More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1516 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_1516  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
328 aa  650    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.997072  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1949  alcohol dehydrogenase  64.63 
 
 
323 aa  426  1e-118  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0237239  hitchhiker  9.46914e-17 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1096  alcohol dehydrogenase  64.94 
 
 
323 aa  418  1e-116  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.247739  hitchhiker  0.00137607 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1581  alcohol dehydrogenase  60.12 
 
 
345 aa  345  8e-94  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0464  alcohol dehydrogenase  36.36 
 
 
287 aa  169  9e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00255381  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3336  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  37.85 
 
 
318 aa  168  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0588906 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0598  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.01 
 
 
314 aa  167  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.122264  normal  0.243738 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1882  alcohol dehydrogenase  34.42 
 
 
318 aa  158  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2180  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  33.14 
 
 
327 aa  157  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3224  alcohol dehydrogenase  38.93 
 
 
317 aa  157  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.234723  normal  0.02058 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0369  alcohol dehydrogenase  37.54 
 
 
321 aa  155  6e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2374  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.22 
 
 
317 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000195271  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3921  alcohol dehydrogenase  38.93 
 
 
317 aa  153  4e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2323  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.38 
 
 
317 aa  151  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0475  alcohol dehydrogenase  31.21 
 
 
345 aa  147  3e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0173  alcohol dehydrogenase  31.17 
 
 
337 aa  145  7.0000000000000006e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.976128  normal  0.272839 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0153  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.12 
 
 
323 aa  142  9e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.568823  normal  0.158485 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2272  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.18 
 
 
349 aa  140  3e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2269  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.75 
 
 
335 aa  137  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.992449  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13100  L-threonine 3-dehydrogenase  30.86 
 
 
336 aa  135  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3271  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.43 
 
 
336 aa  134  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0405628 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03240  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  30.03 
 
 
358 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000129511  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1736  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  30.5 
 
 
349 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0196  alcohol dehydrogenase  31.09 
 
 
338 aa  134  1.9999999999999998e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.583804  normal  0.0665338 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0934  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.05 
 
 
319 aa  134  1.9999999999999998e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3324  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.68 
 
 
344 aa  134  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000796968  hitchhiker  0.00865975 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2063  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  32.18 
 
 
322 aa  133  3e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.860675 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0934  2,3-butanediol dehydrogenase  30.97 
 
 
363 aa  133  5e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3538  alcohol dehydrogenase  32.31 
 
 
332 aa  132  6e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.869575 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5781  alcohol dehydrogenase  32.01 
 
 
354 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.110473  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2220  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.29 
 
 
343 aa  132  7.999999999999999e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.135715 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0827  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.21 
 
 
347 aa  131  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3845  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.01 
 
 
354 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.650761  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4523  alcohol dehydrogenase  32.01 
 
 
365 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11719  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0893  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.56 
 
 
321 aa  130  3e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1325  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.73 
 
 
354 aa  130  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.614702  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10230  2,3-butanediol dehydrogenase  30.4 
 
 
363 aa  130  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.219159  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0537  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.76 
 
 
325 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00294504  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3492  hypothetical protein  32.36 
 
 
342 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835811  normal  0.583011 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4119  alcohol dehydrogenase  29.7 
 
 
356 aa  127  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.362779  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4931  alcohol dehydrogenase  30.75 
 
 
337 aa  126  5e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2089  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.27 
 
 
385 aa  125  7e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4416  alcohol dehydrogenase  30.11 
 
 
354 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0164512  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1804  alcohol dehydrogenase  30 
 
 
349 aa  125  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3155  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.07 
 
 
342 aa  124  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3786  alcohol dehydrogenase  30.68 
 
 
369 aa  124  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0107971 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3010  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34.53 
 
 
341 aa  124  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41760  2,3-butanediol dehydrogenase  31.44 
 
 
360 aa  124  3e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0944  L-idonate 5-dehydrogenase  30.41 
 
 
350 aa  124  3e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.272351  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3943  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.34 
 
