More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5713 on replicon NC_012853
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012853  Rleg_5713  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  100 
 
 		 340 aa  695    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.351778 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0127  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.7 
 
 		 345 aa  129  6e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0293  L-threonine 3-dehydrogenase  28.32 
 
 		 347 aa  126  6e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1123  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.3 
 
 		 353 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2698  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  30.3 
 
 		 364 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1132  alcohol dehydrogenase  30.3 
 
 		 353 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02437  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  30.3 
 
 		 353 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02401  hypothetical protein  30.3 
 
 		 353 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2697  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  30.3 
 
 		 364 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2830  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  30.3 
 
 		 364 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0523  alcohol dehydrogenase  26.52 
 
 		 350 aa  115  6.9999999999999995e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0780  L-threonine 3-dehydrogenase  29.57 
 
 		 348 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1810  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  30.66 
 
 		 378 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0364  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  30.66 
 
 		 378 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2072  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  30.66 
 
 		 378 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0808  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  30.66 
 
 		 378 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1099  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  30.66 
 
 		 378 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.488512  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1548  alcohol dehydrogenase  28.24 
 
 		 350 aa  111  2.0000000000000002e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0106468  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0459  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  30.39 
 
 		 378 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.479531  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1795  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  30.39 
 
 		 378 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.208532  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5768  alcohol dehydrogenase  36.05 
 
 		 342 aa  108  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5447  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.74 
 
 		 350 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1325  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.16 
 
 		 354 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.614702  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2240  zinc-binding alcohol dehydrogenase  27.37 
 
 		 355 aa  107  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0360217 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3845  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.16 
 
 		 354 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.650761  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4523  alcohol dehydrogenase  31.16 
 
 		 365 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7304  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  29.33 
 
 		 356 aa  106  7e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.554386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5781  alcohol dehydrogenase  30.8 
 
 		 354 aa  106  7e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.110473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3920  L-threonine 3-dehydrogenase  25.36 
 
 		 350 aa  105  8e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.344166  normal  0.087716 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1530  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.01 
 
 		 367 aa  105  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0540116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1718  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.01 
 
 		 346 aa  105  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.271059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2593  alcohol dehydrogenase  30.64 
 
 		 362 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0149814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2554  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  30.64 
 
 		 362 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4226  alcohol dehydrogenase  28.81 
 
 		 352 aa  105  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2599  alcohol dehydrogenase  30.64 
 
 		 362 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.139182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0154  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  26.82 
 
 		 356 aa  104  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7277  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  27.27 
 
 		 351 aa  104  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4931  alcohol dehydrogenase  27.3 
 
 		 337 aa  104  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0698  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.52 
 
 		 349 aa  103  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4160  L-threonine 3-dehydrogenase  26.71 
 
 		 342 aa  103  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0175  L-threonine 3-dehydrogenase  27.86 
 
 		 341 aa  103  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.348381  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0119  L-threonine 3-dehydrogenase  26.76 
 
 		 341 aa  103  4e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2565  L-threonine 3-dehydrogenase  28.77 
 
 		 354 aa  103  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10580  Zn-dependent alcohol dehydrogenase, class III  29.71 
 
 		 364 aa  103  4e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.107313  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0064  L-threonine 3-dehydrogenase  27.14 
 
 		 341 aa  103  6e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00353875  unclonable  0.000000014689 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1306  alcohol dehydrogenase  28.24 
 
 		 348 aa  102  6e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1995  L-threonine 3-dehydrogenase  27.7 
 
 		 348 aa  102  6e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.271324  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0530  L-threonine 3-dehydrogenase  26.81 
 
 		 345 aa  102  7e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0201  L-threonine 3-dehydrogenase  27.7 
 
 		 342 aa  102  7e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4132  alcohol dehydrogenase  30.07 
 
 		 364 aa  102  9e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00103108  normal  0.177919 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4416  alcohol dehydrogenase  29.82 
 
 		 354 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0164512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2996  alcohol dehydrogenase  33.19 
 
 		 344 aa  102  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3988  L-threonine 3-dehydrogenase  26.47 
 
 		 341 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3907  L-threonine 3-dehydrogenase  26.47 
 
 		 341 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.305957 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3926  L-threonine 3-dehydrogenase  26.47 
 
