More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0934 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0934  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  100 
 
 		 319 aa  645    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2323  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45.97 
 
 		 317 aa  260  3e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2374  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45.79 
 
 		 317 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000195271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0369  alcohol dehydrogenase  43.14 
 
 		 321 aa  253  4.0000000000000004e-66  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3336  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  47.14 
 
 		 318 aa  252  6e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0588906 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0598  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  47.83 
 
 		 314 aa  246  4.9999999999999997e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.122264  normal  0.243738 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3224  alcohol dehydrogenase  44.67 
 
 		 317 aa  243  3.9999999999999997e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.234723  normal  0.02058 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3921  alcohol dehydrogenase  43.81 
 
 		 317 aa  238  1e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0893  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.28 
 
 		 321 aa  221  9.999999999999999e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1882  alcohol dehydrogenase  39.8 
 
 		 318 aa  217  2e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3538  alcohol dehydrogenase  39.88 
 
 		 332 aa  218  2e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.869575 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3943  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.34 
 
 		 336 aa  188  9e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0142481  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1949  alcohol dehydrogenase  34.46 
 
 		 323 aa  130  3e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0237239  hitchhiker  9.46914e-17 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1516  alcohol dehydrogenase  33.95 
 
 		 328 aa  127  3e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.997072  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1581  alcohol dehydrogenase  34.11 
 
 		 345 aa  124  2e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0464  alcohol dehydrogenase  35.92 
 
 		 287 aa  119  7e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00255381  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4609  putative dehydrogenase  31.92 
 
 		 337 aa  119  9e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.377103  normal  0.118781 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1096  alcohol dehydrogenase  32.77 
 
 		 323 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.247739  hitchhiker  0.00137607 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1037  putative dehydrogenase  27.06 
 
 		 340 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0803  putative dehydrogenase  27.06 
 
 		 343 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.506069  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0197  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.6 
 
 		 337 aa  108  9.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0827  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.8 
 
 		 347 aa  104  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3875  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.85 
 
 		 344 aa  104  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.177678  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1269  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.33 
 
 		 340 aa  103  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2008  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.57 
 
 		 337 aa  103  5e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.590492  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05001  L-threonine 3-dehydrogenase  26.71 
 
 		 360 aa  103  5e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2220  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.22 
 
 		 343 aa  102  6e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.135715 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2180  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  29.13 
 
 		 327 aa  102  9e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2063  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  30.62 
 
 		 322 aa  102  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.860675 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0100  L-threonine 3-dehydrogenase  24.15 
 
 		 341 aa  102  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.173553 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001213  L-threonine 3-dehydrogenase  26.4 
 
 		 343 aa  101  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0106  L-threonine 3-dehydrogenase  25.08 
 
 		 341 aa  101  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.588963  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00067  L-threonine 3-dehydrogenase  26.77 
 
 		 341 aa  100  4e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3324  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.55 
 
 		 344 aa  99.8  6e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000796968  hitchhiker  0.00865975 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0153  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.92 
 
 		 323 aa  99.8  6e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.568823  normal  0.158485 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2636  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.02 
 
 		 340 aa  99.4  7e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108984  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1783  L-threonine 3-dehydrogenase  24.14 
 
 		 345 aa  99  9e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.817669  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4086  L-threonine 3-dehydrogenase  25.15 
 
 		 343 aa  99  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2269  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.44 
 
 		 335 aa  98.6  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.992449  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0201  L-threonine 3-dehydrogenase  24.61 
 
 		 342 aa  98.6  1e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0607  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  31.17 
 
 		 324 aa  98.6  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.420026  normal  0.0271059 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1862  L-threonine 3-dehydrogenase  24.06 
 
 		 345 aa  99  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.494321  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3710  L-threonine 3-dehydrogenase  24.84 
 
 		 341 aa  98.6  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.187743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0064  L-threonine 3-dehydrogenase  24.06 
 
 		 341 aa  98.6  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00353875  unclonable  0.000000014689 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1995  L-threonine 3-dehydrogenase  24.61 
 
 		 348 aa  98.6  1e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.271324  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0062  L-threonine 3-dehydrogenase  28.07 
 
 		 340 aa  98.6  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3939  L-threonine 3-dehydrogenase  24.15 
 
 		 341 aa  98.2  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.27746  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1707  threonine dehydrogenase or related Zn-dependent dehydrogenase  31.48 
 
 		 336 aa  97.1  4e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.508276  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3998  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.2 
 
 		 333 aa  97.1  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.235514 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4673  L-threonine 3-dehydrogenase  24.05 
 
 		 341 aa  96.3  6e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4094  L-threonine 3-dehydrogenase  25.62 
 
 		 341 aa  96.3  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8852  L-threonine 3-dehydrogenase  26.48 
 
