More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3224 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_3224  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
317 aa  635    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.234723  normal  0.02058 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3921  alcohol dehydrogenase  92.43 
 
 
317 aa  595  1e-169  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0598  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  66.25 
 
 
314 aa  424  1e-118  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.122264  normal  0.243738 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3336  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  50.48 
 
 
318 aa  291  1e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0588906 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1882  alcohol dehydrogenase  43.71 
 
 
318 aa  288  7e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2374  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  49.05 
 
 
317 aa  282  6.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000195271  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2323  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  48.24 
 
 
317 aa  278  7e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0369  alcohol dehydrogenase  45.14 
 
 
321 aa  269  4e-71  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0893  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.57 
 
 
321 aa  256  3e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3538  alcohol dehydrogenase  44.55 
 
 
332 aa  244  9.999999999999999e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.869575 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0934  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  44.67 
 
 
319 aa  243  3.9999999999999997e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3943  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  46.93 
 
 
336 aa  236  5.0000000000000005e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0142481  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1949  alcohol dehydrogenase  36.56 
 
 
323 aa  159  6e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0237239  hitchhiker  9.46914e-17 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2180  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  32.52 
 
 
327 aa  157  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0464  alcohol dehydrogenase  37.97 
 
 
287 aa  150  2e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00255381  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1516  alcohol dehydrogenase  38.93 
 
 
328 aa  150  4e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.997072  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1096  alcohol dehydrogenase  37.59 
 
 
323 aa  145  6e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.247739  hitchhiker  0.00137607 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1581  alcohol dehydrogenase  39.86 
 
 
345 aa  144  2e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2089  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.94 
 
 
385 aa  122  6e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0827  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.87 
 
 
347 aa  121  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3324  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.61 
 
 
344 aa  119  9e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000796968  hitchhiker  0.00865975 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6089  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.75 
 
 
337 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0153  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.01 
 
 
323 aa  116  3.9999999999999997e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.568823  normal  0.158485 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3010  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.8 
 
 
341 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0351  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  29.41 
 
 
357 aa  114  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.798846  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00443  alcohol dehydrogenase, zinc-containing, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04620)  29.06 
 
 
348 aa  112  6e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.712673  normal  0.179972 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2445  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.89 
 
 
343 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.350471  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2554  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  29.05 
 
 
362 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4509  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.36 
 
 
343 aa  110  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2593  alcohol dehydrogenase  29.05 
 
 
362 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0149814  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2599  alcohol dehydrogenase  29.05 
 
 
362 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.139182  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1409  alcohol dehydrogenase  29.29 
 
 
337 aa  110  4.0000000000000004e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2713  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.87 
 
 
333 aa  110  4.0000000000000004e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4479  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.85 
 
 
347 aa  108  8.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.522798  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4609  putative dehydrogenase  29.6 
 
 
337 aa  108  9.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.377103  normal  0.118781 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0803  putative dehydrogenase  28.8 
 
 
343 aa  108  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.506069  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5447  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.61 
 
 
350 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187392  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3701  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  29.86 
 
 
321 aa  107  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.535864  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0429  alcohol dehydrogenase  32.45 
 
 
336 aa  107  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0511556  normal  0.882763 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4187  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.69 
 
 
335 aa  106  5e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2070  alcohol dehydrogenase  31.53 
 
 
336 aa  106  6e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1037  putative dehydrogenase  28.43 
 
 
340 aa  105  7e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1269  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.32 
 
 
340 aa  105  8e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1506  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  26.95 
 
 
408 aa  105  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000397792  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0771  alcohol dehydrogenase  31.97 
 
 
333 aa  105  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1610  alcohol dehydrogenase  27.36 
 
 
408 aa  104  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3998  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.94 
 
 
333 aa  103  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.235514 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2055  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.41 
 
 
363 aa  103  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0952  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  24.71 
 
 
359 aa  103  4e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000662515  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1762  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  27.05 
 
 
355 aa  103  4e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0108342  hitchhiker  0.000113364 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1007  alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  28.78 
 
