More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0092 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_0092  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  100 
 
 
363 aa  733    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0408  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  76.94 
 
 
361 aa  578  1e-164  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3380  zinc-binding alcohol dehydrogenase  76.45 
 
 
362 aa  565  1e-160  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.286497  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3391  alcohol dehydrogenase  76.45 
 
 
362 aa  565  1e-160  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.508569  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3442  alcohol dehydrogenase  76.45 
 
 
362 aa  565  1e-160  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.174666  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12287  zinc-type alcohol dehydrogenase adhE2  74.79 
 
 
361 aa  552  1e-156  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3767  alcohol dehydrogenase  76.67 
 
 
361 aa  553  1e-156  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225708  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1403  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  73 
 
 
361 aa  542  1e-153  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0304986  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2766  alcohol dehydrogenase  74.93 
 
 
364 aa  538  9.999999999999999e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.170215  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3767  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  70.56 
 
 
361 aa  528  1e-149  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0836579  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4165  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  71.19 
 
 
361 aa  529  1e-149  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.356272  normal  0.0548986 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2396  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  70.36 
 
 
361 aa  519  1e-146  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.516126 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03740  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  73.06 
 
 
363 aa  515  1.0000000000000001e-145  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.147839 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3472  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  69.44 
 
 
366 aa  514  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2454  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  70.83 
 
 
361 aa  512  1e-144  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000626099  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18780  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  68.42 
 
 
362 aa  508  1e-143  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.424094 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0910  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  69.92 
 
 
372 aa  506  9.999999999999999e-143  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.788021  normal  0.0507788 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1341  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  67.78 
 
 
361 aa  507  9.999999999999999e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.600384  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10580  Zn-dependent alcohol dehydrogenase, class III  68.96 
 
 
364 aa  504  9.999999999999999e-143  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.107313  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3651  alcohol dehydrogenase  68.77 
 
 
365 aa  506  9.999999999999999e-143  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198781  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1329  alcohol dehydrogenase class 3  71.59 
 
 
361 aa  498  1e-140  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.217477 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4761  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  69.38 
 
 
362 aa  497  1e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2902  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  67.13 
 
 
361 aa  497  1e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21860  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  67.87 
 
 
574 aa  495  1e-139  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2925  alcohol dehydrogenase  70.52 
 
 
361 aa  493  9.999999999999999e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3723  alcohol dehydrogenase  68.39 
 
 
380 aa  488  1e-137  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2885  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  67.04 
 
 
363 aa  479  1e-134  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.897584  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15330  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  69.13 
 
 
366 aa  473  1e-132  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5066  alcohol dehydrogenase  64.66 
 
 
366 aa  458  9.999999999999999e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0364575 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1449  zinc-binding alcohol dehydrogenase  63.64 
 
 
362 aa  421  1e-117  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0465334 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4646  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  62.67 
 
 
366 aa  383  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7131  alcohol dehydrogenase  41 
 
 
362 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0742  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.36 
 
 
368 aa  242  7.999999999999999e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1270  alcohol dehydrogenase class III  43.28 
 
 
359 aa  241  2e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.303714  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1775  putative alcohol dehydrogenase (zinc-binding)  39.06 
 
 
361 aa  241  2e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0743  alcohol dehydrogenase  38.52 
 
 
366 aa  236  6e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4825  putative alcohol dehydrogenase  37.75 
 
 
375 aa  231  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0410996  normal  0.464938 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2883  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.29 
 
 
383 aa  229  5e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5201  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  36.57 
 
 
361 aa  220  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8254  zinc-type alcohol dehydrogenase AdhD (aldehyde reductase)  37.97 
 
 
361 aa  218  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0114849 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5895  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.93 
 
 
359 aa  216  5e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.500089 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3009  alcohol dehydrogenase  36.24 
 
 
361 aa  213  3.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.39042  normal  0.310098 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0349  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.34 
 
 
363 aa  213  5.999999999999999e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2469  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.52 
 
 
375 aa  211  1e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.43107  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1473  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.15 
 
 
368 aa  211  2e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.420949  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2600  alcohol dehydrogenase  40.35 
 
