More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2902 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_2885  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  97.23 
 
 
363 aa  680    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.897584  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2902  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  100 
 
 
361 aa  723    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4761  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  89.2 
 
 
362 aa  635    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3767  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  73.54 
 
 
361 aa  544  1e-154  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0836579  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2396  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  72.85 
 
 
361 aa  538  9.999999999999999e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.516126 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3472  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  72.42 
 
 
366 aa  535  1e-151  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10580  Zn-dependent alcohol dehydrogenase, class III  72.05 
 
 
364 aa  536  1e-151  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.107313  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2454  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  73.68 
 
 
361 aa  535  1e-151  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000626099  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1403  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  70.47 
 
 
361 aa  528  1e-149  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0304986  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0408  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  70.08 
 
 
361 aa  526  1e-148  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3767  alcohol dehydrogenase  70.08 
 
 
361 aa  521  1e-147  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225708  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1329  alcohol dehydrogenase class 3  74.79 
 
 
361 aa  523  1e-147  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.217477 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3391  alcohol dehydrogenase  69.34 
 
 
362 aa  519  1e-146  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.508569  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3380  zinc-binding alcohol dehydrogenase  69.34 
 
 
362 aa  519  1e-146  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.286497  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3442  alcohol dehydrogenase  69.34 
 
 
362 aa  519  1e-146  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.174666  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1341  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  70.08 
 
 
361 aa  515  1.0000000000000001e-145  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.600384  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12287  zinc-type alcohol dehydrogenase adhE2  69.53 
 
 
361 aa  515  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18780  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  70.72 
 
 
362 aa  511  1e-144  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.424094 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2766  alcohol dehydrogenase  68.96 
 
 
364 aa  511  1e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.170215  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03740  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  71.87 
 
 
363 aa  509  1e-143  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.147839 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4165  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  69.92 
 
 
361 aa  508  1e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.356272  normal  0.0548986 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3651  alcohol dehydrogenase  70.52 
 
 
365 aa  506  9.999999999999999e-143  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198781  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0910  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  68.1 
 
 
372 aa  494  1e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.788021  normal  0.0507788 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3723  alcohol dehydrogenase  71.01 
 
 
380 aa  497  1e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5066  alcohol dehydrogenase  69.34 
 
 
366 aa  493  9.999999999999999e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0364575 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2925  alcohol dehydrogenase  68.42 
 
 
361 aa  486  1e-136  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0092  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  67.13 
 
 
363 aa  480  1e-134  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21860  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  64.27 
 
 
574 aa  472  1e-132  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15330  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  68.68 
 
 
366 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1449  zinc-binding alcohol dehydrogenase  69.72 
 
 
362 aa  464  1e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0465334 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4646  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  57.89 
 
 
366 aa  356  2.9999999999999997e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0742  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.91 
 
 
368 aa  252  6e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1775  putative alcohol dehydrogenase (zinc-binding)  41.13 
 
 
361 aa  248  1e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0743  alcohol dehydrogenase  37.6 
 
 
366 aa  240  2.9999999999999997e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1270  alcohol dehydrogenase class III  38.68 
 
 
359 aa  234  3e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.303714  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5201  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  37.85 
 
 
361 aa  231  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3009  alcohol dehydrogenase  37.57 
 
 
361 aa  229  4e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.39042  normal  0.310098 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5895  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.87 
 
 
359 aa  228  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.500089 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7131  alcohol dehydrogenase  37.29 
 
 
362 aa  228  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1980  alcohol dehydrogenase  39.78 
 
 
360 aa  223  3e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2469  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.15 
 
 
375 aa  223  3e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.43107  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1664  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.39 
 
 
360 aa  222  7e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0508801  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2600  alcohol dehydrogenase  40.99 
 
 
363 aa  220  3e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.163819  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1473  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.89 
 
 
368 aa  218  1e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.420949  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8254  zinc-type alcohol dehydrogenase AdhD (aldehyde reductase)  38.94 
 
 
361 aa  216  5e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0114849 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2247  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.67 
 
 
364 aa  216  7e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.792853 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2251  alcohol dehydrogenase  36.41 
 
