More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_2008 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_2008  alcohol dehydrogenase protein  100 
 
 
364 aa  742    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0967  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  79.34 
 
 
366 aa  624  1e-178  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.635093  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1356  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  79.89 
 
 
366 aa  624  1e-178  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1049  alcohol dehydrogenase  79.34 
 
 
366 aa  624  1e-178  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.050805 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3852  alcohol dehydrogenase  79.61 
 
 
365 aa  625  1e-178  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3188  alcohol dehydrogenase  77.9 
 
 
366 aa  608  1e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.182482  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07420  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  78.3 
 
 
357 aa  598  1e-170  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3465  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  76.58 
 
 
366 aa  599  1e-170  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.901244  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5645  alcohol dehydrogenase  74.18 
 
 
357 aa  556  1e-157  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.419975 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2137  alcohol dehydrogenase  67.86 
 
 
351 aa  508  1e-143  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0423941 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2064  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  69.23 
 
 
357 aa  509  1e-143  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3346  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  66.48 
 
 
357 aa  497  1e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.62296  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0669  alcohol dehydrogenase  67.59 
 
 
374 aa  496  1e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.704397  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3514  alcohol dehydrogenase  67.23 
 
 
373 aa  488  1e-137  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2536  zinc-binding alcohol dehydrogenase  65.38 
 
 
357 aa  483  1e-135  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.563542  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3032  alcohol dehydrogenase  63.46 
 
 
357 aa  475  1e-133  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.289929  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0203  zinc-binding alcohol dehydrogenase  64.01 
 
 
357 aa  476  1e-133  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0325811 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0265  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  65.25 
 
 
371 aa  473  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.901967  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1833  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.33 
 
 
354 aa  336  3.9999999999999995e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3460  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.45 
 
 
354 aa  318  7.999999999999999e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00073426  hitchhiker  0.00463895 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4352  alcohol dehydrogenase  44.32 
 
 
354 aa  311  2e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2240  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.56 
 
 
355 aa  310  2e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0360217 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0548  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.01 
 
 
350 aa  286  4e-76  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0899798  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0435  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  42.62 
 
 
351 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.692768  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2188  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.18 
 
 
349 aa  270  2e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.228893  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1727  zinc-binding dehydrogenase  38.08 
 
 
352 aa  239  5e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2770  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.13 
 
 
356 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.656616 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0322  alcohol dehydrogenase  38.52 
 
 
347 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.65143  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0570  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.09 
 
 
346 aa  226  4e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3075  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  37.91 
 
 
347 aa  226  4e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1860  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  36.61 
 
 
346 aa  225  7e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3657  alcohol dehydrogenase  38 
 
 
347 aa  223  4e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.573189  normal  0.2926 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0653  alcohol dehydrogenase  35.44 
 
 
352 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5564  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.15 
 
 
346 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.175264  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1399  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.59 
 
 
352 aa  219  7.999999999999999e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2344  alcohol dehydrogenase (NADP+)  34.46 
 
 
352 aa  217  2e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.100089  normal  0.0840348 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1565  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  36.72 
 
 
349 aa  217  2e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.965017  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1160  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  36.16 
 
 
346 aa  216  5e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1718  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  36.16 
 
 
346 aa  216  5e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0709  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  36.16 
 
 
346 aa  216  5e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.470076  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2034  hypothetical protein  34.6 
 
 
346 aa  216  5e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2432  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  36.16 
 
 
346 aa  216  5e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0753  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  36.16 
 
 
346 aa  216  5e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.574599  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1234  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  36.16 
 
 
346 aa  216  5e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.61884  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3962  alcohol dehydrogenase  36.72 
 
 
351 aa  214  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5816  alcohol dehydrogenase  34.29 
 
 
346 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.136095 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0924  putative zinc-dependent alcohol dehydrogenase (oxidoreductase)  36.78 
 
 
345 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.175832  normal  0.685768 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4415  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.88 
 
 
345 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.742114  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4548  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.88 
 
