More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1825 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A1825  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  100 
 
 
351 aa  709    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.700664  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7277  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  78.63 
 
 
351 aa  568  1e-161  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7304  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  68.26 
 
 
356 aa  502  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.554386  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6852  alcohol dehydrogenase  48.86 
 
 
340 aa  328  8e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0127  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.8 
 
 
345 aa  224  1e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4226  alcohol dehydrogenase  36.1 
 
 
352 aa  206  5e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1123  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.88 
 
 
353 aa  203  3e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2697  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  36.31 
 
 
364 aa  203  3e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2698  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  35.88 
 
 
364 aa  203  3e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02437  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  35.88 
 
 
353 aa  203  4e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02401  hypothetical protein  35.88 
 
 
353 aa  203  4e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1132  alcohol dehydrogenase  35.88 
 
 
353 aa  203  4e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2830  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  36.31 
 
 
364 aa  202  5e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1376  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.14 
 
 
363 aa  189  5e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.482993 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1821  alcohol dehydrogenase  33.81 
 
 
344 aa  185  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00641517  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10900  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  35 
 
 
352 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.867442  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2268  alcohol dehydrogenase  30.25 
 
 
358 aa  150  5e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.396502  hitchhiker  0.0088894 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0742  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  29.97 
 
 
350 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000731787  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0802  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  29.97 
 
 
350 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000206272  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0585  zinc-containing alcohol dehydrogenase, long-chain  29.97 
 
 
350 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0307293  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0584  zinc-containing alcohol dehydrogenase, long-chain  29.97 
 
 
350 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4631  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  29.97 
 
 
350 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000566989  hitchhiker  0.000000000000161972 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0589  alcohol dehydrogenase  29.97 
 
 
350 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00429801  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0705  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  29.97 
 
 
350 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00256645  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0641  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  29.67 
 
 
350 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0730  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  29.67 
 
 
350 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.35905e-47 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0675  alcohol dehydrogenase  29.67 
 
 
350 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000371622  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5308  alcohol dehydrogenase  33.9 
 
 
341 aa  144  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.346008  normal  0.295753 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0885  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.97 
 
 
351 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1719  alcohol dehydrogenase  31.37 
 
 
344 aa  140  3e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5133  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  35.86 
 
 
373 aa  136  5e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4497  alcohol dehydrogenase  35.86 
 
 
373 aa  136  5e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5726  alcohol dehydrogenase  35.86 
 
 
373 aa  136  5e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2224  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.65 
 
 
381 aa  135  8e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1718  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.36 
 
 
346 aa  135  8e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.271059  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3679  alcohol dehydrogenase  35.9 
 
 
367 aa  134  3e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1000  putative alcohol dehydrogenase  34.41 
 
 
352 aa  133  5e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0355  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.55 
 
 
350 aa  133  5e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3148  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.86 
 
 
373 aa  133  6e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5304  alcohol dehydrogenase  35.71 
 
 
373 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.183348  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5001  alcohol dehydrogenase  32.44 
 
 
373 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0919  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.2 
 
 
351 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2647  dehydrogenase  28.12 
 
 
338 aa  129  6e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0114296  normal  0.147618 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1696  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.3 
 
 
344 aa  128  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.558664  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0970  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.91 
 
 
345 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.505298  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3130  putative propanol-preferring alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  32.42 
 
 
341 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.320516  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0196  alcohol dehydrogenase  29.45 
 
 
338 aa  128  1.0000000000000001e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.583804  normal  0.0665338 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0040  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  29.8 
 
 
346 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.992723  normal  0.309585 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0338  alcohol dehydrogenase  28.53 
 
 
351 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0576668  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4330  alcohol dehydrogenase  34.01 
 
 
342 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0511391  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6215  alcohol dehydrogenase  31.4 
 
 
342 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.508121  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0330  2,3-butanediol dehydrogenase  29.34 
 
 
355 aa  126  6e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2642  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  32.31 
 
 
357 aa  126  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0311111  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5870  alcohol dehydrogenase  36.61 
 
 
341 aa  126  7e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.801122  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0132  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.31 
 
 
341 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1300  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.31 
 
 
341 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0157  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.31 
 
 
341 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71630  alcohol dehydrogenase  31.06 
 
 
342 aa  125  9e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.689289  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1967  alcohol dehydrogenase  30.19 
 
 
344 aa  125  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4159  alcohol dehydrogenase  30.63 
 
 
350 aa  125  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.44287  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3540  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.9 
 
 
337 aa  125  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1409  alcohol dehydrogenase  28.9 
 
 
337 aa  124  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0428  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.87 
 
 
341 aa  124  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.364327  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0597  alcohol dehydrogenase  29.19 
 
 
362 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0643205 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3065  alcohol dehydrogenase  29.75 
 
 
338 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.456044 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1166  alcohol dehydrogenase  30.86 
 
 
351 aa  124  3e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.343531  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2793  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.14 
 
 
356 aa  124  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630976  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1821  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.54 
 
 
342 aa  124  3e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.162011 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1046  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.97 
 
 
341 aa  123  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2784  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  31.97 
 
 
341 aa  123  4e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95808  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4416  alcohol dehydrogenase  30.21 
 
 
354 aa  123  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0164512  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3928  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34.35 
 
 
342 aa  124  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1092  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.07 
 
 
351 aa  123  4e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4438  alcohol dehydrogenase  34.35 
 
 
342 aa  124  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5867  alcohol dehydrogenase  34.35 
 
 
342 aa  124  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.74196  normal  0.798449 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1641  alcohol dehydrogenase  31.02 
 
 
343 aa  123  5e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1692  alcohol dehydrogenase  31.02 
 
 
343 aa  123  5e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0556  alcohol dehydrogenase  31.02 
 
 
343 aa  123  5e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.46957  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1668  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.02 
 
 
343 aa  123  5e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0638  alcohol dehydrogenase  31.02 
 
 
343 aa  123  5e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.434534  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3324  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.25 
 
 
350 aa  123  6e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0421123  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0527  alcohol dehydrogenase  31.02 
 
 
343 aa  122  7e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.361888  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2367  alcohol dehydrogenase  33.22 
 
 
344 aa  122  7e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.305861 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0552  2,3-butanediol dehydrogenase  29.19 
 
 
362 aa  122  8e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0742  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  25.53 
 
 
368 aa  122  8e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3953  alcohol dehydrogenase  29.91 
 
 
354 aa  122  9e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0774  alcohol dehydrogenase  30.77 
 
 
342 aa  122  9.999999999999999e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.623956  normal  0.377339 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0591  alcohol dehydrogenase  28.9 
 
 
362 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0120  alcohol dehydrogenase  29.65 
 
 
340 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232442  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5456  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.02 
 
 
343 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.077084  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5853  alcohol dehydrogenase  31.02 
 
 
343 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00833857  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0523  alcohol dehydrogenase  25.71 
 
 
350 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09064  hypothetical protein similar to xylitol dehydrogenase (Broad)  26.55 
 
 
359 aa  121  1.9999999999999998e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.715081 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0272  alcohol dehydrogenase  30.09 
 
 
344 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0210  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  31.52 
 
 
338 aa  121  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.835895  normal  0.242197 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0527  putative Zinc-containing alcohol dehydrogenase  28.92 
 
 
344 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2864  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  28.57 
 
 
359 aa  121  1.9999999999999998e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0732  L-iditol 2-dehydrogenase  26.92 
 
 
348 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3723  alcohol dehydrogenase  28.57 
 
 
380 aa  120  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0788  alcohol dehydrogenase  30.57 
 
 
349 aa  120  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.690483 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>