More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2224 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_2224  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  100 
 
 
381 aa  749    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25570  Zn-dependent alcohol dehydrogenase, class III  61.14 
 
 
381 aa  414  1e-114  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1454  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.62 
 
 
371 aa  276  4e-73  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0251  alcohol dehydrogenase  46.22 
 
 
362 aa  268  1e-70  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0419  alcohol dehydrogenase  46.15 
 
 
362 aa  265  8e-70  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0564389 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1424  alcohol dehydrogenase  41.57 
 
 
360 aa  258  1e-67  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.350206 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1391  alcohol dehydrogenase  45.63 
 
 
362 aa  251  2e-65  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.487045 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0742  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.66 
 
 
368 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1775  putative alcohol dehydrogenase (zinc-binding)  39.55 
 
 
361 aa  212  7.999999999999999e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2469  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.31 
 
 
375 aa  210  3e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.43107  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0338  alcohol dehydrogenase  37.4 
 
 
351 aa  209  5e-53  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0576668  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0396  alcohol dehydrogenase  39.39 
 
 
352 aa  209  6e-53  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4825  putative alcohol dehydrogenase  38.75 
 
 
375 aa  206  5e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0410996  normal  0.464938 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10580  Zn-dependent alcohol dehydrogenase, class III  35.23 
 
 
364 aa  204  2e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.107313  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5201  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  37.84 
 
 
361 aa  203  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0310  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.63 
 
 
348 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5066  alcohol dehydrogenase  38.66 
 
 
366 aa  201  3e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0364575 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1540  alcohol dehydrogenase  35.46 
 
 
376 aa  199  5e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.47275  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2054  alcohol dehydrogenase class III  34.72 
 
 
379 aa  199  6e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1786  alcohol dehydrogenase  34.72 
 
 
379 aa  199  6e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2191  alcohol dehydrogenase  34.72 
 
 
379 aa  199  6e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.934833  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1837  alcohol dehydrogenase  34.72 
 
 
379 aa  199  6e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.245686 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2902  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  35.96 
 
 
361 aa  199  7.999999999999999e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3472  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  33.61 
 
 
366 aa  198  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3767  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.63 
 
 
376 aa  197  3e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1671  Zn-dependent alcohol dehydrogenase class III  35.18 
 
 
376 aa  196  4.0000000000000005e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.610289  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7131  alcohol dehydrogenase  34.86 
 
 
362 aa  196  5.000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04416  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  35.1 
 
 
369 aa  196  6e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3680  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  35.51 
 
 
372 aa  196  7e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.030881  normal  0.148071 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2526  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  34.2 
 
 
379 aa  196  7e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.879983  normal  0.6792 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2419  alcohol dehydrogenase  34.2 
 
 
379 aa  196  7e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1940  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  34.2 
 
 
379 aa  196  7e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.390441  normal  0.834541 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0344  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  36.26 
 
 
375 aa  196  7e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.422853  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2174  alcohol dehydrogenase  34.2 
 
 
379 aa  196  7e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2408  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  34.2 
 
 
379 aa  196  7e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.943982  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0401  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  36.24 
 
 
375 aa  195  9e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1939  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.63 
 
 
374 aa  195  9e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2272  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.82 
 
 
374 aa  195  1e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3530  alcohol dehydrogenase  34.63 
 
 
376 aa  195  1e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00425033 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0535  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  34.86 
 
 
368 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1438  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.9 
 
 
374 aa  194  2e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1703  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  34.32 
 
 
368 aa  194  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198202  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0817  alcohol dehydrogenase, class III  35.18 
 
 
376 aa  193  3e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1230  alcohol dehydrogenase  34.05 
 
 
368 aa  194  3e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.291862  normal  0.236106 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1829  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  36.21 
 
 
372 aa  194  3e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0359093  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1270  alcohol dehydrogenase class III  38.1 
 
 
359 aa  193  4e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.303714  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3723  alcohol dehydrogenase  33.98 
 
 
380 aa  193  4e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0459  glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase  34.44 
 
 
369 aa  193  5e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0121  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
368 aa  192  8e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0910  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.36 
 
