More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0388 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS02345  hypothetical protein  52.62 
 
 		 713 aa  753    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.435396 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0388  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 721 aa  1493    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.702394  normal  0.542029 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23420  putative zinc-binding dehydrogenase  53.75 
 
 		 722 aa  766    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123826  hitchhiker  0.00977209 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0808  alcohol dehydrogenase  54.75 
 
 		 712 aa  796    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4070  oxidoreductase domain protein  44.38 
 
 		 734 aa  628  1e-179  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3331  alcohol dehydrogenase  46.74 
 
 		 719 aa  624  1e-177  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.127059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4033  oxidoreductase domain protein  42.68 
 
 		 699 aa  553  1e-156  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0424149 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3794  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40.11 
 
 		 719 aa  536  1e-151  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1685  alcohol dehydrogenase  38.17 
 
 		 724 aa  488  1e-136  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2307  oxidoreductase domain-containing protein  40.91 
 
 		 715 aa  479  1e-134  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3872  oxidoreductase domain protein  38.72 
 
 		 715 aa  456  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2162  oxidoreductase domain-containing protein  36.64 
 
 		 798 aa  412  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1306  oxidoreductase-like  36.58 
 
 		 747 aa  399  1e-109  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1232  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.91 
 
 		 343 aa  110  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4072  oxidoreductase domain protein  28.48 
 
 		 365 aa  96.7  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.946495 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4509  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  25.6 
 
 		 343 aa  96.7  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  25.62 
 
 		 334 aa  94.4  7e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3165  oxidoreductase-like  28.02 
 
 		 322 aa  92  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1029  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.04 
 
 		 356 aa  91.7  5e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0432101  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3133  alcohol dehydrogenase  27.99 
 
 		 329 aa  90.5  9e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2295  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.31 
 
 		 341 aa  88.2  5e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710088  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  32.09 
 
 		 337 aa  87.8  7e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2332  oxidoreductase, NAD-binding  26.32 
 
 		 341 aa  87  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.155666  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0299  myo-inositol 2-dehydrogenase  26.9 
 
 		 341 aa  87  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146369  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2511  NAD-binding oxidoreductase  26.32 
 
 		 341 aa  87  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0667  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.88 
 
 		 357 aa  86.3  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.559998 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2412  inositol 2-dehydrogenase  26.46 
 
 		 336 aa  85.9  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.17702 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2251  oxidoreductase  25.76 
 
 		 341 aa  84  0.000000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00205292  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3470  oxidoreductase domain protein  27.98 
 
 		 328 aa  84  0.000000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1623  hypothetical protein  24.09 
 
 		 316 aa  83.6  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2526  oxidoreductase, NAD-binding  27.68 
 
 		 287 aa  82.8  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000937145 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4846  alcohol dehydrogenase  26.65 
 
 		 346 aa  82  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.475925  normal  0.0130408 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1618  hypothetical protein  23.43 
 
 		 316 aa  81.6  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0681  oxidoreductase domain-containing protein  22.84 
 
 		 329 aa  80.9  0.00000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.109969 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5213  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.16 
 
 		 354 aa  80.9  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000291101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  26.69 
 
 		 376 aa  80.1  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2059  sorbitol dehydrogenase  24.69 
 
 		 347 aa  80.5  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.642486  hitchhiker  0.0031409 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  29.35 
 
 		 353 aa  80.5  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1103  oxidoreductase domain-containing protein  24.08 
 
 		 323 aa  79.3  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2642  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  30.05 
 
 		 357 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0311111  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0085  myo-inositol 2-dehydrogenase  25.2 
 
 		 335 aa  79.7  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5698  Inositol 2-dehydrogenase  24.44 
 
 		 342 aa  79.7  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3701  oxidoreductase domain protein  27.13 
 
 		 335 aa  79.7  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1619  alcohol dehydrogenase  31.62 
 
 		 341 aa  79  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2784  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  30.05 
 
 		 341 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95808  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2235  alcohol dehydrogenase  31.62 
 
 		 341 aa  79  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0132  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  30.05 
 
 		 341 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1046  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  30.05 
 
 		 341 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0565  alcohol dehydrogenase  31.62 
 
 		 341 aa  79  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.678248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3148  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  26.98 
 
 		 373 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1644  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.62 
 
