178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3598 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_3598  putative dehydrogenase  100 
 
 
337 aa  659    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.927271  hitchhiker  0.00450633 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1178  putative dehydrogenase  57.81 
 
 
325 aa  363  2e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2745  putative dehydrogenase  59.63 
 
 
337 aa  357  9.999999999999999e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000542225  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0795  dehydrogenase  52.48 
 
 
340 aa  337  1.9999999999999998e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1678  putative dehydrogenase  56.52 
 
 
346 aa  325  9e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2453  putative dehydrogenase  55.45 
 
 
332 aa  322  7e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0642  dehydrogenase  52.19 
 
 
342 aa  321  9.999999999999999e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0315  putative dehydrogenase  55.35 
 
 
329 aa  311  9e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0767  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  55.83 
 
 
328 aa  311  9e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1679  dehydrogenase  55.8 
 
 
360 aa  276  3e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.445125  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2751  hypothetical protein  56.56 
 
 
326 aa  265  7e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.794948  hitchhiker  0.00325802 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2564  hypothetical protein  55.62 
 
 
326 aa  259  3e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.172199 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2316  alcohol dehydrogenase  52.51 
 
 
334 aa  255  7e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.947925  normal  0.395379 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4664  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  51.14 
 
 
307 aa  251  9.000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0202543  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1078  putative dehydrogenase  37.73 
 
 
343 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4783  alcohol dehydrogenase  52.6 
 
 
289 aa  189  4e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.230491 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1999  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.59 
 
 
336 aa  152  8.999999999999999e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.131571  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1232  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.93 
 
 
343 aa  149  6e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2577  zinc-binding alcohol dehydrogenase  38.92 
 
 
342 aa  149  9e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0522  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.19 
 
 
338 aa  148  2.0000000000000003e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0876145  normal  0.61344 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3514  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.46 
 
 
345 aa  142  9.999999999999999e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.272765  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_38005  predicted protein  29.79 
 
 
1005 aa  113  4.0000000000000004e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2207  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.23 
 
 
367 aa  89  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0588831  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0614  alcohol dehydrogenase  28.46 
 
 
318 aa  86.7  5e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0116847  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1296  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.87 
 
 
369 aa  83.6  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0633  alcohol dehydrogenase  27.69 
 
 
317 aa  83.2  0.000000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1628  zinc-type alcohol dehydrogenase  26.48 
 
 
341 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1646  zinc-type alcohol dehydrogenase  26.48 
 
 
341 aa  76.6  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1654  zinc-type alcohol dehydrogenase  26.48 
 
 
341 aa  75.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.959787  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1794  zinc-type alcohol dehydrogenase  26.48 
 
 
341 aa  75.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2180  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  25.86 
 
 
327 aa  75.1  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1713  zinc-type alcohol dehydrogenase  26.2 
 
 
341 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3696  chlorophyll synthesis pathway, BchC  38.25 
 
 
312 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.503769  hitchhiker  0.00324331 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2713  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.42 
 
 
333 aa  66.2  0.0000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5611  glycosyl transferase group 1  26.94 
 
 
1079 aa  65.9  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.115035 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1611  chlorophyll synthesis pathway, BchC  34.16 
 
 
327 aa  63.5  0.000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3336  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  25.51 
 
 
318 aa  61.6  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0588906 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3492  hypothetical protein  27.22 
 
 
342 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835811  normal  0.583011 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4724  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.42 
 
 
348 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.383474  normal  0.446449 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2981  2-desacetyl-2-hydroxyethyl bacteriochlorophyllide  30.74 
 
 
317 aa  59.7  0.00000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.383171  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4677  alcohol dehydrogenase  29.39 
 
 
347 aa  59.3  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15095  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2642  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  24.22 
 
 
308 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00170598  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2606  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  23.77 
 
 
308 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000263757 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1677  alcohol dehydrogenase  27.92 
 
 
318 aa  58.5  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.966295 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3128  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.74 
 
 
328 aa  57.4  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3592  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.21 
 
 
347 aa  57.4  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.167683  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2331  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  23.32 
 
 
308 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.528911  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0667  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.55 
 
 
357 aa  57  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.559998 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4187  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.55 
 
