More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3723 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_3472  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  91.97 
 
 
366 aa  677    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3723  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
380 aa  764    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10580  Zn-dependent alcohol dehydrogenase, class III  78.73 
 
 
364 aa  571  1.0000000000000001e-162  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.107313  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1403  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  75.07 
 
 
361 aa  563  1.0000000000000001e-159  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0304986  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3651  alcohol dehydrogenase  76.58 
 
 
365 aa  558  1e-158  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198781  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3767  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  73.96 
 
 
361 aa  549  1e-155  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0836579  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4165  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  74.37 
 
 
361 aa  550  1e-155  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.356272  normal  0.0548986 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2454  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  75.21 
 
 
361 aa  544  1e-154  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000626099  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03740  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  74.59 
 
 
363 aa  534  1e-151  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.147839 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2396  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  72.7 
 
 
361 aa  537  1e-151  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.516126 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0408  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  70.75 
 
 
361 aa  526  1e-148  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1341  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  73.26 
 
 
361 aa  519  1e-146  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.600384  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15330  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  75.55 
 
 
366 aa  514  1e-144  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2902  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  69.92 
 
 
361 aa  511  1e-144  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1329  alcohol dehydrogenase class 3  74.93 
 
 
361 aa  514  1e-144  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.217477 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18780  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  71.11 
 
 
362 aa  514  1e-144  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.424094 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4761  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  72.42 
 
 
362 aa  513  1e-144  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2925  alcohol dehydrogenase  71.75 
 
 
361 aa  508  1e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12287  zinc-type alcohol dehydrogenase adhE2  67.59 
 
 
361 aa  503  1e-141  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3380  zinc-binding alcohol dehydrogenase  68.33 
 
 
362 aa  502  1e-141  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.286497  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3442  alcohol dehydrogenase  68.33 
 
 
362 aa  502  1e-141  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.174666  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3391  alcohol dehydrogenase  68.33 
 
 
362 aa  502  1e-141  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.508569  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3767  alcohol dehydrogenase  68.25 
 
 
361 aa  498  1e-140  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225708  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2766  alcohol dehydrogenase  67.68 
 
 
364 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.170215  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2885  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  69.64 
 
 
363 aa  493  9.999999999999999e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.897584  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0910  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  65.68 
 
 
372 aa  482  1e-135  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.788021  normal  0.0507788 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5066  alcohol dehydrogenase  67.05 
 
 
366 aa  483  1e-135  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0364575 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0092  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  67.22 
 
 
363 aa  480  1e-134  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21860  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  63.24 
 
 
574 aa  460  9.999999999999999e-129  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1449  zinc-binding alcohol dehydrogenase  67.23 
 
 
362 aa  443  1e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0465334 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4646  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  57.73 
 
 
366 aa  351  1e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1775  putative alcohol dehydrogenase (zinc-binding)  41.18 
 
 
361 aa  261  1e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1270  alcohol dehydrogenase class III  39.83 
 
 
359 aa  249  8e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.303714  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0742  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.36 
 
 
368 aa  247  3e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7131  alcohol dehydrogenase  39.44 
 
 
362 aa  246  4e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2247  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.5 
 
 
364 aa  238  1e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.792853 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2469  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.65 
 
 
375 aa  234  2.0000000000000002e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.43107  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2883  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.14 
 
 
383 aa  230  4e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5201  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  36.94 
 
 
361 aa  228  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0743  alcohol dehydrogenase  36.44 
 
 
366 aa  226  6e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3009  alcohol dehydrogenase  36.39 
 
 
361 aa  225  9e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.39042  normal  0.310098 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0349  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.78 
 
 
363 aa  222  7e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8254  zinc-type alcohol dehydrogenase AdhD (aldehyde reductase)  38.39 
 
 
361 aa  221  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0114849 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3280  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.06 
 
 
368 aa  220  3e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5895  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.93 
 
 
359 aa  218  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.500089 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2571  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  36.87 
 
 
379 aa  218  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2473  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  36.87 
 
 
379 aa  218  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3011  alcohol dehydrogenase  36.87 
 
