More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2307 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_2307  zinc-binding alcohol dehydrogenase  100 
 
 
372 aa  766    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2889  histidine kinase  72.21 
 
 
368 aa  562  1.0000000000000001e-159  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.834376  hitchhiker  0.00334697 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0742  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.15 
 
 
368 aa  261  1e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4588  alcohol dehydrogenase  39.15 
 
 
368 aa  238  1e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.232692 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2454  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  36.83 
 
 
361 aa  219  7e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000626099  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2089  alcohol dehydrogenase  37.22 
 
 
372 aa  218  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.864443  normal  0.876446 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0741  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.67 
 
 
370 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1775  putative alcohol dehydrogenase (zinc-binding)  36.78 
 
 
361 aa  218  2e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5066  alcohol dehydrogenase  35.57 
 
 
366 aa  217  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0364575 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3680  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  36 
 
 
372 aa  217  2.9999999999999998e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.030881  normal  0.148071 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3651  alcohol dehydrogenase  35.29 
 
 
365 aa  217  2.9999999999999998e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198781  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1403  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  35.12 
 
 
361 aa  216  7e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0304986  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2396  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  34.4 
 
 
361 aa  215  8e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.516126 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4959  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.81 
 
 
383 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2034  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.78 
 
 
369 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.294916 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3723  alcohol dehydrogenase  36.69 
 
 
380 aa  213  4.9999999999999996e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4165  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  35.03 
 
 
361 aa  212  7e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.356272  normal  0.0548986 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3767  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  34.05 
 
 
361 aa  211  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0836579  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2166  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  33.78 
 
 
369 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5034  alcohol dehydrogenase  37.89 
 
 
368 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.952977  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0408  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  34.59 
 
 
361 aa  210  3e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2902  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  34.95 
 
 
361 aa  210  4e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5970  alcohol dehydrogenase class III  33.51 
 
 
369 aa  209  4e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.66491 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3767  alcohol dehydrogenase  34.05 
 
 
361 aa  209  4e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225708  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3418  alcohol dehydrogenase  33.78 
 
 
369 aa  209  6e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.128659  normal  0.268531 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4651  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  37.37 
 
 
368 aa  209  7e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4739  alcohol dehydrogenase  37.37 
 
 
368 aa  209  7e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3021  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  34.93 
 
 
376 aa  207  2e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3472  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  34.41 
 
 
366 aa  207  2e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0101  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.24 
 
 
369 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.618314  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2469  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.56 
 
 
375 aa  206  5e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.43107  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18780  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  34.53 
 
 
362 aa  206  5e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.424094 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10580  Zn-dependent alcohol dehydrogenase, class III  35.1 
 
 
364 aa  206  7e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.107313  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0874  alcohol dehydrogenase  33.87 
 
 
383 aa  205  8e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.101876  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4948  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.72 
 
 
375 aa  205  9e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12287  zinc-type alcohol dehydrogenase adhE2  33.78 
 
 
361 aa  205  1e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0743  alcohol dehydrogenase  35.12 
 
 
366 aa  205  1e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0459  glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase  36.17 
 
 
369 aa  205  1e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0121  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.39 
 
 
368 aa  205  1e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3194  alcohol dehydrogenase  38.15 
 
 
368 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3129  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.31 
 
 
368 aa  204  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0277629 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3182  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  38.15 
 
 
368 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.586775  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03740  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  35.34 
 
 
363 aa  204  2e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.147839 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8750  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.8 
 
 
359 aa  204  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.144332 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3244  alcohol dehydrogenase  38.15 
 
 
368 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1980  alcohol dehydrogenase  34.68 
 
 
360 aa  203  3e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1179  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  32.98 
 
 
370 aa  203  3e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.457911  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0161  zinc-binding dehydrogenase  34.67 
 
 
376 aa  204  3e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1270  alcohol dehydrogenase class III  35.97 
 
 
359 aa  203  4e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.303714  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1839  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.78 
 
