111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2564 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2564  hypothetical protein  100 
 
 		 326 aa  632  1e-180  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.172199 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2751  hypothetical protein  91.72 
 
 		 326 aa  463  1e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.794948  hitchhiker  0.00325802 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2745  putative dehydrogenase  70.06 
 
 		 337 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000542225  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0315  putative dehydrogenase  68.24 
 
 		 329 aa  394  1e-108  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1178  putative dehydrogenase  58.75 
 
 		 325 aa  377  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0642  dehydrogenase  60.25 
 
 		 342 aa  372  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1679  dehydrogenase  69.25 
 
 		 360 aa  370  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.445125  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0795  dehydrogenase  57.37 
 
 		 340 aa  366  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2453  putative dehydrogenase  55.05 
 
 		 332 aa  328  6e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0767  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  55.69 
 
 		 328 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1678  putative dehydrogenase  52.17 
 
 		 346 aa  303  2.0000000000000002e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3598  putative dehydrogenase  55.62 
 
 		 337 aa  289  4e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.927271  hitchhiker  0.00450633 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4664  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50.49 
 
 		 307 aa  255  9e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0202543  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2316  alcohol dehydrogenase  48.08 
 
 		 334 aa  231  2e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.947925  normal  0.395379 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4783  alcohol dehydrogenase  50.87 
 
 		 289 aa  195  9e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.230491 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1078  putative dehydrogenase  36.81 
 
 		 343 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1999  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.89 
 
 		 336 aa  157  3e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.131571  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1232  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.01 
 
 		 343 aa  150  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0522  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.73 
 
 		 338 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0876145  normal  0.61344 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2577  zinc-binding alcohol dehydrogenase  38.08 
 
 		 342 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3514  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.28 
 
 		 345 aa  135  8e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.272765  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_38005  predicted protein  28 
 
 		 1005 aa  109  5e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2207  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.7 
 
 		 367 aa  86.3  7e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0588831  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5611  glycosyl transferase group 1  29.45 
 
 		 1079 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.115035 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2180  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  27.34 
 
 		 327 aa  69.3  0.00000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0614  alcohol dehydrogenase  25.1 
 
 		 318 aa  68.2  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0116847  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5686  glycosyl transferase group 1  25.28 
 
 		 1080 aa  66.2  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0388  oxidoreductase domain protein  23.14 
 
 		 721 aa  63.5  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.702394  normal  0.542029 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0633  alcohol dehydrogenase  25.1 
 
 		 317 aa  63.2  0.000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2331  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  22.67 
 
 		 308 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.528911  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3128  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.63 
 
 		 328 aa  59.7  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3133  alcohol dehydrogenase  29.46 
 
 		 329 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1685  alcohol dehydrogenase  31.25 
 
 		 724 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1628  zinc-type alcohol dehydrogenase  26.9 
 
 		 341 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2642  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  22.05 
 
 		 308 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00170598  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0667  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.35 
 
 		 357 aa  57  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.559998 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4070  oxidoreductase domain protein  28.16 
 
 		 734 aa  57  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1654  zinc-type alcohol dehydrogenase  26.9 
 
 		 341 aa  57  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.959787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1646  zinc-type alcohol dehydrogenase  26.9 
 
 		 341 aa  57.4  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1794  zinc-type alcohol dehydrogenase  26.9 
 
 		 341 aa  57  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2606  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  21.5 
 
 		 308 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000263757 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1941  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.38 
 
 		 317 aa  55.1  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1296  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.16 
 
 		 369 aa  55.1  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1713  zinc-type alcohol dehydrogenase  26.55 
 
 		 341 aa  54.3  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5131  putative dehydrogenase  26.38 
 
 		 343 aa  53.5  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.869856  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2412  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  21.15 
 
 		 308 aa  52.8  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0431733  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2588  alcohol dehydrogenase  21.15 
 
 		 308 aa  52.8  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4598  putative dehydrogenase  25.96 
 
 		 343 aa  52.4  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.703201 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3331  alcohol dehydrogenase  25.28 
 
 		 719 aa  52.4  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.127059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4033  oxidoreductase domain protein  25 
 
 		 699 aa  51.6  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0424149 
 
 
-
 
NC_003296  RS02345  hypothetical protein  22.84 
 
 		 713 aa  50.1  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.435396 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2307  oxidoreductase domain-containing protein  26.39 
 
