More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_03740 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_03740  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  100 
 
 
363 aa  728    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.147839 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3472  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  77.01 
 
 
366 aa  570  1.0000000000000001e-162  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1403  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  75.9 
 
 
361 aa  560  1e-158  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0304986  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2396  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  74.93 
 
 
361 aa  554  1e-157  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.516126 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4165  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  76.4 
 
 
361 aa  557  1e-157  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.356272  normal  0.0548986 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2454  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  76.32 
 
 
361 aa  545  1e-154  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000626099  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3767  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  72.85 
 
 
361 aa  545  1e-154  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0836579  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0408  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  72.42 
 
 
361 aa  543  1e-153  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3651  alcohol dehydrogenase  73.48 
 
 
365 aa  542  1e-153  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198781  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10580  Zn-dependent alcohol dehydrogenase, class III  73.83 
 
 
364 aa  540  9.999999999999999e-153  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.107313  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3723  alcohol dehydrogenase  75.93 
 
 
380 aa  541  9.999999999999999e-153  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1341  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  72.42 
 
 
361 aa  535  1e-151  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.600384  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3380  zinc-binding alcohol dehydrogenase  73.33 
 
 
362 aa  534  1e-150  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.286497  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3391  alcohol dehydrogenase  73.33 
 
 
362 aa  534  1e-150  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.508569  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3442  alcohol dehydrogenase  73.33 
 
 
362 aa  534  1e-150  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.174666  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12287  zinc-type alcohol dehydrogenase adhE2  72.42 
 
 
361 aa  530  1e-149  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4761  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  73.76 
 
 
362 aa  528  1e-149  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18780  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  72.22 
 
 
362 aa  526  1e-148  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.424094 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1329  alcohol dehydrogenase class 3  74.93 
 
 
361 aa  526  1e-148  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.217477 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2902  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  71.87 
 
 
361 aa  525  1e-148  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3767  alcohol dehydrogenase  71.87 
 
 
361 aa  521  1e-147  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225708  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0092  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  73.06 
 
 
363 aa  515  1.0000000000000001e-145  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2766  alcohol dehydrogenase  70.72 
 
 
364 aa  514  1e-144  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.170215  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2885  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  71.87 
 
 
363 aa  511  1e-144  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.897584  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15330  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  73.68 
 
 
366 aa  508  1e-143  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0910  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  70.81 
 
 
372 aa  508  1e-143  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.788021  normal  0.0507788 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2925  alcohol dehydrogenase  71.03 
 
 
361 aa  503  1e-141  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21860  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  66.76 
 
 
574 aa  484  1e-136  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5066  alcohol dehydrogenase  67.62 
 
 
366 aa  486  1e-136  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0364575 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1449  zinc-binding alcohol dehydrogenase  70.31 
 
 
362 aa  464  1e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0465334 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4646  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  62.71 
 
 
366 aa  384  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1775  putative alcohol dehydrogenase (zinc-binding)  41.44 
 
 
361 aa  263  4e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7131  alcohol dehydrogenase  40.56 
 
 
362 aa  259  7e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1270  alcohol dehydrogenase class III  41.21 
 
 
359 aa  240  2e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.303714  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5201  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  38.06 
 
 
361 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0743  alcohol dehydrogenase  36.44 
 
 
366 aa  237  2e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0742  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.89 
 
 
368 aa  232  7.000000000000001e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4825  putative alcohol dehydrogenase  38.53 
 
 
375 aa  231  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0410996  normal  0.464938 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2600  alcohol dehydrogenase  40.76 
 
 
363 aa  229  5e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.163819  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3009  alcohol dehydrogenase  35.95 
 
 
361 aa  227  3e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.39042  normal  0.310098 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2247  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.45 
 
 
364 aa  227  3e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.792853 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2469  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.08 
 
 
375 aa  225  1e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.43107  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5895  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.62 
 
 
359 aa  223  4e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.500089 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2883  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.36 
 
 
383 aa  223  4.9999999999999996e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0545  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.72 
 
 
365 aa  223  6e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00114618 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8254  zinc-type alcohol dehydrogenase AdhD (aldehyde reductase)  37.61 
 