 
351 aa  103  4e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0299  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.26 
 
 
336 aa  102  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07150  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  30.15 
 
 
340 aa  102  8e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.439183  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1696  threonine dehydrogenase  27.39 
 
 
334 aa  102  1e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000265476  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2269  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  25.15 
 
 
335 aa  102  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.992449  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0511  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.89 
 
 
337 aa  102  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.203373  normal  0.419772 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0239  alcohol dehydrogenase  26.94 
 
 
351 aa  101  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0233  alcohol dehydrogenase  26.94 
 
 
351 aa  101  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0270  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.52 
 
 
336 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3224  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  25.36 
 
 
357 aa  100  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1727  zinc-binding dehydrogenase  28.14 
 
 
352 aa  101  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0614  alcohol dehydrogenase  26.82 
 
 
318 aa  100  3e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0116847  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3271  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.75 
 
 
336 aa  100  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0405628 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2473  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.1 
 
 
344 aa  100  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000066055  normal  0.0147407 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1794  alcohol dehydrogenase  28.3 
 
 
343 aa  100  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0373035  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1823  alcohol dehydrogenase  29.38 
 
 
350 aa  100  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00496203  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3697  alcohol dehydrogenase  29.39 
 
 
340 aa  100  4e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587402 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2272  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.13 
 
 
349 aa  99.8  5e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0341  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.41 
 
 
379 aa  99.4  6e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.384488  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1249  alcohol dehydrogenase  29.97 
 
 
335 aa  99.4  7e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.257646  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5871  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  28.72 
 
 
340 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2551  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  26.35 
 
 
341 aa  98.6  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0163607  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1223  alcohol dehydrogenase  29.97 
 
 
335 aa  98.6  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.135954  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2811  alcohol dehydrogenase  29.54 
 
 
347 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.133999  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0503  alcohol dehydrogenase  28.74 
 
 
362 aa  98.2  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472686 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3592  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.99 
 
 
347 aa  98.2  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.167683  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3875  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.96 
 
 
344 aa  98.2  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.177678  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0607  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  30.8 
 
 
324 aa  98.2  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.420026  normal  0.0271059 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6469  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  30.3 
 
 
345 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.940711  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4903  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  28.72 
 
 
340 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.363717  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1707  threonine dehydrogenase or related Zn-dependent dehydrogenase  28.15 
 
 
336 aa  97.8  2e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.508276  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4951  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  28.72 
 
 
340 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0102074  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6704  alcohol dehydrogenase  30.3 
 
 
345 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.710863  normal  0.158251 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4898  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  28.72 
 
 
340 aa  97.8  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04235  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  28.72 
 
 
340 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.767219  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0633  alcohol dehydrogenase  26.42 
 
 
317 aa  97.4  3e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3639  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.72 
 
 
340 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2063  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  29.75 
 
 
322 aa  97.1  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.860675 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04201  hypothetical protein  28.72 
 
 
340 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.774265  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13100  L-threonine 3-dehydrogenase  25.16 
 
 
336 aa  97.4  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4590  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  28.72 
 
 
340 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00423136  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1646  zinc-type alcohol dehydrogenase  27.21 
 
 
341 aa  96.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1166  alcohol dehydrogenase  27.17 
 
 
351 aa  96.7  5e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.343531  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1713  zinc-type alcohol dehydrogenase  27.18 
 
 
341 aa  96.7  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0197  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.76 
 
 
337 aa  96.3  6e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1794  zinc-type alcohol dehydrogenase  27.18 
 
 
341 aa  96.3  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1654  zinc-type alcohol dehydrogenase  27.18 
 
 
341 aa  96.3  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.959787  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3845  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  29.18 
 
 
354 aa  96.3  6e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.650761  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5781  alcohol dehydrogenase  29.18 
 
 
354 aa  96.3  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.110473  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4523  alcohol dehydrogenase  29.18 
 
 
365 aa  95.9  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11719  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>