 		 341 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4341  L-threonine 3-dehydrogenase  26.98 
 
 		 341 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.183698  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3993  L-threonine 3-dehydrogenase  26.39 
 
 		 341 aa  101  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00526956  normal  0.0228585 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4033  L-threonine 3-dehydrogenase  26.47 
 
 		 341 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1376  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.77 
 
 		 363 aa  100  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.482993 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4094  L-threonine 3-dehydrogenase  26.47 
 
 		 341 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3902  L-threonine 3-dehydrogenase  26.39 
 
 		 341 aa  101  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00646337  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1804  alcohol dehydrogenase  27.56 
 
 		 349 aa  100  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0097  L-threonine 3-dehydrogenase  26.79 
 
 		 341 aa  100  3e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0317813  hitchhiker  0.00132916 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00067  L-threonine 3-dehydrogenase  27.14 
 
 		 341 aa  100  4e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4286  L-threonine 3-dehydrogenase  26.69 
 
 		 341 aa  100  4e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000588728 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3901  L-threonine 3-dehydrogenase  26.39 
 
 		 341 aa  100  4e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00409651  normal  0.55097 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4105  L-threonine 3-dehydrogenase  26.39 
 
 		 341 aa  100  4e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287848  normal  0.406165 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4481  L-threonine 3-dehydrogenase  26.69 
 
 		 341 aa  100  4e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.155025  normal  0.0226787 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0057  L-threonine 3-dehydrogenase  26.69 
 
 		 341 aa  100  4e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0451496  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1631  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.1 
 
 		 335 aa  100  5e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205329  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0626  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.58 
 
 		 348 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.122576  normal  0.0367599 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0146  alcohol dehydrogenase  28.95 
 
 		 345 aa  100  5e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3723  alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  25.5 
 
 		 349 aa  100  5e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1347  alcohol dehydrogenase  27.17 
 
 		 343 aa  99.8  6e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.71457  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4673  L-threonine 3-dehydrogenase  26.1 
 
 		 341 aa  99.4  7e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0449  L-threonine 3-dehydrogenase  28.75 
 
 		 361 aa  99.8  7e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.333655 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3953  alcohol dehydrogenase  29.12 
 
 		 354 aa  99.4  8e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1641  threonine dehydrogenase related Zn-dependent dehydrogenase  30 
 
 		 326 aa  99.4  8e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1825  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  25.57 
 
 		 351 aa  99.4  9e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.700664  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0089  L-threonine 3-dehydrogenase  26.47 
 
 		 341 aa  99  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0006  L-threonine 3-dehydrogenase  26.11 
 
 		 343 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1512  L-threonine 3-dehydrogenase  26.11 
 
 		 343 aa  99  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0841527  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0006  L-threonine 3-dehydrogenase  26.11 
 
 		 343 aa  99  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2180  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  28.19 
 
 		 327 aa  99  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0475  alcohol dehydrogenase  28.16 
 
 		 345 aa  99  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0106  L-threonine 3-dehydrogenase  26.55 
 
 		 341 aa  98.6  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.588963  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2330  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.14 
 
 		 352 aa  99  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.752502  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3939  L-threonine 3-dehydrogenase  26.55 
 
 		 341 aa  99  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.27746  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0885  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.01 
 
 		 351 aa  98.6  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0007  L-threonine 3-dehydrogenase  26.11 
 
 		 343 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.237262  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1152  L-threonine 3-dehydrogenase  26.11 
 
 		 343 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1432  L-threonine 3-dehydrogenase  26.11 
 
 		 343 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.263737  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0006  L-threonine 3-dehydrogenase  26.11 
 
 		 343 aa  99  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.936478  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4631  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  25.43 
 
 		 350 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000566989  hitchhiker  0.000000000000161972 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3944  L-threonine 3-dehydrogenase  27.03 
 
 		 342 aa  98.2  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0919  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.4 
 
 		 351 aa  97.8  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0006  L-threonine 3-dehydrogenase  26.11 
 
 		 343 aa  98.2  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0705  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  25.43 
 
 		 350 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00256645  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0092  L-threonine 3-dehydrogenase  26.18 
 
 		 341 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.212636  normal  0.425053 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3828  L-threonine 3-dehydrogenase  26.18 
 
 		 341 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0267024  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>