More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0511 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_0511  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  100 
 
 
337 aa  660    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.203373  normal  0.419772 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4677  alcohol dehydrogenase  53.98 
 
 
347 aa  303  3.0000000000000004e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15095  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0153  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.65 
 
 
323 aa  137  3.0000000000000003e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.568823  normal  0.158485 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2269  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.01 
 
 
335 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.992449  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3998  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.91 
 
 
333 aa  134  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.235514 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1286  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.14 
 
 
346 aa  129  7.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.659297 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0429  alcohol dehydrogenase  35.21 
 
 
336 aa  129  9.000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0511556  normal  0.882763 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2180  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  29.19 
 
 
327 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13100  L-threonine 3-dehydrogenase  28.44 
 
 
336 aa  125  9e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1860  alcohol dehydrogenase  31.25 
 
 
336 aa  125  1e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.710452  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0299  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.95 
 
 
336 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0475  alcohol dehydrogenase  29.8 
 
 
345 aa  125  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1258  alcohol dehydrogenase  30.43 
 
 
344 aa  124  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0672332  normal  0.983976 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3364  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  37.07 
 
 
367 aa  123  4e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0600954 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0049  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.1 
 
 
350 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07150  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  34.92 
 
 
340 aa  120  3e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.439183  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0603  threonine dehydrogenase related Zn-dependent dehydrogenase  28.34 
 
 
338 aa  120  3e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000710686  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1037  putative dehydrogenase  28.57 
 
 
340 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2061  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  31.98 
 
 
339 aa  120  4.9999999999999996e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4187  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.15 
 
 
335 aa  119  6e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2647  dehydrogenase  27.14 
 
 
338 aa  119  7e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0114296  normal  0.147618 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5304  alcohol dehydrogenase  31.75 
 
 
373 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.183348  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0197  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.54 
 
 
337 aa  119  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0803  putative dehydrogenase  28.28 
 
 
343 aa  118  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.506069  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1269  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.45 
 
 
340 aa  118  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01743  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  30.3 
 
 
347 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.778779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1868  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.3 
 
 
347 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000261586  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01731  hypothetical protein  30.3 
 
 
347 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.948294  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2189  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.05 
 
 
346 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1998  sorbitol dehydrogenase  30.91 
 
 
347 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.329256  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0953  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.51 
 
 
336 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00776384  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2636  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.36 
 
 
340 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108984  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0270  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.69 
 
 
336 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1858  alcohol dehydrogenase  30.3 
 
 
347 aa  117  3e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.368595  hitchhiker  0.0000214432 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1617  putative dehydrogenase  29.86 
 
 
339 aa  116  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5306  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.91 
 
 
329 aa  116  6e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2498  sorbitol dehydrogenase  30 
 
 
347 aa  116  6e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.503095  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2551  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  28.82 
 
 
341 aa  116  6e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0163607  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3935  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.41 
 
 
331 aa  116  6.9999999999999995e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1608  putative dehydrogenase  29.57 
 
 
339 aa  115  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1676  putative dehydrogenase  29.57 
 
 
339 aa  115  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2059  sorbitol dehydrogenase  29.59 
 
 
347 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.642486  hitchhiker  0.0031409 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3492  hypothetical protein  32.09 
 
 
342 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835811  normal  0.583011 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2445  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.55 
 
 
343 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.350471  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2813  alcohol dehydrogenase  30.09 
 
 
341 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0594163  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2786  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  29.79 
 
 
341 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0472  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.24 
 
 
368 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3953  L-threonine 3-dehydrogenase  28.27 
 
 
341 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0503034  normal  0.824331 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0827  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.55 
 
 
347 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1417  sorbitol dehydrogenase  30 
 
 
347 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2830  alcohol dehydrogenase  29.79 
 
 
341 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.782331  normal  0.335133 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1620  putative dehydrogenase  29.86 
 
 
339 aa  114  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00863317  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1666  putative dehydrogenase  29.57 
 