 
363 aa  211  2e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.163819  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2247  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.67 
 
 
364 aa  210  3e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.792853 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0545  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.5 
 
 
365 aa  207  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00114618 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0344  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  36.06 
 
 
375 aa  206  5e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.422853  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1664  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.83 
 
 
360 aa  206  5e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0508801  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3840  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.08 
 
 
385 aa  206  6e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0401  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.77 
 
 
375 aa  206  7e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2307  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.68 
 
 
372 aa  204  1e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6644  Benzyl alcohol dehydrogenase (Aryl-alcohol dehydrogenase)  34.42 
 
 
366 aa  204  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.143497 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6841  alcohol dehydrogenase  39.77 
 
 
358 aa  203  3e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2889  histidine kinase  33.96 
 
 
368 aa  201  9.999999999999999e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.834376  hitchhiker  0.00334697 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1170  alcohol dehydrogenase  34.9 
 
 
364 aa  201  1.9999999999999998e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.168787  normal  0.12018 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3672  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.65 
 
 
366 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.618419  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3430  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.32 
 
 
374 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3295  alcohol dehydrogenase  33.14 
 
 
374 aa  199  6e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0746  alcohol dehydrogenase class 3  35.23 
 
 
382 aa  199  6e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.38906  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06925  hypothetical protein  34.96 
 
 
382 aa  199  7.999999999999999e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1978  alcohol dehydrogenase  40.11 
 
 
367 aa  199  7.999999999999999e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.312028  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000929  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  35.23 
 
 
382 aa  198  1.0000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3280  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.79 
 
 
368 aa  196  4.0000000000000005e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1980  alcohol dehydrogenase  39.13 
 
 
360 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3448  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.07 
 
 
371 aa  195  9e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0108  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  34.88 
 
 
369 aa  194  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3245  alcohol dehydrogenase  34.32 
 
 
374 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.813592 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1176  alcohol dehydrogenase  34.33 
 
 
373 aa  194  2e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5633  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  34.6 
 
 
369 aa  194  3e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2799  alcohol dehydrogenase  38.19 
 
 
363 aa  193  3e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000199621 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4812  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.43 
 
 
368 aa  194  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.693822  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5014  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.19 
 
 
366 aa  193  4e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.102148  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2878  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  39.42 
 
 
361 aa  193  5e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2747  alcohol dehydrogenase  35.21 
 
 
403 aa  192  5e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6306  alcohol dehydrogenase  36.77 
 
 
375 aa  193  5e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.767014  normal  0.227399 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0741  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.15 
 
 
370 aa  192  7e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4059  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  34.82 
 
 
370 aa  192  7e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000294159 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1938  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  34.04 
 
 
373 aa  192  7e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.831257  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2956  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.33 
 
 
369 aa  191  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00985195  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0183  alcohol dehydrogenase  34.13 
 
 
376 aa  192  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1510  class III alcohol dehydrogenase  34.24 
 
 
370 aa  192  1e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3763  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.87 
 
 
376 aa  192  1e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4902  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.97 
 
 
368 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172476  normal  0.673042 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1540  alcohol dehydrogenase  35.77 
 
 
376 aa  191  2e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.47275  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3489  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.55 
 
 
375 aa  190  2.9999999999999997e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.161991 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1667  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
373 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3073  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.94 
 
 
363 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0995  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.91 
 
 
362 aa  190  4e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0675195  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0375  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  34.56 
 
 
376 aa  189  5e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0920  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.65 
 
 
377 aa  189  5e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5580  alcohol dehydrogenase  36.21 
 
 
375 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606478  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3021  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  35.36 
 
 
376 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6119  alcohol dehydrogenase  35.65 
 
 
375 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4161  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  34.82 
 
 
370 aa  189  7e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.983661  normal  0.423904 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0269  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  35.09 
 
 
376 aa  189  8e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0321  alcohol dehydrogenase  34.69 
 
 
370 aa  189  8e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4227  alcohol dehydrogenase  34.83 
 
 
376 aa  189  9e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00409479 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1170  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  34.54 
 
 
370 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.583443  normal  0.562298 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>