 
355 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00643704 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4290  alcohol dehydrogenase  36.08 
 
 
346 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.590215 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1334  alcohol dehydrogenase  35.98 
 
 
344 aa  213  5.999999999999999e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0194  zinc-dependent alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  35.98 
 
 
345 aa  211  1e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1637  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.07 
 
 
351 aa  211  1e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000634163  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4879  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.16 
 
 
346 aa  211  2e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.539752  normal  0.655263 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5892  alcohol dehydrogenase  35.13 
 
 
346 aa  211  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.032769  normal  0.939128 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3822  alcohol dehydrogenase  35.25 
 
 
346 aa  211  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.529285 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4997  alcohol dehydrogenase  36.16 
 
 
348 aa  210  4e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0219  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.07 
 
 
350 aa  210  4e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1928  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.99 
 
 
370 aa  208  9e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1415  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.21 
 
 
352 aa  208  1e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.275014  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1378  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.61 
 
 
352 aa  208  1e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0573  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.49 
 
 
389 aa  206  4e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2090  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.89 
 
 
351 aa  206  4e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000167964 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1827  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.77 
 
 
345 aa  205  9e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0642635 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4901  alcohol dehydrogenase  35.37 
 
 
360 aa  204  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1091  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  36.57 
 
 
342 aa  204  2e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1221  alcohol dehydrogenase  36.86 
 
 
343 aa  202  8e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0764  hypothetical protein  33.52 
 
 
357 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0197136 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1246  zinc-type alcohol dehydrogenase  34.77 
 
 
385 aa  200  3e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.939827  normal  0.312443 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1228  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.07 
 
 
352 aa  198  1.0000000000000001e-49  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.966969 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0041  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34.66 
 
 
405 aa  198  1.0000000000000001e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.950338 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1619  alcohol dehydrogenase  32.56 
 
 
384 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.682346 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2366  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.9 
 
 
347 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.0010665  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1073  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34.35 
 
 
351 aa  197  3e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1089  alcohol dehydrogenase  34.35 
 
 
351 aa  197  3e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.25524  normal  0.164937 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4200  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.1 
 
 
385 aa  194  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1380  alcohol dehydrogenase  34.19 
 
 
348 aa  194  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.378076  normal  0.439071 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0139  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.46 
 
 
401 aa  192  1e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4500  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.94 
 
 
392 aa  191  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.658078  normal  0.320847 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0165  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.28 
 
 
389 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0122  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.2 
 
 
401 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.566245 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0553  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.08 
 
 
382 aa  189  8e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.81642  hitchhiker  0.000850612 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5446  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.66 
 
 
392 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.715601  normal  0.534231 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0010  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.69 
 
 
346 aa  186  4e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.133832  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1352  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.57 
 
 
388 aa  186  5e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6246  alcohol dehydrogenase  32.24 
 
 
389 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.829786 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1713  alcohol dehydrogenase  36.29 
 
 
343 aa  184  2.0000000000000003e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.738221  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5047  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.82 
 
 
385 aa  183  4.0000000000000006e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557083  hitchhiker  0.00205277 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1100  alcohol dehydrogenase  37.68 
 
 
299 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0318515  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2540  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.56 
 
 
384 aa  180  4e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.14774  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3120  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.88 
 
 
410 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1112  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.44 
 
 
351 aa  179  8e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.257407  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5582  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.25 
 
 
391 aa  179  9e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.351593  normal  0.119261 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3148  putative alcohol dehydrogenase  32.16 
 
 
415 aa  178  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.559418  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3396  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.06 
 
 
393 aa  178  1e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2636  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.56 
 
 
384 aa  179  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2370  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.25 
 
 
389 aa  178  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.456638  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2283  alcohol dehydrogenase  30.85 
 
 
422 aa  177  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0243543  hitchhiker  0.000541864 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5445  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.99 
 
 
390 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.430041  normal  0.349478 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4498  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.16 
 
 
389 aa  177  3e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.709145 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>