More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2473 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_2473  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  100 
 
 
344 aa  680    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000066055  normal  0.0147407 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2828  alcohol dehydrogenase  45.32 
 
 
343 aa  249  4e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.155527  normal  0.0877096 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2784  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  45.32 
 
 
342 aa  249  5e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.551512  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2811  alcohol dehydrogenase  45.32 
 
 
347 aa  249  5e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.133999  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0153  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.5 
 
 
323 aa  189  8e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.568823  normal  0.158485 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2063  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  37.35 
 
 
322 aa  184  1.0000000000000001e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.860675 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0388  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  30.48 
 
 
344 aa  174  2.9999999999999996e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00875101  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0389  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.63 
 
 
341 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13100  L-threonine 3-dehydrogenase  31.21 
 
 
336 aa  166  6.9999999999999995e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2180  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  31.19 
 
 
327 aa  164  3e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3492  hypothetical protein  36.23 
 
 
342 aa  162  6e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835811  normal  0.583011 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4094  alcohol dehydrogenase  35.69 
 
 
358 aa  160  4e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.958788  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2189  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.3 
 
 
346 aa  155  8e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1258  alcohol dehydrogenase  32.84 
 
 
344 aa  155  8e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0672332  normal  0.983976 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4951  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  32.48 
 
 
340 aa  155  1e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0102074  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0299  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.14 
 
 
336 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4903  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  32.48 
 
 
340 aa  155  1e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.363717  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3697  alcohol dehydrogenase  32.8 
 
 
340 aa  155  1e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587402 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04235  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  32.48 
 
 
340 aa  154  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.767219  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3639  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.48 
 
 
340 aa  154  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04201  hypothetical protein  32.48 
 
 
340 aa  154  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.774265  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4590  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  32.48 
 
 
340 aa  154  2e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00423136  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2056  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.33 
 
 
342 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4898  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  32.48 
 
 
340 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3219  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.94 
 
 
347 aa  152  5.9999999999999996e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02666  sorbitol/xylitol dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02000)  32.38 
 
 
373 aa  152  7e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4821  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.13 
 
 
344 aa  152  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111851  normal  0.477759 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5871  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  30.7 
 
 
340 aa  152  8.999999999999999e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0059  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.19 
 
 
340 aa  151  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0270  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.14 
 
 
336 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0934  2,3-butanediol dehydrogenase  32.93 
 
 
363 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3303  zinc-binding dehydrogenase family protein  30.96 
 
 
338 aa  150  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0731443 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09064  hypothetical protein similar to xylitol dehydrogenase (Broad)  28.91 
 
 
359 aa  150  3e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.715081 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001213  L-threonine 3-dehydrogenase  28.7 
 
 
343 aa  150  3e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4724  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.24 
 
 
348 aa  150  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.383474  normal  0.446449 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05001  L-threonine 3-dehydrogenase  28.41 
 
 
360 aa  150  4e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0837  L-threonine 3-dehydrogenase  27.83 
 
 
343 aa  150  5e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.178921  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2793  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.65 
 
 
356 aa  149  8e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630976  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0173  alcohol dehydrogenase  29.82 
 
 
337 aa  149  1.0000000000000001e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.976128  normal  0.272839 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4771  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.93 
 
 
344 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.107599 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0330  2,3-butanediol dehydrogenase  29.86 
 
 
355 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10230  2,3-butanediol dehydrogenase  32.04 
 
 
363 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.219159  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28190  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  31.78 
 
 
345 aa  148  1.0000000000000001e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3010  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.98 
 
 
341 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2269  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.32 
 
 
335 aa  147  3e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.992449  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02513  L-threonine 3-dehydrogenase  29.5 
 
 
344 aa  147  4.0000000000000006e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3769  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.82 
 
 
341 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.109016  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0449  L-threonine 3-dehydrogenase  29.23 
 
 
361 aa  146  4.0000000000000006e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.333655 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00067  L-threonine 3-dehydrogenase  28.49 
 
 
341 aa  145  1e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0797  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.27 
 
 
338 aa  145  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.121673  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1853  L-threonine 3-dehydrogenase  30.12 
 