 		 715 aa  50.1  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4677  alcohol dehydrogenase  31.54 
 
 		 347 aa  49.7  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15095  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0934  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.44 
 
 		 319 aa  48.5  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3261  alcohol dehydrogenase  29.66 
 
 		 327 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0255944 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0178  alcohol dehydrogenase  24.67 
 
 		 336 aa  49.3  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1445  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  25.59 
 
 		 318 aa  49.3  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4706  alcohol dehydrogenase  26.07 
 
 		 341 aa  48.1  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1540  alcohol dehydrogenase  28.22 
 
 		 336 aa  48.5  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.931266 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2765  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family superfamily  24.88 
 
 		 213 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000378311 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1794  alcohol dehydrogenase  28.09 
 
 		 343 aa  47.4  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0373035  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3696  chlorophyll synthesis pathway, BchC  30.12 
 
 		 312 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.503769  hitchhiker  0.00324331 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07150  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  29.17 
 
 		 340 aa  47.4  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.439183  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1537  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.81 
 
 		 361 aa  47  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.60128 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2851  chlorophyll synthesis pathway, BchC  29.15 
 
 		 312 aa  47  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.754242 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2008  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  24.77 
 
 		 337 aa  47  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.590492  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4330  alcohol dehydrogenase  26.57 
 
 		 342 aa  46.2  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0511391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1611  chlorophyll synthesis pathway, BchC  28.61 
 
 		 327 aa  46.2  0.0008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3903  zinc-binding alcohol dehydrogenase  27.66 
 
 		 364 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0607  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  26 
 
 		 324 aa  45.8  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.420026  normal  0.0271059 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3977  alcohol dehydrogenase  27.66 
 
 		 364 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0808  alcohol dehydrogenase  21.27 
 
 		 712 aa  45.4  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0609  alcohol dehydrogenase  30.5 
 
 		 352 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0295083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28190  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  27.34 
 
 		 345 aa  45.8  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23420  putative zinc-binding dehydrogenase  22.66 
 
 		 722 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123826  hitchhiker  0.00977209 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2070  alcohol dehydrogenase  26.71 
 
 		 336 aa  44.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2124  L-idonate 5-dehydrogenase, NAD-binding  25.6 
 
 		 343 aa  45.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.321081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0893  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  21.28 
 
 		 321 aa  44.7  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4821  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  24.82 
 
 		 344 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111851  normal  0.477759 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1529  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.3 
 
 		 369 aa  44.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.237052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0159  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31 
 
 		 347 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.306594  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0642  alcohol dehydrogenase  31 
 
 		 352 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2224  L-threonine 3-dehydrogenase  26.46 
 
 		 344 aa  44.3  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1249  alcohol dehydrogenase  25.93 
 
 		 335 aa  44.3  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.257646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5476  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.33 
 
 		 335 aa  44.3  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.674809  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2604  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  20.5 
 
 		 308 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000105247  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1223  alcohol dehydrogenase  25.71 
 
 		 335 aa  43.9  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.135954  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1677  alcohol dehydrogenase  25.56 
 
 		 318 aa  43.9  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.966295 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3918  alcohol dehydrogenase  28.18 
 
 		 364 aa  43.5  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0508514  normal  0.13428 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0038  alcohol dehydrogenase  25.85 
 
 		 340 aa  43.5  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2700  L-threonine 3-dehydrogenase  26.36 
 
 		 345 aa  43.5  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3155  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  24.66 
 
 		 342 aa  43.5  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2661  L-threonine 3-dehydrogenase  26.57 
 
 		 346 aa  43.1  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01200  conserved hypothetical protein  29.93 
 
 		 358 aa  43.1  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3364  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  27.13 
 
 		 367 aa  43.1  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0600954 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1644  zinc-binding alcohol dehydrogenase  23.35 
 
 		 341 aa  42.7  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.14571  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1670  alcohol dehydrogenase  23.35 
 
 		 341 aa  42.7  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1619  alcohol dehydrogenase  23.35 
 
 		 341 aa  42.7  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2235  alcohol dehydrogenase  23.35 
 
 		 341 aa  42.7  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2002  putative dehydrogenase  25.97 
 
 		 343 aa  43.1  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>