  normal  0.446449 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3128  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28 
 
 		 328 aa  55.8  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2412  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  21.85 
 
 		 308 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0431733  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2588  alcohol dehydrogenase  21.85 
 
 		 308 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1713  zinc-type alcohol dehydrogenase  25.94 
 
 		 341 aa  54.3  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2642  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  22.19 
 
 		 308 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00170598  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2981  2-desacetyl-2-hydroxyethyl bacteriochlorophyllide  32.88 
 
 		 317 aa  52.8  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.383171  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3696  chlorophyll synthesis pathway, BchC  30.29 
 
 		 312 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.503769  hitchhiker  0.00324331 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3261  alcohol dehydrogenase  29.96 
 
 		 327 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0255944 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0633  alcohol dehydrogenase  30.06 
 
 		 317 aa  51.6  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3592  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.21 
 
 		 347 aa  51.2  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.167683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4070  oxidoreductase domain protein  27.75 
 
 		 734 aa  51.2  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0642  alcohol dehydrogenase  30.72 
 
 		 352 aa  50.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0159  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  30.72 
 
 		 347 aa  50.4  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.306594  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2729  chlorophyll synthesis pathway, BchC  30.15 
 
 		 312 aa  50.1  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.195631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2956  chlorophyll synthesis pathway, BchC  29.3 
 
 		 312 aa  49.7  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.106767 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1611  chlorophyll synthesis pathway, BchC  32.61 
 
 		 327 aa  49.3  0.00009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0609  alcohol dehydrogenase  30.72 
 
 		 352 aa  49.7  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0295083  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4187  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.03 
 
 		 335 aa  49.7  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0049  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  24.07 
 
 		 350 aa  49.7  0.00009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3728  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  30.12 
 
 		 352 aa  49.3  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.854934  normal  0.447633 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3340  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.82 
 
 		 356 aa  49.3  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2473  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.58 
 
 		 344 aa  48.9  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000066055  normal  0.0147407 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1685  alcohol dehydrogenase  34.78 
 
 		 724 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0980  chlorophyll synthesis pathway, BchC  23.19 
 
 		 334 aa  48.1  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2561  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  22.01 
 
 		 308 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3747  alcohol dehydrogenase  30.86 
 
 		 323 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00165792  hitchhiker  0.00000793402 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3643  alcohol dehydrogenase  36.14 
 
 		 347 aa  47.4  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.826426  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2180  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  24.38 
 
 		 327 aa  46.6  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1422  2-desacetyl-2-hydroxyethyl bacteriochlorophyllide  23.28 
 
 		 334 aa  46.6  0.0006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4609  putative dehydrogenase  29.62 
 
 		 337 aa  46.6  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.377103  normal  0.118781 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0934  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.94 
 
 		 319 aa  46.6  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0153  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.43 
 
 		 323 aa  46.2  0.0009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.568823  normal  0.158485 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0938  chlorophyll synthesis pathway, BchC  22.64 
 
 		 325 aa  45.8  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2323  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  24.5 
 
 		 317 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2374  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  24.91 
 
 		 317 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000195271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0388  oxidoreductase domain protein  23.14 
 
 		 721 aa  45.8  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.702394  normal  0.542029 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0521  putative Zn-containing dehydrogenase  27.02 
 
 		 332 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3364  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.58 
 
 		 367 aa  45.1  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0600954 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2173  alcohol dehydrogenase  29.17 
 
 		 315 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0299508  decreased coverage  0.00992206 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1677  alcohol dehydrogenase  23.65 
 
 		 318 aa  45.1  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.966295 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02513  L-threonine 3-dehydrogenase  25.17 
 
 		 344 aa  44.7  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1534  chlorophyll synthesis pathway, BchC  22.26 
 
 		 321 aa  45.1  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00910743 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0667  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.07 
 
 		 357 aa  45.1  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.559998 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2604  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  20.26 
 
 		 308 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000105247  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3903  zinc-binding alcohol dehydrogenase  26.02 
 
 		 364 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3977  alcohol dehydrogenase  26.02 
 
 		 364 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0992  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  25.7 
 
 		 326 aa  44.3  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0806  L-threonine 3-dehydrogenase  25.17 
 
 		 345 aa  44.3  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.384791  normal  0.0311544 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2063  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  26.72 
 
 		 322 aa  44.3  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.860675 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0591  alcohol dehydrogenase  22.94 
 
 		 362 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0934  2,3-butanediol dehydrogenase  26.13 
 
 		 363 aa  43.9  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3224  alcohol dehydrogenase  28.24 
 
 		 317 aa  44.3  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.234723  normal  0.02058 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4132  alcohol dehydrogenase  33.04 
 
 		 364 aa  43.9  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00103108  normal  0.177919 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0597  alcohol dehydrogenase  22.94 
 
 		 362 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0643205 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1941  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.77 
 
 		 317 aa  43.9  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0607  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  24.78 
 
 		 324 aa  43.5  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.420026  normal  0.0271059 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10230  2,3-butanediol dehydrogenase  26.01 
 
 		 363 aa  43.5  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.219159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2451  alcohol dehydrogenase  29.86 
 
 		 355 aa  43.5  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4033  oxidoreductase domain protein  28.22 
 
 		 699 aa  43.9  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0424149 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0087  alcohol dehydrogenase  29.19 
 
 		 325 aa  43.5  0.006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1000  putative alcohol dehydrogenase  32.77 
 
 		 352 aa  43.5  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0343  alcohol dehydrogenase  30 
 
 		 312 aa  43.5  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00472318 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>