More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3538 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3538  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
332 aa  673    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.869575 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3336  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  45.74 
 
 
318 aa  275  6e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0588906 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2323  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  44.06 
 
 
317 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2374  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  42.95 
 
 
317 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000195271  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0598  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45.43 
 
 
314 aa  263  2e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.122264  normal  0.243738 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1882  alcohol dehydrogenase  40 
 
 
318 aa  257  2e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3224  alcohol dehydrogenase  44.55 
 
 
317 aa  244  9.999999999999999e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.234723  normal  0.02058 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3921  alcohol dehydrogenase  43.57 
 
 
317 aa  239  5e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3943  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  42.69 
 
 
336 aa  238  1e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0142481  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0369  alcohol dehydrogenase  37.86 
 
 
321 aa  230  3e-59  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0893  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.3 
 
 
321 aa  228  2e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0934  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.88 
 
 
319 aa  218  2e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1516  alcohol dehydrogenase  32.31 
 
 
328 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.997072  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2180  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  28.75 
 
 
327 aa  125  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1949  alcohol dehydrogenase  31.89 
 
 
323 aa  122  7e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0237239  hitchhiker  9.46914e-17 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1096  alcohol dehydrogenase  31.58 
 
 
323 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.247739  hitchhiker  0.00137607 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0827  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.71 
 
 
347 aa  116  3.9999999999999997e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0803  putative dehydrogenase  27.95 
 
 
343 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.506069  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5131  putative dehydrogenase  26.06 
 
 
343 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.869856  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4598  putative dehydrogenase  25.61 
 
 
343 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.703201 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1037  putative dehydrogenase  25.7 
 
 
340 aa  110  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2636  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.79 
 
 
340 aa  109  7.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108984  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0233  alcohol dehydrogenase  28.08 
 
 
351 aa  108  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0239  alcohol dehydrogenase  28.08 
 
 
351 aa  108  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3010  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  30.62 
 
 
341 aa  108  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0464  alcohol dehydrogenase  33.47 
 
 
287 aa  108  2e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00255381  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1258  alcohol dehydrogenase  27.3 
 
 
344 aa  107  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0672332  normal  0.983976 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2119  dehydrogenase starvation-sensing protein  30.17 
 
 
340 aa  106  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2811  alcohol dehydrogenase  29.97 
 
 
347 aa  105  7e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.133999  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1269  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.1 
 
 
340 aa  105  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0765  putative dehydrogenase  25.89 
 
 
343 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0512  putative dehydrogenase  25.89 
 
 
343 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345922  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3364  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  38.92 
 
 
367 aa  104  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0600954 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2784  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  29.97 
 
 
342 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.551512  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2002  putative dehydrogenase  25.89 
 
 
343 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2097  putative dehydrogenase  25.89 
 
 
343 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2828  alcohol dehydrogenase  29.97 
 
 
343 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.155527  normal  0.0877096 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1649  putative dehydrogenase  25.89 
 
 
343 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0584  putative dehydrogenase  25.89 
 
 
343 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.24761  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0695  putative dehydrogenase  25.89 
 
 
343 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.375651  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2089  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.24 
 
 
385 aa  104  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2473  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.97 
 
 
344 aa  102  7e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000066055  normal  0.0147407 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1933  putative dehydrogenase  24.77 
 
 
339 aa  100  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.121666  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3564  alcohol dehydrogenase  25.66 
 
 
347 aa  100  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.950821  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0364  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  25.95 
 
 
378 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1810  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  25.95 
 
 
378 aa  99.8  5e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2072  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  25.95 
 
 
378 aa  99.8  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0808  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  25.95 
 
 
378 aa  99.8  5e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1099  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  25.95 
 
 
378 aa  99.8  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.488512  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2063  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  31.72 
 
 
322 aa  99.8  7e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.860675 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1794  alcohol dehydrogenase  27.19 
 
 
343 aa  99.4  7e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0373035  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0459  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  25.95 
 
 
378 aa  99.4  9e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.479531  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6089  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  28.87 
 
 
337 aa  99  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1795  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  25.95 
 
 
378 aa  98.6  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.208532  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5306  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.46 
 
 
329 aa  99  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14560  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  31.79 
 
 
352 aa  99  1e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0972559 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1617  putative dehydrogenase  26.07 
 
 
339 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1646  zinc-type alcohol dehydrogenase  25.3 
 
 
341 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0934  2,3-butanediol dehydrogenase  27.84 
 
 
363 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1654  zinc-type alcohol dehydrogenase  25.3 
 
 
341 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.959787  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1794  zinc-type alcohol dehydrogenase  25.3 
 
 
341 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1044  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  29.65 
 
 
335 aa  98.2  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2554  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  27.92 
 
 
362 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2220  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.78 
 
 
343 aa  98.2  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.135715 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3875  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.03 
 
 
344 aa  98.2  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.177678  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2061  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  25.66 
 
 
358 aa  98.2  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000764117 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1166  alcohol dehydrogenase  26.73 
 
 
351 aa  97.8  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.343531  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2599  alcohol dehydrogenase  27.92 
 
 
362 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.139182  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2593  alcohol dehydrogenase  27.92 
 
 
362 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0149814  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2269  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.19 
 
 
335 aa  97.8  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.992449  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1713  zinc-type alcohol dehydrogenase  25.97 
 
 
341 aa  97.4  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1409  alcohol dehydrogenase  28.44 
 
 
337 aa  97.4  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1736  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  26.78 
 
 
349 aa  97.8  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5447  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.21 
 
 
350 aa  97.4  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187392  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1608  putative dehydrogenase  26.07 
 
 
339 aa  97.1  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1676  putative dehydrogenase  26.07 
 
 
339 aa  97.1  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4479  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.16 
 
 
347 aa  97.1  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.522798  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4821  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.38 
 
 
344 aa  97.1  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111851  normal  0.477759 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0511  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.33 
 
 
337 aa  95.9  8e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.203373  normal  0.419772 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0351  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  26.74 
 
 
357 aa  95.9  9e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.798846  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01745  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  25.66 
 
 
358 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.741595  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1866  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  25.66 
 
 
358 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000004473  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1666  putative dehydrogenase  26.07 
 
 
339 aa  95.5  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.747821  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0173  alcohol dehydrogenase  27.86 
 
 
337 aa  95.1  1e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.976128  normal  0.272839 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01733  hypothetical protein  25.66 
 
 
358 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3324  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.43 
 
 
344 aa  95.9  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000796968  hitchhiker  0.00865975 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10230  2,3-butanediol dehydrogenase  26.57 
 
 
363 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.219159  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1856  alcohol dehydrogenase  25.66 
 
 
358 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000020196 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0607  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  30.57 
 
 
324 aa  94.7  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.420026  normal  0.0271059 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4609  putative dehydrogenase  29.63 
 
 
337 aa  94.7  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.377103  normal  0.118781 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06260  zinc-binding dehydrogenase, putative  23.92 
 
 
349 aa  94.7  2e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.040279  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3221  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  23.6 
 
 
358 aa  94.7  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000142115  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1628  zinc-type alcohol dehydrogenase  25.45 
 
 
341 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1581  alcohol dehydrogenase  28.95 
 
 
345 aa  94.7  2e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2000  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  25.66 
 
 
358 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0176077  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2500  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  25.66 
 
 
358 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0119751  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1415  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  25.66 
 
 
358 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.297309  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0299  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.71 
 
 
336 aa  94  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00067  L-threonine 3-dehydrogenase  31.4 
 
 
341 aa  94.4  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1861  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  25.66 
 
 
358 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000288752  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>