 
370 aa  203  5e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.75863  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0269  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  33.87 
 
 
376 aa  202  8e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5201  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.47 
 
 
361 aa  202  9e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3380  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.78 
 
 
362 aa  202  9e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.286497  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3391  alcohol dehydrogenase  33.78 
 
 
362 aa  202  9e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.508569  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3442  alcohol dehydrogenase  33.78 
 
 
362 aa  202  9e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.174666  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4227  alcohol dehydrogenase  33.87 
 
 
376 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00409479 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1230  alcohol dehydrogenase  34.05 
 
 
368 aa  202  9.999999999999999e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.291862  normal  0.236106 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1593  alcohol dehydrogenase  35.97 
 
 
376 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1703  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  34.27 
 
 
368 aa  201  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198202  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2600  alcohol dehydrogenase  35.98 
 
 
363 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.163819  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0375  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  33.6 
 
 
376 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5895  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.02 
 
 
359 aa  201  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.500089 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03331  putative alcohol dehydrogenase  33.87 
 
 
385 aa  201  1.9999999999999998e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5164  alcohol dehydrogenase  35.69 
 
 
376 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.827843 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2925  alcohol dehydrogenase  36.27 
 
 
361 aa  201  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38750  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  33.78 
 
 
371 aa  200  3e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1671  Zn-dependent alcohol dehydrogenase class III  33.69 
 
 
376 aa  199  3.9999999999999996e-50  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.610289  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1032  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  34.13 
 
 
384 aa  200  3.9999999999999996e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4761  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  35.75 
 
 
362 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0608  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  32.89 
 
 
370 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1486  alcohol dehydrogenase  36.94 
 
 
370 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3972  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  34.17 
 
 
372 aa  199  5e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.98607 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21860  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  34.63 
 
 
574 aa  199  5e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1939  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.32 
 
 
374 aa  199  6e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1540  alcohol dehydrogenase  33.69 
 
 
376 aa  199  6e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.47275  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0092  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  34.49 
 
 
363 aa  199  6e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3427  alcohol dehydrogenase  34.13 
 
 
376 aa  199  7e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1125  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.35 
 
 
370 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2054  alcohol dehydrogenase class III  34.4 
 
 
379 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4833  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.24 
 
 
368 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.170406  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2526  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  34.22 
 
 
379 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.879983  normal  0.6792 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2408  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  34.22 
 
 
379 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.943982  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2766  alcohol dehydrogenase  33.8 
 
 
364 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.170215  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2419  alcohol dehydrogenase  34.22 
 
 
379 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2174  alcohol dehydrogenase  34.22 
 
 
379 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1940  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  34.22 
 
 
379 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.390441  normal  0.834541 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1786  alcohol dehydrogenase  34.22 
 
 
379 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2191  alcohol dehydrogenase  34.22 
 
 
379 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.934833  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1837  alcohol dehydrogenase  34.22 
 
 
379 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.245686 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5270  alcohol dehydrogenase  36.68 
 
 
370 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.338508 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1510  class III alcohol dehydrogenase  33.24 
 
 
370 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13103  zinc-type alcohol dehydrogenase adhD (aldehyde reductase)  35.47 
 
 
368 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.256708  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2251  alcohol dehydrogenase  33.07 
 
 
375 aa  197  2.0000000000000003e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0910  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.04 
 
 
372 aa  197  2.0000000000000003e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.788021  normal  0.0507788 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3334  alcohol dehydrogenase  34.23 
 
 
364 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.814628  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1341  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  34.64 
 
 
361 aa  197  3e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.600384  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1438  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.42 
 
 
374 aa  197  3e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7131  alcohol dehydrogenase  35.03 
 
 
362 aa  197  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1557  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  33.07 
 
 
375 aa  196  4.0000000000000005e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0746  alcohol dehydrogenase class 3  32.35 
 
 
382 aa  196  5.000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.38906  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>