 
361 aa  218  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0114849 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0321  alcohol dehydrogenase  37.5 
 
 
370 aa  216  5.9999999999999996e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1616  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  35.87 
 
 
371 aa  215  8e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.634826  normal  0.536311 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1664  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.6 
 
 
360 aa  214  9.999999999999999e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0508801  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1980  alcohol dehydrogenase  37.78 
 
 
360 aa  215  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1510  class III alcohol dehydrogenase  36.68 
 
 
370 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3295  alcohol dehydrogenase  34.55 
 
 
374 aa  214  1.9999999999999998e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0108  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  37.47 
 
 
369 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2307  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.34 
 
 
372 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17400  alcohol dehydrogenase class III  36.96 
 
 
370 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1170  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  35.6 
 
 
370 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.583443  normal  0.562298 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4161  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  35.33 
 
 
370 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.983661  normal  0.423904 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1558  alcohol dehydrogenase, class III  35.87 
 
 
370 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.86343  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2610  alcohol dehydrogenase  37.92 
 
 
375 aa  213  4.9999999999999996e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.721019 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0401  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.29 
 
 
375 aa  211  1e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06925  hypothetical protein  35.75 
 
 
382 aa  211  1e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1125  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.78 
 
 
370 aa  211  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4059  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  34.78 
 
 
370 aa  212  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000294159 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0746  alcohol dehydrogenase class 3  36.29 
 
 
382 aa  211  1e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.38906  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5633  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  36.68 
 
 
369 aa  211  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2799  alcohol dehydrogenase  40.64 
 
 
363 aa  211  2e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000199621 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5014  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.05 
 
 
366 aa  210  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.102148  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0344  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.01 
 
 
375 aa  211  2e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.422853  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0183  alcohol dehydrogenase  38.48 
 
 
376 aa  209  4e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0608  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  35.97 
 
 
370 aa  209  4e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1032  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  35.85 
 
 
384 aa  209  8e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1667  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  36.14 
 
 
373 aa  208  1e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1938  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  36.14 
 
 
373 aa  208  1e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.831257  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1394  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.33 
 
 
370 aa  207  2e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0239994  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6841  alcohol dehydrogenase  38.81 
 
 
358 aa  207  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1540  alcohol dehydrogenase  36.46 
 
 
376 aa  207  2e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.47275  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38750  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  35.92 
 
 
371 aa  207  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2414  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  37.3 
 
 
369 aa  207  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.847412  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1367  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.33 
 
 
370 aa  207  3e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4059  alcohol dehydrogenase  36.12 
 
 
376 aa  206  4e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3767  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.04 
 
 
376 aa  206  6e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000929  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  34.68 
 
 
382 aa  206  7e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2571  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  34.86 
 
 
379 aa  205  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3280  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.79 
 
 
368 aa  205  1e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3011  alcohol dehydrogenase  34.86 
 
 
379 aa  205  1e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0290294  hitchhiker  0.000974113 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0985  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  35.33 
 
 
369 aa  204  1e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3680  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  34.6 
 
 
372 aa  205  1e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.030881  normal  0.148071 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3387  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  36.93 
 
 
369 aa  205  1e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0945129  normal  0.744246 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2473  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  34.86 
 
 
379 aa  205  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2747  alcohol dehydrogenase  38.53 
 
 
403 aa  204  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0004  alcohol dehydrogenase, zinc-binding  36.12 
 
 
377 aa  205  1e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000696036 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0241  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  35.95 
 
 
371 aa  204  2e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.667436  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0169  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  35.95 
 
 
371 aa  204  2e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2956  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  36.12 
 
 
369 aa  204  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00985195  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4948  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.13 
 
 
375 aa  204  2e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2889  histidine kinase  33.61 
 
 
368 aa  203  3e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.834376  hitchhiker  0.00334697 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2311  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  35.6 
 
 
373 aa  203  3e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.965631  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1557  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  34.51 
 
 
375 aa  203  4e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1473  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.43 
 
 
368 aa  202  5e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.420949  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1939  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.6 
 
 
374 aa  202  7e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>