 
335 aa  56.2  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3261  alcohol dehydrogenase  30.1 
 
 
327 aa  55.8  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0255944 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3133  alcohol dehydrogenase  27.87 
 
 
329 aa  56.2  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5686  glycosyl transferase group 1  27.03 
 
 
1080 aa  55.8  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2412  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  23.32 
 
 
308 aa  54.7  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0431733  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2588  alcohol dehydrogenase  23.32 
 
 
308 aa  54.7  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1258  alcohol dehydrogenase  24.82 
 
 
344 aa  54.7  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0672332  normal  0.983976 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1833  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  24.39 
 
 
354 aa  53.5  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2604  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  22.42 
 
 
308 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000105247  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2374  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  23.21 
 
 
317 aa  53.1  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000195271  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0178  alcohol dehydrogenase  27.25 
 
 
336 aa  52.8  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2051  chlorophyll synthesis pathway, BchC  30.86 
 
 
315 aa  52.8  0.000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0614897 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1941  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.8 
 
 
317 aa  52.8  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01050  sorbitol dehydrogenase, putative  25.7 
 
 
379 aa  52.4  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.917438  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1062  zinc-binding alcohol dehydrogenase  38.15 
 
 
319 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0715122  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3460  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  25.07 
 
 
354 aa  51.6  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00073426  hitchhiker  0.00463895 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2561  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  23.21 
 
 
308 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0153  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.62 
 
 
323 aa  51.2  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.568823  normal  0.158485 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2063  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  28.04 
 
 
322 aa  51.2  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.860675 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2323  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  22.87 
 
 
317 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07420  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  25.99 
 
 
357 aa  51.2  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1190  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.84 
 
 
319 aa  50.4  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.842933  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0944  L-idonate 5-dehydrogenase  22.59 
 
 
350 aa  50.1  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.272351  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2851  chlorophyll synthesis pathway, BchC  32.77 
 
 
312 aa  49.7  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.754242 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3224  alcohol dehydrogenase  29.11 
 
 
317 aa  49.3  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.234723  normal  0.02058 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1113  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.57 
 
 
320 aa  49.3  0.00009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1121  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.26 
 
 
319 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00941244  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0270  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  23.19 
 
 
336 aa  48.9  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2008  alcohol dehydrogenase protein  21.56 
 
 
364 aa  48.9  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0159  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  29.95 
 
 
347 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.306594  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0642  alcohol dehydrogenase  29.95 
 
 
352 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21210  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  36.97 
 
 
336 aa  48.9  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2124  L-idonate 5-dehydrogenase, NAD-binding  29.35 
 
 
343 aa  49.3  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.321081  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2765  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family superfamily  22.87 
 
 
213 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000378311 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3303  zinc-binding dehydrogenase family protein  26.17 
 
 
338 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0731443 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1421  alcohol dehydrogenase  28.16 
 
 
343 aa  48.5  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3153  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  25.11 
 
 
351 aa  48.1  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000625  zinc-binding dehydrogenase  26.89 
 
 
352 aa  48.1  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0609  alcohol dehydrogenase  29.95 
 
 
352 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0295083  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02510  alcohol dehydrogenase, putative  28.3 
 
 
357 aa  47.4  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.886451  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3728  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  29.95 
 
 
352 aa  47.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.854934  normal  0.447633 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0021  Zn-binding dehydrogenase  23.44 
 
 
352 aa  47.4  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0554419  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3852  alcohol dehydrogenase  25.9 
 
 
365 aa  47.8  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4169  alcohol dehydrogenase  31.4 
 
 
420 aa  47.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.235444  normal  0.177218 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2512  alcohol dehydrogenase  30.54 
 
 
346 aa  47.4  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.881464  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0994  alcohol dehydrogenase  25.61 
 
 
318 aa  47.4  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1356  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  24.39 
 
 
366 aa  47  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0299  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  23.19 
 
 
336 aa  47  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3943  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.65 
 
 
336 aa  47  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0142481  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2729  chlorophyll synthesis pathway, BchC  32.2 
 
 
312 aa  47  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.195631  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3565  alcohol dehydrogenase  28.14 
 
 
345 aa  46.6  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1685  alcohol dehydrogenase  34.78 
 
 
724 aa  46.2  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>