More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3921 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3921  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
317 aa  635    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3224  alcohol dehydrogenase  92.43 
 
 
317 aa  595  1e-169  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.234723  normal  0.02058 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0598  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  67.82 
 
 
314 aa  429  1e-119  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.122264  normal  0.243738 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3336  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  50.16 
 
 
318 aa  290  2e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0588906 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2374  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  47.94 
 
 
317 aa  279  4e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000195271  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1882  alcohol dehydrogenase  43.08 
 
 
318 aa  279  6e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2323  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  47.92 
 
 
317 aa  277  2e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0369  alcohol dehydrogenase  44.69 
 
 
321 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0893  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.57 
 
 
321 aa  256  5e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3538  alcohol dehydrogenase  43.57 
 
 
332 aa  239  4e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.869575 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0934  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.81 
 
 
319 aa  238  1e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3943  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  46.6 
 
 
336 aa  231  9e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0142481  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1949  alcohol dehydrogenase  37.83 
 
 
323 aa  160  2e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0237239  hitchhiker  9.46914e-17 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2180  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  32 
 
 
327 aa  155  6e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0464  alcohol dehydrogenase  37.97 
 
 
287 aa  150  2e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00255381  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1096  alcohol dehydrogenase  39.64 
 
 
323 aa  148  9e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.247739  hitchhiker  0.00137607 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1516  alcohol dehydrogenase  38.93 
 
 
328 aa  145  1e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.997072  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1581  alcohol dehydrogenase  38.18 
 
 
345 aa  142  9e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0827  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.19 
 
 
347 aa  125  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3324  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.91 
 
 
344 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000796968  hitchhiker  0.00865975 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2445  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.23 
 
 
343 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.350471  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2089  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.55 
 
 
385 aa  116  3.9999999999999997e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0351  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  30.29 
 
 
357 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.798846  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00443  alcohol dehydrogenase, zinc-containing, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04620)  28.84 
 
 
348 aa  113  3e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.712673  normal  0.179972 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3010  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.87 
 
 
341 aa  114  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4609  putative dehydrogenase  30.12 
 
 
337 aa  113  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.377103  normal  0.118781 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6089  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.25 
 
 
337 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2593  alcohol dehydrogenase  28.49 
 
 
362 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0149814  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2554  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  28.49 
 
 
362 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2599  alcohol dehydrogenase  28.49 
 
 
362 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.139182  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4187  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.56 
 
 
335 aa  111  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5447  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.28 
 
 
350 aa  111  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187392  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0153  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.09 
 
 
323 aa  110  4.0000000000000004e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.568823  normal  0.158485 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1269  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.87 
 
 
340 aa  109  7.000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2713  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.83 
 
 
333 aa  109  7.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4479  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.89 
 
 
347 aa  108  8.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.522798  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0952  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  25.44 
 
 
359 aa  108  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000662515  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0803  putative dehydrogenase  28.48 
 
 
343 aa  107  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.506069  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1506  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  28.24 
 
 
408 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000397792  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1409  alcohol dehydrogenase  30 
 
 
337 aa  107  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3701  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  29.96 
 
 
321 aa  108  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.535864  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1037  putative dehydrogenase  28.76 
 
 
340 aa  107  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1610  alcohol dehydrogenase  28.24 
 
 
408 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4509  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.18 
 
 
343 aa  107  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0503  alcohol dehydrogenase  29.56 
 
 
362 aa  107  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472686 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07150  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  30.77 
 
 
340 aa  107  3e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.439183  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1762  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  27.95 
 
 
355 aa  107  4e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0108342  hitchhiker  0.000113364 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3592  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.99 
 
 
347 aa  106  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.167683  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0341  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.66 
 
 
379 aa  106  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.384488  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2269  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.05 
 
 
335 aa  106  5e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.992449  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3998  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.84 
 
 
333 aa  106  5e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.235514 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0511  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.04 
 
