More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0183 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_0183  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
376 aa  748    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4825  putative alcohol dehydrogenase  60.27 
 
 
375 aa  443  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0410996  normal  0.464938 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2469  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  51.6 
 
 
375 aa  416  9.999999999999999e-116  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.43107  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0401  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  55.47 
 
 
375 aa  409  1e-113  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0344  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  55.73 
 
 
375 aa  410  1e-113  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.422853  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2747  alcohol dehydrogenase  59.36 
 
 
403 aa  408  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0920  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  58.82 
 
 
377 aa  401  1e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3295  alcohol dehydrogenase  54.84 
 
 
374 aa  404  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2610  alcohol dehydrogenase  60.59 
 
 
375 aa  398  9.999999999999999e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.721019 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3061  alcohol dehydrogenase  58.82 
 
 
374 aa  393  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1824  Zinc-containing alcohol dehydrogenase  59.63 
 
 
374 aa  387  1e-106  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0472  alcohol dehydrogenase  59.63 
 
 
374 aa  386  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3448  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  49.21 
 
 
371 aa  337  1.9999999999999998e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0742  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.84 
 
 
368 aa  330  2e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5014  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  55.23 
 
 
366 aa  330  3e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.102148  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3947  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  48.54 
 
 
372 aa  304  2.0000000000000002e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.607291  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2473  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  40.86 
 
 
379 aa  301  1e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2571  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  40.86 
 
 
379 aa  301  1e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3011  alcohol dehydrogenase  40.86 
 
 
379 aa  301  1e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0290294  hitchhiker  0.000974113 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0101  alcohol dehydrogenase  47.73 
 
 
370 aa  300  2e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0961812 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0111  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  47.73 
 
 
370 aa  300  2e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.595465  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1829  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  41.85 
 
 
372 aa  300  2e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0359093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0120  alcohol dehydrogenase  47.73 
 
 
370 aa  300  2e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0192727 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1667  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  40.8 
 
 
373 aa  296  3e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3680  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  41.08 
 
 
372 aa  296  4e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.030881  normal  0.148071 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0608  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  41.46 
 
 
370 aa  294  1e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0817  alcohol dehydrogenase, class III  39.52 
 
 
376 aa  294  2e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1671  Zn-dependent alcohol dehydrogenase class III  39.52 
 
 
376 aa  293  3e-78  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.610289  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17400  alcohol dehydrogenase class III  40.97 
 
 
370 aa  293  5e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1510  class III alcohol dehydrogenase  40.7 
 
 
370 aa  292  8e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2411  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  39.78 
 
 
373 aa  291  1e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2311  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  39.89 
 
 
373 aa  291  1e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.965631  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1616  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  40.59 
 
 
371 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.634826  normal  0.536311 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1558  alcohol dehydrogenase, class III  40.97 
 
 
370 aa  291  2e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.86343  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0269  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  39.73 
 
 
376 aa  290  2e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1557  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  40.05 
 
 
375 aa  291  2e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1938  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  40.27 
 
 
373 aa  291  2e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.831257  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1438  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.08 
 
 
374 aa  290  2e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1786  alcohol dehydrogenase  38.52 
 
 
379 aa  291  2e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2191  alcohol dehydrogenase  38.52 
 
 
379 aa  291  2e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.934833  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1032  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  39.41 
 
 
384 aa  291  2e-77  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1837  alcohol dehydrogenase  38.52 
 
 
379 aa  291  2e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.245686 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2054  alcohol dehydrogenase class III  38.26 
 
 
379 aa  290  3e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0161  zinc-binding dehydrogenase  38.93 
 
 
376 aa  290  3e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4161  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  40.16 
 
 
370 aa  289  6e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.983661  normal  0.423904 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1125  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  40.16 
 
 
370 aa  288  8e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0375  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  39.19 
 
 
376 aa  288  9e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1939  zinc-binding alcohol dehydrogenase  38.54 
 
 
374 aa  288  1e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3021  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  38.92 
 
 
376 aa  288  1e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1170  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  40.16 
 
 
370 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.583443  normal  0.562298 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0321  alcohol dehydrogenase  39.89 
 