 		 342 aa  96.3  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4033  L-threonine 3-dehydrogenase  25.62 
 
 		 341 aa  96.3  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3926  L-threonine 3-dehydrogenase  25.62 
 
 		 341 aa  96.3  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2095  L-threonine 3-dehydrogenase  23.44 
 
 		 345 aa  96.3  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3907  L-threonine 3-dehydrogenase  25.62 
 
 		 341 aa  96.3  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.305957 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3988  L-threonine 3-dehydrogenase  25.62 
 
 		 341 aa  96.3  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0837  L-threonine 3-dehydrogenase  25.47 
 
 		 343 aa  96.3  6e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.178921  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4187  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.97 
 
 		 335 aa  95.9  8e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0444  L-threonine 3-dehydrogenase  30.04 
 
 		 344 aa  95.9  9e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3993  L-threonine 3-dehydrogenase  24.05 
 
 		 341 aa  95.9  9e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00526956  normal  0.0228585 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0089  L-threonine 3-dehydrogenase  25.31 
 
 		 341 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3616  L-threonine 3-dehydrogenase  23.96 
 
 		 342 aa  95.5  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00121447  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0449  L-threonine 3-dehydrogenase  29.07 
 
 		 361 aa  95.1  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.333655 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3901  L-threonine 3-dehydrogenase  24.05 
 
 		 341 aa  95.5  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00409651  normal  0.55097 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4105  L-threonine 3-dehydrogenase  24.05 
 
 		 341 aa  95.5  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287848  normal  0.406165 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4367  L-threonine 3-dehydrogenase  25.61 
 
 		 343 aa  95.5  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4120  L-threonine 3-dehydrogenase  26.54 
 
 		 341 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.357417  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3953  L-threonine 3-dehydrogenase  25.31 
 
 		 341 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0503034  normal  0.824331 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03474  L-threonine 3-dehydrogenase  25.31 
 
 		 341 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0601715  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2119  dehydrogenase starvation-sensing protein  28.86 
 
 		 340 aa  94.4  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0092  L-threonine 3-dehydrogenase  25.31 
 
 		 341 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.212636  normal  0.425053 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03425  hypothetical protein  25.31 
 
 		 341 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3793  L-threonine 3-dehydrogenase  24.6 
 
 		 341 aa  94.4  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00257874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3828  L-threonine 3-dehydrogenase  25.31 
 
 		 341 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0267024  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4416  alcohol dehydrogenase  27.49 
 
 		 354 aa  94.7  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0164512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0097  L-threonine 3-dehydrogenase  27.8 
 
 		 341 aa  94.7  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0317813  hitchhiker  0.00132916 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2272  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.73 
 
 		 349 aa  94.7  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4044  L-threonine 3-dehydrogenase  25.31 
 
 		 341 aa  94.7  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.100127  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3902  L-threonine 3-dehydrogenase  23.96 
 
 		 341 aa  94  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00646337  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5447  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.12 
 
 		 350 aa  94  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3953  alcohol dehydrogenase  27.49 
 
 		 354 aa  94  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0429  alcohol dehydrogenase  31.15 
 
 		 336 aa  93.6  4e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0511556  normal  0.882763 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4989  L-threonine 3-dehydrogenase  26.1 
 
 		 341 aa  93.6  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0175  L-threonine 3-dehydrogenase  27.8 
 
 		 341 aa  92.8  6e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.348381  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0353  L-threonine 3-dehydrogenase  24.22 
 
 		 343 aa  92.8  7e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3845  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  25.72 
 
 		 354 aa  92.4  9e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.650761  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4823  L-threonine 3-dehydrogenase  24.69 
 
 		 341 aa  92.4  9e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000204753 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0948  putative L-idonate 5-dehydrogenase oxidoreductase protein  26.78 
 
 		 344 aa  92  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.593328 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5781  alcohol dehydrogenase  26 
 
 		 354 aa  91.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.110473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1608  putative dehydrogenase  26.91 
 
 		 339 aa  91.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0351  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  27.19 
 
 		 357 aa  92  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.798846  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3010  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  30.24 
 
 		 341 aa  92  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3701  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  25.48 
 
 		 321 aa  92  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.535864  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4341  L-threonine 3-dehydrogenase  23.64 
 
 		 341 aa  92  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.183698  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4523  alcohol dehydrogenase  25.72 
 
 		 365 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0503  alcohol dehydrogenase  26.65 
 
 		 362 aa  92  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00472686 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1933  putative dehydrogenase  25.53 
 
 		 339 aa  91.7  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.121666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2931  L-threonine 3-dehydrogenase  28.25 
 
 		 343 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.217588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4598  putative dehydrogenase  25.88 
 
 		 343 aa  91.3  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.703201 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>