 
379 aa  218  2e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0290294  hitchhiker  0.000974113 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2600  alcohol dehydrogenase  39.77 
 
 
363 aa  216  4e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.163819  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3295  alcohol dehydrogenase  33.51 
 
 
374 aa  216  4e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0741  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.41 
 
 
370 aa  216  5e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1664  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.95 
 
 
360 aa  215  9.999999999999999e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0508801  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2307  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.56 
 
 
372 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6841  alcohol dehydrogenase  38.66 
 
 
358 aa  213  4.9999999999999996e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2411  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  36.93 
 
 
373 aa  213  4.9999999999999996e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1980  alcohol dehydrogenase  38.06 
 
 
360 aa  211  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0545  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.22 
 
 
365 aa  210  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00114618 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2311  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  36.22 
 
 
373 aa  209  8e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.965631  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1557  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  36.12 
 
 
375 aa  208  1e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3680  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  35.58 
 
 
372 aa  208  1e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.030881  normal  0.148071 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2956  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  37.4 
 
 
369 aa  207  3e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00985195  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3679  alcohol dehydrogenase  36.54 
 
 
367 aa  207  3e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2747  alcohol dehydrogenase  37.29 
 
 
403 aa  206  4e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3672  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.01 
 
 
366 aa  206  4e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.618419  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06925  hypothetical protein  35.95 
 
 
382 aa  206  6e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2889  histidine kinase  33.42 
 
 
368 aa  206  8e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.834376  hitchhiker  0.00334697 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1540  alcohol dehydrogenase  37.1 
 
 
376 aa  206  8e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.47275  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000929  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  35.41 
 
 
382 aa  205  9e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1939  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.66 
 
 
374 aa  205  1e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0108  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  37.13 
 
 
369 aa  205  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1032  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  35.86 
 
 
384 aa  205  1e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1938  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  36.12 
 
 
373 aa  205  1e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.831257  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4825  putative alcohol dehydrogenase  33.51 
 
 
375 aa  205  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0410996  normal  0.464938 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1667  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  36.12 
 
 
373 aa  204  2e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2414  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  37.23 
 
 
369 aa  204  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.847412  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0321  alcohol dehydrogenase  36.22 
 
 
370 aa  204  2e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3387  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  37.4 
 
 
369 aa  204  2e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0945129  normal  0.744246 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3840  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.06 
 
 
385 aa  204  2e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5633  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  36.56 
 
 
369 aa  204  3e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0746  alcohol dehydrogenase class 3  35.68 
 
 
382 aa  204  3e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.38906  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1671  Zn-dependent alcohol dehydrogenase class III  35.66 
 
 
376 aa  203  5e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.610289  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3405  formaldehyde dehydrogenase (glutathione)  35.15 
 
 
372 aa  203  5e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.244128  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38750  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  35.92 
 
 
371 aa  202  6e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1473  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.97 
 
 
368 aa  202  7e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.420949  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3430  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.23 
 
 
374 aa  202  7e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2878  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  40.06 
 
 
361 aa  202  9e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2408  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  35.41 
 
 
379 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.943982  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1510  class III alcohol dehydrogenase  35.6 
 
 
370 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1394  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  36.56 
 
 
370 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0239994  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2526  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  35.41 
 
 
379 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.879983  normal  0.6792 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1940  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  35.41 
 
 
379 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.390441  normal  0.834541 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2419  alcohol dehydrogenase  35.41 
 
 
379 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2174  alcohol dehydrogenase  35.41 
 
 
379 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0144  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  35.85 
 
 
370 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3021  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  36.12 
 
 
376 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1176  alcohol dehydrogenase  34.15 
 
 
373 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2054  alcohol dehydrogenase class III  35.41 
 
 
379 aa  200  3e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0004  alcohol dehydrogenase, zinc-binding  35.23 
 
 
377 aa  200  3e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000696036 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1837  alcohol dehydrogenase  35.41 
 
 
379 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.245686 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2251  alcohol dehydrogenase  35.31 
 
 
375 aa  200  3.9999999999999996e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>