162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0315 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0315  putative dehydrogenase  100 
 
 		 329 aa  644    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2745  putative dehydrogenase  67.92 
 
 		 337 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000542225  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1178  putative dehydrogenase  58.68 
 
 		 325 aa  362  5.0000000000000005e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1679  dehydrogenase  69.14 
 
 		 360 aa  355  5.999999999999999e-97  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.445125  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0795  dehydrogenase  54.89 
 
 		 340 aa  340  2e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2564  hypothetical protein  68.24 
 
 		 326 aa  332  5e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.172199 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2751  hypothetical protein  68.87 
 
 		 326 aa  328  6e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.794948  hitchhiker  0.00325802 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0642  dehydrogenase  54.89 
 
 		 342 aa  324  1e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2453  putative dehydrogenase  53.89 
 
 		 332 aa  312  4.999999999999999e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1678  putative dehydrogenase  52.89 
 
 		 346 aa  303  3.0000000000000004e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3598  putative dehydrogenase  55.35 
 
 		 337 aa  292  6e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.927271  hitchhiker  0.00450633 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0767  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  53.56 
 
 		 328 aa  287  2e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4664  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  51.69 
 
 		 307 aa  250  2e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0202543  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2316  alcohol dehydrogenase  47.63 
 
 		 334 aa  238  1e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.947925  normal  0.395379 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1078  putative dehydrogenase  37.89 
 
 		 343 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4783  alcohol dehydrogenase  49.65 
 
 		 289 aa  176  5e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.230491 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1232  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.54 
 
 		 343 aa  155  6e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1999  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.35 
 
 		 336 aa  150  2e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.131571  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0522  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.44 
 
 		 338 aa  138  1e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0876145  normal  0.61344 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3514  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.73 
 
 		 345 aa  127  2.0000000000000002e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.272765  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2577  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.05 
 
 		 342 aa  122  7e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_38005  predicted protein  30.99 
 
 		 1005 aa  120  3.9999999999999996e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2207  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.09 
 
 		 367 aa  87  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0588831  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5686  glycosyl transferase group 1  28.05 
 
 		 1080 aa  80.9  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5611  glycosyl transferase group 1  29.61 
 
 		 1079 aa  78.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.115035 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0667  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.61 
 
 		 357 aa  62.8  0.000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.559998 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4724  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.14 
 
 		 348 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.383474  normal  0.446449 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3133  alcohol dehydrogenase  28.94 
 
 		 329 aa  60.1  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4677  alcohol dehydrogenase  31.23 
 
 		 347 aa  59.7  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0607  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  28.86 
 
 		 324 aa  59.3  0.00000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.420026  normal  0.0271059 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0049  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  24.64 
 
 		 350 aa  58.2  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4070  oxidoreductase domain protein  28.51 
 
 		 734 aa  58.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2180  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  27.97 
 
 		 327 aa  57.4  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1685  alcohol dehydrogenase  38.3 
 
 		 724 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0808  alcohol dehydrogenase  22.41 
 
 		 712 aa  57.8  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1677  alcohol dehydrogenase  25.16 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.966295 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1296  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.97 
 
 		 369 aa  56.6  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3331  alcohol dehydrogenase  31.72 
 
 		 719 aa  54.7  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.127059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0388  oxidoreductase domain protein  23.34 
 
 		 721 aa  54.7  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.702394  normal  0.542029 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1836  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.98 
 
 		 350 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1883  alcohol dehydrogenase  31.98 
 
 		 350 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1817  alcohol dehydrogenase  31.98 
 
 		 350 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.304058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2220  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.99 
 
 		 343 aa  53.1  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.135715 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1540  alcohol dehydrogenase  28.45 
 
 		 336 aa  53.1  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.931266 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1949  alcohol dehydrogenase  27.82 
 
 		 323 aa  52.8  0.000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0237239  hitchhiker  9.46914e-17 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0614  alcohol dehydrogenase  25.87 
 
 		 318 aa  52.8  0.000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0116847  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3592  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.55 
 
 		 347 aa  52  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.167683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0598  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.09 
 
 		 314 aa  52.4  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.122264  normal  0.243738 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0388  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  24.81 
 
 		 344 aa  52.4  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00875101  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2331  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  24.47 
 
 		 308 aa  52  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.528911  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1527  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  25.36 
 