 
344 aa  145  1e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.981388  normal  0.0441816 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1043  alcohol dehydrogenase  29.78 
 
 
353 aa  144  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0065  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.23 
 
 
340 aa  144  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3685  alcohol dehydrogenase  32.72 
 
 
347 aa  144  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.112233 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0597  alcohol dehydrogenase  28.97 
 
 
362 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0643205 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4159  alcohol dehydrogenase  32.49 
 
 
350 aa  144  3e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.44287  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0062  L-threonine 3-dehydrogenase  28.74 
 
 
340 aa  144  3e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0591  alcohol dehydrogenase  28.97 
 
 
362 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4823  L-threonine 3-dehydrogenase  27.27 
 
 
341 aa  143  5e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000204753 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5781  alcohol dehydrogenase  29.78 
 
 
354 aa  142  7e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.110473  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3340  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.74 
 
 
356 aa  142  7e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41760  2,3-butanediol dehydrogenase  28.93 
 
 
360 aa  142  8e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0552  2,3-butanediol dehydrogenase  28.97 
 
 
362 aa  142  9e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2813  alcohol dehydrogenase  31.49 
 
 
341 aa  142  9e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0594163  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3845  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  29.78 
 
 
354 aa  142  9e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.650761  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01743  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  28.61 
 
 
347 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.778779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1868  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.61 
 
 
347 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000261586  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4144  L-threonine 3-dehydrogenase  26.97 
 
 
341 aa  141  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.498759  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0072  L-threonine 3-dehydrogenase  26.97 
 
 
341 aa  141  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1409  alcohol dehydrogenase  29.29 
 
 
337 aa  142  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4132  alcohol dehydrogenase  30.06 
 
 
364 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00103108  normal  0.177919 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2786  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.2 
 
 
341 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4416  alcohol dehydrogenase  29.21 
 
 
354 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0164512  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4523  alcohol dehydrogenase  29.78 
 
 
365 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11719  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01731  hypothetical protein  28.61 
 
 
347 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.948294  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2830  alcohol dehydrogenase  31.2 
 
 
341 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.782331  normal  0.335133 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1998  sorbitol dehydrogenase  28.11 
 
 
347 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.329256  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4094  L-threonine 3-dehydrogenase  27.27 
 
 
341 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1325  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  29.76 
 
 
354 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.614702  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0119  L-threonine 3-dehydrogenase  27.27 
 
 
341 aa  141  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1044  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  30.31 
 
 
335 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1417  sorbitol dehydrogenase  28.32 
 
 
347 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3988  L-threonine 3-dehydrogenase  27.27 
 
 
341 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1858  alcohol dehydrogenase  28.11 
 
 
347 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.368595  hitchhiker  0.0000214432 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4033  L-threonine 3-dehydrogenase  27.27 
 
 
341 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3907  L-threonine 3-dehydrogenase  27.27 
 
 
341 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.305957 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3926  L-threonine 3-dehydrogenase  27.27 
 
 
341 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0106  L-threonine 3-dehydrogenase  28.02 
 
 
341 aa  140  3e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.588963  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3953  alcohol dehydrogenase  29.56 
 
 
354 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0353  L-threonine 3-dehydrogenase  26.96 
 
 
343 aa  140  3e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0064  L-threonine 3-dehydrogenase  28.02 
 
 
341 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00353875  unclonable  0.000000014689 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4367  L-threonine 3-dehydrogenase  27.54 
 
 
343 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3710  L-threonine 3-dehydrogenase  27.94 
 
 
341 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.187743  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2224  L-threonine 3-dehydrogenase  27.83 
 
 
344 aa  139  6e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0066  L-threonine 3-dehydrogenase  26.67 
 
 
341 aa  139  6e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4120  L-threonine 3-dehydrogenase  26.97 
 
 
341 aa  139  6e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.357417  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0121  L-threonine 3-dehydrogenase  27.78 
 
 
341 aa  139  7e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2076  L-threonine 3-dehydrogenase  30.47 
 
 
342 aa  139  7e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0654334  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4454  alcohol dehydrogenase  36.51 
 
 
345 aa  139  7e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.321717 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0619  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.15 
 
 
339 aa  139  7e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>