 
370 aa  288  1e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3530  alcohol dehydrogenase  38.21 
 
 
376 aa  288  1e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00425033 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4227  alcohol dehydrogenase  38.92 
 
 
376 aa  287  2e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00409479 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1540  alcohol dehydrogenase  38.44 
 
 
376 aa  287  2e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.47275  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2956  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  41.64 
 
 
369 aa  286  4e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00985195  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4059  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  39.62 
 
 
370 aa  286  4e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000294159 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3028  alcohol dehydrogenase  39.89 
 
 
370 aa  286  5e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000388356 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0743  alcohol dehydrogenase  40.93 
 
 
366 aa  286  5e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38750  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  39.84 
 
 
371 aa  286  5.999999999999999e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2251  alcohol dehydrogenase  38.77 
 
 
375 aa  285  5.999999999999999e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1940  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  37.99 
 
 
379 aa  285  7e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.390441  normal  0.834541 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2408  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  37.99 
 
 
379 aa  285  7e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.943982  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2272  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  39.78 
 
 
374 aa  285  7e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2526  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  37.99 
 
 
379 aa  285  7e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.879983  normal  0.6792 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2174  alcohol dehydrogenase  37.99 
 
 
379 aa  285  7e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2419  alcohol dehydrogenase  37.99 
 
 
379 aa  285  7e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1367  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  39.89 
 
 
370 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0985  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  39.52 
 
 
369 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3427  alcohol dehydrogenase  38.65 
 
 
376 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03331  putative alcohol dehydrogenase  38.11 
 
 
385 aa  283  4.0000000000000003e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0459  glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase  40.48 
 
 
369 aa  282  5.000000000000001e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1394  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  37.84 
 
 
370 aa  282  7.000000000000001e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0239994  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5201  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  43.77 
 
 
361 aa  282  9e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1320  alcohol dehydrogenase  46.77 
 
 
372 aa  281  1e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7131  alcohol dehydrogenase  42.18 
 
 
362 aa  281  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0052  alcohol dehydrogenase class III  38.98 
 
 
376 aa  280  2e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.657136 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06925  hypothetical protein  38.38 
 
 
382 aa  280  3e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07750  Zn-dependent alcohol dehydrogenase, class III  45.58 
 
 
383 aa  280  3e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.969259  normal  0.331312 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10163  zinc-type alcohol dehydrogenase subunit E adhE  47.72 
 
 
383 aa  279  6e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2496  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  48.39 
 
 
374 aa  279  7e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000929  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  37.84 
 
 
382 aa  278  2e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3009  alcohol dehydrogenase  41.49 
 
 
361 aa  276  4e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.39042  normal  0.310098 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4059  alcohol dehydrogenase  37.17 
 
 
376 aa  276  6e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0746  alcohol dehydrogenase class 3  39.04 
 
 
382 aa  275  6e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.38906  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3405  formaldehyde dehydrogenase (glutathione)  38.96 
 
 
372 aa  275  8e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.244128  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3767  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.33 
 
 
376 aa  275  8e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4357  putative alcohol dehydrogenase  47.04 
 
 
378 aa  275  1.0000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.323003  normal  0.875115 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3387  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  40.58 
 
 
369 aa  273  3e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0945129  normal  0.744246 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04416  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  39.15 
 
 
369 aa  273  4.0000000000000004e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3679  alcohol dehydrogenase  44.15 
 
 
367 aa  273  4.0000000000000004e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0004  alcohol dehydrogenase, zinc-binding  37.6 
 
 
377 aa  272  7e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000696036 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0535  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  39.2 
 
 
368 aa  272  8.000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5114  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  41.27 
 
 
369 aa  271  1e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0108  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  39.79 
 
 
369 aa  271  1e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0169  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  38.3 
 
 
371 aa  270  2e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0241  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  38.3 
 
 
371 aa  270  2e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.667436  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2414  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  40.16 
 
 
369 aa  269  7e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.847412  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4784  alcohol dehydrogenase  39.2 
 
 
368 aa  267  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00530396  normal  0.688561 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5633  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  39.42 
 
 
369 aa  267  2e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6311  alcohol dehydrogenase  40.74 
 
 
369 aa  267  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>