 		 356 aa  51.2  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23420  putative zinc-binding dehydrogenase  27.32 
 
 		 722 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123826  hitchhiker  0.00977209 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2008  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.39 
 
 		 337 aa  50.8  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.590492  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3336  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  24.23 
 
 		 318 aa  50.4  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0588906 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2307  oxidoreductase domain-containing protein  31.05 
 
 		 715 aa  50.4  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5713  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.21 
 
 		 340 aa  49.7  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.351778 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2451  alcohol dehydrogenase  31.82 
 
 		 355 aa  49.7  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0880  alcohol dehydrogenase  26.98 
 
 		 351 aa  49.7  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.173388  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2606  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  24.69 
 
 		 308 aa  49.3  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000263757 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3921  alcohol dehydrogenase  30.6 
 
 		 317 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02345  hypothetical protein  25.81 
 
 		 713 aa  48.1  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.435396 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1644  zinc-binding alcohol dehydrogenase  28.77 
 
 		 341 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.14571  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5628  L-threonine 3-dehydrogenase  28.77 
 
 		 341 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1670  alcohol dehydrogenase  28.77 
 
 		 341 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0490  alcohol dehydrogenase  28.77 
 
 		 341 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.283915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1619  alcohol dehydrogenase  28.77 
 
 		 341 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2235  alcohol dehydrogenase  28.77 
 
 		 341 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0565  alcohol dehydrogenase  28.77 
 
 		 341 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.678248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0660  alcohol dehydrogenase  28.77 
 
 		 341 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0547  alcohol dehydrogenase  31.82 
 
 		 361 aa  48.5  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.986986 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2517  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.78 
 
 		 335 aa  48.5  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0633  alcohol dehydrogenase  25.91 
 
 		 317 aa  48.5  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0885  alcohol dehydrogenase  23.85 
 
 		 333 aa  48.1  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4042  6-hydroxycyclohex-1-ene-1-carbonyl-CoA dehydrogenase  30.97 
 
 		 355 aa  47.4  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2958  L-threonine 3-dehydrogenase  33.33 
 
 		 345 aa  47.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.108215  normal  0.634974 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1516  alcohol dehydrogenase  26.95 
 
 		 328 aa  47.8  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.997072  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5671  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.47 
 
 		 343 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3128  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.29 
 
 		 328 aa  47.4  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0173  alcohol dehydrogenase  27.57 
 
 		 337 aa  47.4  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.976128  normal  0.272839 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1628  zinc-type alcohol dehydrogenase  26.2 
 
 		 341 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4094  alcohol dehydrogenase  29.27 
 
 		 358 aa  47.4  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.958788  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2729  chlorophyll synthesis pathway, BchC  32.31 
 
 		 312 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.195631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3696  chlorophyll synthesis pathway, BchC  35.58 
 
 		 312 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.503769  hitchhiker  0.00324331 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1096  alcohol dehydrogenase  28.17 
 
 		 323 aa  47  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.247739  hitchhiker  0.00137607 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4033  oxidoreductase domain protein  24.63 
 
 		 699 aa  47  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0424149 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2642  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  26.02 
 
 		 308 aa  47  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00170598  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02400  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  29.61 
 
 		 345 aa  46.6  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.242832  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4187  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.61 
 
 		 335 aa  47  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4221  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.76 
 
 		 346 aa  46.6  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.41128  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2636  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  25 
 
 		 340 aa  46.6  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108984  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5063  alcohol dehydrogenase  25.27 
 
 		 347 aa  46.6  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.724577  normal  0.863659 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2851  chlorophyll synthesis pathway, BchC  31.44 
 
 		 312 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.754242 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2412  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  24.27 
 
 		 308 aa  46.2  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0431733  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2588  alcohol dehydrogenase  24.27 
 
 		 308 aa  46.2  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4598  putative dehydrogenase  26.42 
 
 		 343 aa  46.2  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.703201 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3155  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.34 
 
 		 342 aa  46.2  0.0007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4821  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.18 
 
 		 344 aa  46.2  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111851  normal  0.477759 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1903  phosphonate catabolism associated alcohol dehydrogenase  29.85 
 
 		 387 aa  45.8  0.0009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1269  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  25.5 
 
 		 340 aa  45.8  0.0009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0038  alcohol dehydrogenase  25.48 
 
 		 340 aa  45.8  0.0009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>