 
372 aa  192  8e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.788021  normal  0.0507788 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06925  hypothetical protein  34.44 
 
 
382 aa  192  8e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0746  alcohol dehydrogenase class 3  34.44 
 
 
382 aa  192  8e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.38906  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0608  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  36.13 
 
 
370 aa  191  1e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1394  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.82 
 
 
370 aa  191  1e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0239994  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3767  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  36.41 
 
 
361 aa  192  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0836579  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0545  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.4 
 
 
365 aa  191  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00114618 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0004  alcohol dehydrogenase, zinc-binding  35.38 
 
 
377 aa  192  1e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000696036 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1032  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  34.85 
 
 
384 aa  191  2e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4761  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  35.67 
 
 
362 aa  191  2e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0522  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  34.32 
 
 
368 aa  191  2e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2251  alcohol dehydrogenase  34.54 
 
 
375 aa  191  2e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1449  zinc-binding alcohol dehydrogenase  38.77 
 
 
362 aa  191  2e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0465334 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03331  putative alcohol dehydrogenase  33.8 
 
 
385 aa  191  2e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4059  alcohol dehydrogenase  33.8 
 
 
376 aa  191  2e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0052  alcohol dehydrogenase class III  34.35 
 
 
376 aa  190  2.9999999999999997e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.657136 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2089  alcohol dehydrogenase  35.73 
 
 
372 aa  190  4e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.864443  normal  0.876446 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0919  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.17 
 
 
351 aa  190  4e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1403  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  34.32 
 
 
361 aa  189  5e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0304986  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03740  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  34.96 
 
 
363 aa  189  7e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.147839 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4165  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  34.23 
 
 
361 aa  188  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.356272  normal  0.0548986 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4059  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  34.08 
 
 
370 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000294159 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2396  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  34.59 
 
 
361 aa  188  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.516126 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0605  bifunctional: glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase/alcohol dehydrogenase class III  34.5 
 
 
368 aa  188  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.378006  normal  0.42713 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0697  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
369 aa  187  2e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3587  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  33.69 
 
 
369 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0985  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  35.43 
 
 
369 aa  188  2e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0845  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
369 aa  187  2e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.993926 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1510  class III alcohol dehydrogenase  34.62 
 
 
370 aa  188  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1557  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  34.05 
 
 
375 aa  187  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1616  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  34.64 
 
 
371 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.634826  normal  0.536311 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0069  bifunctional: glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase/alcohol dehydrogenase class III  34.05 
 
 
368 aa  187  3e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2571  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  33.51 
 
 
379 aa  187  3e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3011  alcohol dehydrogenase  33.51 
 
 
379 aa  187  3e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0290294  hitchhiker  0.000974113 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2473  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  33.51 
 
 
379 aa  187  3e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3073  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.69 
 
 
363 aa  187  3e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2527  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  33.78 
 
 
369 aa  187  4e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0605767  normal  0.410127 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17400  alcohol dehydrogenase class III  34.71 
 
 
370 aa  186  4e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0713  glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase(FlhA)  34.05 
 
 
368 aa  186  5e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.009216  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3253  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  34.32 
 
 
368 aa  186  6e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.902463 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2454  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  35.31 
 
 
361 aa  186  6e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000626099  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1558  alcohol dehydrogenase, class III  35.1 
 
 
370 aa  186  8e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.86343  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1125  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.77 
 
 
370 aa  186  8e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0483  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  33.78 
 
 
368 aa  185  9e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27799  hitchhiker  0.00130269 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4784  alcohol dehydrogenase  33.6 
 
 
368 aa  186  9e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00530396  normal  0.688561 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4161  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  34.08 
 
 
370 aa  185  9e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.983661  normal  0.423904 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1170  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  34.08 
 
 
370 aa  185  9e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.583443  normal  0.562298 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0183  alcohol dehydrogenase  39.89 
 
 
376 aa  185  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000929  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  33.06 
 
 
382 aa  185  1.0000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3129  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.88 
 
 
368 aa  185  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0277629 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4000  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.78 
 
 
368 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.137605  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>