 
339 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.747821  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0089  L-threonine 3-dehydrogenase  28.27 
 
 
341 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3336  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.31 
 
 
318 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0588906 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0038  alcohol dehydrogenase  30.09 
 
 
340 aa  113  4.0000000000000004e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0173  alcohol dehydrogenase  30.12 
 
 
337 aa  113  4.0000000000000004e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.976128  normal  0.272839 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1787  putative dehydrogenase  29.86 
 
 
339 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.496797  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4120  L-threonine 3-dehydrogenase  27.96 
 
 
341 aa  113  5e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.357417  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5133  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  30.34 
 
 
373 aa  113  5e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5001  alcohol dehydrogenase  30.53 
 
 
373 aa  113  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5726  alcohol dehydrogenase  30.34 
 
 
373 aa  113  5e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2220  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.65 
 
 
343 aa  112  6e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.135715 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2050  putative dehydrogenase  29.57 
 
 
339 aa  113  6e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0249357  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00443  alcohol dehydrogenase, zinc-containing, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04620)  27.57 
 
 
348 aa  112  7.000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.712673  normal  0.179972 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4497  alcohol dehydrogenase  30.34 
 
 
373 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4044  L-threonine 3-dehydrogenase  27.96 
 
 
341 aa  112  8.000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.100127  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03474  L-threonine 3-dehydrogenase  27.96 
 
 
341 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0601715  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03425  hypothetical protein  27.96 
 
 
341 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3828  L-threonine 3-dehydrogenase  27.96 
 
 
341 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0267024  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4989  L-threonine 3-dehydrogenase  27.96 
 
 
341 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.014  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0092  L-threonine 3-dehydrogenase  27.96 
 
 
341 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.212636  normal  0.425053 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01549  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  29.86 
 
 
339 aa  112  9e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0963058  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01539  hypothetical protein  29.86 
 
 
339 aa  112  9e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.161589  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2063  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  31.51 
 
 
322 aa  112  9e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.860675 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2063  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.57 
 
 
339 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00265684  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3384  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.61 
 
 
345 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000451542  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06260  zinc-binding dehydrogenase, putative  25.42 
 
 
349 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.040279  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4609  putative dehydrogenase  32.41 
 
 
337 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.377103  normal  0.118781 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2268  alcohol dehydrogenase  26.82 
 
 
358 aa  112  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.396502  hitchhiker  0.0088894 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4479  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.79 
 
 
347 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.522798  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1933  putative dehydrogenase  28.41 
 
 
339 aa  111  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.121666  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2975  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  27.62 
 
 
340 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0388433  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1696  threonine dehydrogenase  28.17 
 
 
334 aa  110  3e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000265476  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0072  L-threonine 3-dehydrogenase  27.05 
 
 
341 aa  110  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4144  L-threonine 3-dehydrogenase  27.05 
 
 
341 aa  110  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.498759  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0066  L-threonine 3-dehydrogenase  27.05 
 
 
341 aa  110  4.0000000000000004e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3907  L-threonine 3-dehydrogenase  27.66 
 
 
341 aa  109  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.305957 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3988  L-threonine 3-dehydrogenase  27.66 
 
 
341 aa  109  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4094  L-threonine 3-dehydrogenase  27.66 
 
 
341 aa  109  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4033  L-threonine 3-dehydrogenase  27.66 
 
 
341 aa  109  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3926  L-threonine 3-dehydrogenase  27.66 
 
 
341 aa  109  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3148  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  29.41 
 
 
373 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4823  L-threonine 3-dehydrogenase  27.05 
 
 
341 aa  109  8.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000204753 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0359  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  28.13 
 
 
366 aa  108  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0351  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  30.62 
 
 
357 aa  108  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.798846  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3875  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.34 
 
 
344 aa  108  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.177678  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4724  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.68 
 
 
348 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.383474  normal  0.446449 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1714  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.99 
 
 
352 aa  108  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00067  L-threonine 3-dehydrogenase  28.4 
 
 
341 aa  107  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>