 		 341 aa  79  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.14571  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0660  alcohol dehydrogenase  31.62 
 
 		 341 aa  79  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2276  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.27 
 
 		 388 aa  79  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5628  L-threonine 3-dehydrogenase  31.62 
 
 		 341 aa  79  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1670  alcohol dehydrogenase  31.62 
 
 		 341 aa  79  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0157  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  30.05 
 
 		 341 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0490  alcohol dehydrogenase  31.62 
 
 		 341 aa  79  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.283915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1300  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  30.05 
 
 		 341 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2189  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  23.9 
 
 		 346 aa  78.6  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2419  oxidoreductase domain protein  28.32 
 
 		 332 aa  78.6  0.0000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3283  inositol 2-dehydrogenase  26.11 
 
 		 331 aa  78.2  0.0000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00244107 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1576  dehydrogenase  25.66 
 
 		 336 aa  78.2  0.0000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0256793  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1677  alcohol dehydrogenase  25.23 
 
 		 318 aa  78.2  0.0000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.966295 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2577  zinc-binding alcohol dehydrogenase  28.7 
 
 		 342 aa  77.8  0.0000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0428  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  30.05 
 
 		 341 aa  77.4  0.0000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.364327  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01743  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  23.01 
 
 		 347 aa  77  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.778779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1868  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  23.01 
 
 		 347 aa  77  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000261586  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0075  sorbitol dehydrogenase, putative  25.44 
 
 		 348 aa  77  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1998  sorbitol dehydrogenase  23.01 
 
 		 347 aa  76.6  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.329256  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0984  oxidoreductase domain protein  31.9 
 
 		 371 aa  77  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.915722 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01731  hypothetical protein  23.01 
 
 		 347 aa  77  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.948294  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0626  oxidoreductase domain-containing protein  24.83 
 
 		 334 aa  76.6  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.45032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3928  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  29.51 
 
 		 342 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5867  alcohol dehydrogenase  29.51 
 
 		 342 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.74196  normal  0.798449 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4438  alcohol dehydrogenase  29.51 
 
 		 342 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1137  oxidoreductase domain protein  30.05 
 
 		 371 aa  77  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.985714 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4014  oxidoreductase domain protein  23.79 
 
 		 337 aa  75.9  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1417  sorbitol dehydrogenase  23.01 
 
 		 347 aa  76.6  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1858  alcohol dehydrogenase  23.01 
 
 		 347 aa  76.6  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.368595  hitchhiker  0.0000214432 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2498  sorbitol dehydrogenase  22.59 
 
 		 347 aa  76.3  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.503095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2996  alcohol dehydrogenase  27.71 
 
 		 344 aa  75.5  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0338  oxidoreductase domain-containing protein  29.03 
 
 		 330 aa  74.7  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.10439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4330  alcohol dehydrogenase  28.96 
 
 		 342 aa  73.9  0.000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0511391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1495  oxidoreductase domain-containing protein  23.24 
 
 		 344 aa  73.6  0.00000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0319265  normal  0.994285 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0994  oxidoreductase domain protein  26.6 
 
 		 326 aa  73.6  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3870  alcohol dehydrogenase  28.96 
 
 		 338 aa  73.9  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606639  normal  0.388912 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2234  oxidoreductase domain protein  26.07 
 
 		 354 aa  73.6  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  26.7 
 
 		 385 aa  72.8  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3130  putative propanol-preferring alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  31.01 
 
 		 341 aa  72.8  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.320516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3153  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  25.97 
 
 		 351 aa  72.8  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  23.88 
 
 		 360 aa  73.2  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5133  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  26.91 
 
 		 373 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  23.88 
 
 		 360 aa  73.2  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  28.87 
 
 		 363 aa  72.8  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5726  alcohol dehydrogenase  26.91 
 
 		 373 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6432  oxidoreductase domain protein  22.96 
 
 		 327 aa  73.2  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.317198  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0898  oxidoreductase domain-containing protein  27.19 
 
 		 353 aa  73.2  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503756 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0056  inositol 2-dehydrogenase  25.38 
 
 		 389 aa  73.2  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4044  oxidoreductase domain protein  27.92 
 
 		 338 aa  72.4  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.568923  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00100  L-arabinitol 4-dehydrogenase, putative  26.18 
 
 		 392 aa  72.4  0.00000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.603371  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>