 
375 aa  215  9e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3295  alcohol dehydrogenase  34.33 
 
 
374 aa  214  1.9999999999999998e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1540  alcohol dehydrogenase  36.68 
 
 
376 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.47275  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0746  alcohol dehydrogenase class 3  36.61 
 
 
382 aa  213  4.9999999999999996e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.38906  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1938  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  35.41 
 
 
373 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.831257  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1667  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  35.14 
 
 
373 aa  212  7.999999999999999e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0741  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.96 
 
 
370 aa  212  9e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1978  alcohol dehydrogenase  40.28 
 
 
367 aa  211  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.312028  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2307  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.95 
 
 
372 aa  210  4e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06925  hypothetical protein  36.07 
 
 
382 aa  209  6e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3680  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  35.14 
 
 
372 aa  209  6e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.030881  normal  0.148071 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0004  alcohol dehydrogenase, zinc-binding  35.33 
 
 
377 aa  209  7e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000696036 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0052  alcohol dehydrogenase class III  34.78 
 
 
376 aa  208  1e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.657136 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0349  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.44 
 
 
363 aa  208  1e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1939  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.87 
 
 
374 aa  208  1e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3530  alcohol dehydrogenase  35.6 
 
 
376 aa  208  1e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00425033 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0874  alcohol dehydrogenase  36.29 
 
 
383 aa  207  2e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.101876  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0545  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.29 
 
 
365 aa  207  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00114618 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0920  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.36 
 
 
377 aa  206  4e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2610  alcohol dehydrogenase  37.18 
 
 
375 aa  206  5e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.721019 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1940  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  35.33 
 
 
379 aa  206  6e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.390441  normal  0.834541 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2408  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  35.33 
 
 
379 aa  206  6e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.943982  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2526  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  35.33 
 
 
379 aa  206  6e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.879983  normal  0.6792 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1438  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.78 
 
 
374 aa  206  6e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2174  alcohol dehydrogenase  35.33 
 
 
379 aa  206  6e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2419  alcohol dehydrogenase  35.33 
 
 
379 aa  206  6e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1786  alcohol dehydrogenase  35.87 
 
 
379 aa  206  7e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2191  alcohol dehydrogenase  35.87 
 
 
379 aa  206  7e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.934833  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1837  alcohol dehydrogenase  35.87 
 
 
379 aa  206  7e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.245686 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3021  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  35.87 
 
 
376 aa  205  8e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03331  putative alcohol dehydrogenase  35.52 
 
 
385 aa  205  9e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2883  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.56 
 
 
383 aa  205  9e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2571  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  34.32 
 
 
379 aa  205  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1671  Zn-dependent alcohol dehydrogenase class III  35.33 
 
 
376 aa  204  1e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.610289  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1394  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.78 
 
 
370 aa  205  1e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0239994  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2473  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  34.32 
 
 
379 aa  205  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3011  alcohol dehydrogenase  34.32 
 
 
379 aa  205  1e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0290294  hitchhiker  0.000974113 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1839  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.75 
 
 
370 aa  205  1e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.75863  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000929  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  34.7 
 
 
382 aa  204  2e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3767  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.24 
 
 
376 aa  204  2e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0375  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  35.05 
 
 
376 aa  204  2e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1179  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  34.95 
 
 
370 aa  203  3e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.457911  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1557  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  34.59 
 
 
375 aa  203  4e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3280  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.59 
 
 
368 aa  203  4e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2311  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  35.14 
 
 
373 aa  202  5e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.965631  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5970  alcohol dehydrogenase class III  35.04 
 
 
369 aa  202  5e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.66491 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4825  putative alcohol dehydrogenase  34.75 
 
 
375 aa  203  5e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0410996  normal  0.464938 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2054  alcohol dehydrogenase class III  35.6 
 
 
379 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4227  alcohol dehydrogenase  35.05 
 
 
376 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00409479 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1032  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  34.78 
 
 
384 aa  201  9.999999999999999e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3430  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.41 
 
 
374 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2034  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.04 
 
 
369 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.294916 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3073  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.01 
 
 
363 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4059  alcohol dehydrogenase  35.05 
 
 
376 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>