 
337 aa  104  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.203373  normal  0.419772 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2070  alcohol dehydrogenase  31.23 
 
 
336 aa  104  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2055  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.83 
 
 
363 aa  104  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3224  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.1 
 
 
357 aa  103  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1007  alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  29.74 
 
 
351 aa  103  5e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3875  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.88 
 
 
344 aa  103  5e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.177678  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3233  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.45 
 
 
365 aa  103  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0470623  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1794  alcohol dehydrogenase  28.93 
 
 
343 aa  102  7e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0373035  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0429  alcohol dehydrogenase  32.12 
 
 
336 aa  102  8e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0511556  normal  0.882763 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3271  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.94 
 
 
336 aa  102  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0405628 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0270  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31 
 
 
336 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0299  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31 
 
 
336 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0197  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.28 
 
 
337 aa  100  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2473  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.99 
 
 
344 aa  100  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000066055  normal  0.0147407 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1166  alcohol dehydrogenase  27.49 
 
 
351 aa  100  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.343531  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2432  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  28.86 
 
 
363 aa  100  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.319398  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0233  alcohol dehydrogenase  27.21 
 
 
351 aa  100  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1707  threonine dehydrogenase or related Zn-dependent dehydrogenase  28.12 
 
 
336 aa  100  4e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.508276  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0239  alcohol dehydrogenase  27.21 
 
 
351 aa  100  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2272  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.09 
 
 
349 aa  100  5e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2551  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  26.98 
 
 
341 aa  99.8  5e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0163607  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0537  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.01 
 
 
325 aa  99  9e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00294504  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1099  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  30.03 
 
 
378 aa  98.6  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.488512  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1810  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  30.03 
 
 
378 aa  98.6  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1286  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  29.62 
 
 
346 aa  99  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.659297 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2008  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.32 
 
 
337 aa  99  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.590492  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3492  hypothetical protein  29.39 
 
 
342 aa  98.2  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835811  normal  0.583011 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2072  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  30.03 
 
 
378 aa  98.6  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0808  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  30.03 
 
 
378 aa  98.6  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1795  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  30.03 
 
 
378 aa  98.2  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.208532  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0887  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  28.86 
 
 
362 aa  97.8  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0214815  normal  0.703076 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3786  alcohol dehydrogenase  28 
 
 
369 aa  98.2  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0107971 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2636  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.03 
 
 
340 aa  98.2  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108984  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1696  threonine dehydrogenase  28.21 
 
 
334 aa  97.4  3e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000265476  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1727  zinc-binding dehydrogenase  26.95 
 
 
352 aa  97.4  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0614  alcohol dehydrogenase  26.33 
 
 
318 aa  97.1  3e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0116847  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1713  zinc-type alcohol dehydrogenase  27.82 
 
 
341 aa  97.1  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2347  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  29.46 
 
 
341 aa  97.1  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.174722  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1646  zinc-type alcohol dehydrogenase  27.82 
 
 
341 aa  97.1  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4721  alcohol dehydrogenase  29.01 
 
 
362 aa  96.7  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.36355 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2063  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  29.09 
 
 
322 aa  97.1  4e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.860675 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0364  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  29.75 
 
 
378 aa  97.1  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1794  zinc-type alcohol dehydrogenase  27.82 
 
 
341 aa  96.3  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06260  zinc-binding dehydrogenase, putative  26.39 
 
 
349 aa  96.7  5e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.040279  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0359  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  26.15 
 
 
366 aa  96.7  5e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3550  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  28 
 
 
362 aa  96.7  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5466  alcohol dehydrogenase  28 
 
 
362 aa  96.7  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.763797  normal  0.0829425 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4817  alcohol dehydrogenase  28 
 
 
362 aa  96.7  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.562057  normal  0.226619 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1654  zinc-type alcohol dehydrogenase  27.82 
 
 
341 aa  96.3  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.959787  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>