 
336 aa  123  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0142481  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3953  alcohol dehydrogenase  29.83 
 
 
354 aa  124  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3405  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.53 
 
 
348 aa  123  4e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0198026  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2055  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.01 
 
 
363 aa  123  5e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3550  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  30.68 
 
 
362 aa  123  5e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4817  alcohol dehydrogenase  30.68 
 
 
362 aa  123  5e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.562057  normal  0.226619 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5466  alcohol dehydrogenase  30.68 
 
 
362 aa  123  5e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.763797  normal  0.0829425 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0607  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  32.43 
 
 
324 aa  122  9e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.420026  normal  0.0271059 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07150  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  32.27 
 
 
340 aa  122  9.999999999999999e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.439183  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2461  alcohol dehydrogenase  31.49 
 
 
344 aa  121  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.806463  normal  0.872152 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0887  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  30.03 
 
 
362 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0214815  normal  0.703076 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3875  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.23 
 
 
344 aa  121  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.177678  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0503  alcohol dehydrogenase  30.11 
 
 
362 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472686 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1286  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  28.97 
 
 
346 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.659297 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4198  alcohol dehydrogenase  30.11 
 
 
362 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0108  alcohol dehydrogenase  35.11 
 
 
338 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.476377  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1249  alcohol dehydrogenase  31.15 
 
 
335 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.257646  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0388  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  26.63 
 
 
344 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00875101  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4132  alcohol dehydrogenase  30.61 
 
 
364 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00103108  normal  0.177919 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00443  alcohol dehydrogenase, zinc-containing, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04620)  29.24 
 
 
348 aa  120  3e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.712673  normal  0.179972 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6341  alcohol dehydrogenase  30.5 
 
 
336 aa  120  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00479428  normal  0.719872 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0059  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.97 
 
 
340 aa  120  3e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5268  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.12 
 
 
346 aa  120  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6469  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  29.82 
 
 
345 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.940711  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1223  alcohol dehydrogenase  30.52 
 
 
335 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.135954  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5476  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.94 
 
 
335 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.674809  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6704  alcohol dehydrogenase  29.82 
 
 
345 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.710863  normal  0.158251 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0597  alcohol dehydrogenase  29.83 
 
 
362 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0643205 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4846  alcohol dehydrogenase  28.74 
 
 
346 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.475925  normal  0.0130408 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0591  alcohol dehydrogenase  29.55 
 
 
362 aa  119  7e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3317  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.6 
 
 
338 aa  119  7.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.621516  hitchhiker  0.0000240679 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1043  alcohol dehydrogenase  28.69 
 
 
353 aa  119  7.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2056  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.1 
 
 
342 aa  119  9e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0233  alcohol dehydrogenase  30.38 
 
 
351 aa  119  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1409  alcohol dehydrogenase  27.48 
 
 
337 aa  118  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0065  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.27 
 
 
340 aa  118  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4721  alcohol dehydrogenase  29.83 
 
 
362 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.36355 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3233  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.66 
 
 
365 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0470623  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2394  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.14 
 
 
341 aa  119  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0239  alcohol dehydrogenase  30.38 
 
 
351 aa  119  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5063  alcohol dehydrogenase  31.94 
 
 
347 aa  119  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.724577  normal  0.863659 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0534  alcohol dehydrogenase  33.23 
 
 
328 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.83673 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0552  2,3-butanediol dehydrogenase  29.55 
 
 
362 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4706  alcohol dehydrogenase  27.57 
 
 
341 aa  118  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0797  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  29.67 
 
 
338 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.121673  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5628  L-threonine 3-dehydrogenase  29.38 
 
 
341 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0490  alcohol dehydrogenase  29.38 
 
 
341 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.283915  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1619  alcohol dehydrogenase  28.98 
 
 
341 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1644  zinc-binding alcohol dehydrogenase  28.98 
 
 
341 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.14571  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1530  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.74 
 
 
367 aa  117  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0540116  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2235  alcohol dehydrogenase  28.98 
 
 
341 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>