More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3489 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_3489  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  100 
 
 
375 aa  753    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.161991 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1312  zinc-binding alcohol dehydrogenase  81.02 
 
 
375 aa  585  1e-166  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6517  alcohol dehydrogenase  81.02 
 
 
375 aa  585  1e-166  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6306  alcohol dehydrogenase  80.74 
 
 
375 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.767014  normal  0.227399 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6119  alcohol dehydrogenase  80.17 
 
 
375 aa  579  1e-164  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5580  alcohol dehydrogenase  79.89 
 
 
375 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606478  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3245  alcohol dehydrogenase  72.13 
 
 
374 aa  541  1e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.813592 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1473  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  66.67 
 
 
368 aa  499  1e-140  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.420949  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1758  zinc-binding alcohol dehydrogenase  62.47 
 
 
368 aa  440  9.999999999999999e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0220518  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3763  zinc-binding alcohol dehydrogenase  57.02 
 
 
376 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4812  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  51.92 
 
 
368 aa  395  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.693822  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3430  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  52.75 
 
 
374 aa  394  1e-109  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3899  alcohol dehydrogenase  54.55 
 
 
365 aa  388  1e-107  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.323018  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6644  Benzyl alcohol dehydrogenase (Aryl-alcohol dehydrogenase)  51.64 
 
 
366 aa  384  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.143497 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4902  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  51.37 
 
 
368 aa  382  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172476  normal  0.673042 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3334  alcohol dehydrogenase  50.14 
 
 
364 aa  360  3e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.814628  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1176  alcohol dehydrogenase  49.86 
 
 
373 aa  353  4e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0349  zinc-binding alcohol dehydrogenase  50.41 
 
 
363 aa  349  4e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2120  alcohol dehydrogenase  49.59 
 
 
366 aa  338  9e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2504  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  49.18 
 
 
371 aa  334  1e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1170  alcohol dehydrogenase  47.92 
 
 
364 aa  334  1e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.168787  normal  0.12018 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28790  Zn-dependent alcohol dehydrogenase, class III  50.14 
 
 
366 aa  333  4e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.197382 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4414  aryl-alcohol dehydrogenase  46.05 
 
 
370 aa  325  6e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.963565  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6462  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  48.63 
 
 
381 aa  325  8.000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0355493  normal  0.217815 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0089  alcohol dehydrogenase  46.15 
 
 
368 aa  313  2.9999999999999996e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.954912  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1032  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.93 
 
 
362 aa  312  4.999999999999999e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.420541  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1578  alcohol dehydrogenase  45.38 
 
 
368 aa  308  8e-83  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1956  alcohol dehydrogenase  44.26 
 
 
365 aa  293  4e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0230313 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3899  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.02 
 
 
372 aa  291  2e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0304  alcohol dehydrogenase  47.61 
 
 
368 aa  288  1e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.48606 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1664  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.73 
 
 
365 aa  271  1e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.918832  normal  0.468914 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08356  alcohol dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01780)  40.55 
 
 
387 aa  264  2e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0725  alcohol dehydrogenase  44.23 
 
 
363 aa  264  2e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06808  conserved hypothetical protein  38.5 
 
 
326 aa  247  2e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.286718 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3471  alcohol dehydrogenase  42.7 
 
 
370 aa  241  2e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0151669  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2391  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.15 
 
 
358 aa  240  2.9999999999999997e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.050478  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2709  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  44.2 
 
 
371 aa  239  4e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.778687  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6807  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.54 
 
 
361 aa  237  3e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.842696  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10671  conserved hypothetical protein  38.61 
 
 
379 aa  227  3e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38750  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  37.74 
 
 
371 aa  223  4.9999999999999996e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0742  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.99 
 
 
368 aa  220  3e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2469  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.88 
 
 
375 aa  216  4e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.43107  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3680  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  37.43 
 
 
372 aa  216  4e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.030881  normal  0.148071 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1510  class III alcohol dehydrogenase  37.63 
 
 
370 aa  216  7e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1938  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  37.3 
 
 
373 aa  215  9.999999999999999e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.831257  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1939  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.12 
 
 
374 aa  211  2e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34292  Alcohol dehydrogenase, class III, bacterial-like protein  36.61 
 
 
334 aa  210  3e-53  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.149646  normal  0.265783 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0743  alcohol dehydrogenase  36.13 
 
 
366 aa  210  3e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1667  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  36.39 
 
 
373 aa  210  3e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7131  alcohol dehydrogenase  37.06 
 
 
362 aa  210  4e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1671  Zn-dependent alcohol dehydrogenase class III  35.58 
 
 
376 aa  209  5e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.610289  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3530  alcohol dehydrogenase  36.56 
 
 
376 aa  209  5e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00425033 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2473  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  36.12 
 
 
379 aa  209  5e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2571  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  36.12 
 
 
379 aa  209  5e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3011  alcohol dehydrogenase  36.12 
 
 
379 aa  209  5e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0290294  hitchhiker  0.000974113 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1557  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  35.37 
 
 
375 aa  209  9e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1540  alcohol dehydrogenase  37.2 
 
 
376 aa  208  1e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.47275  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5201  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  36.41 
 
 
361 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2411  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  37.53 
 
 
373 aa  207  2e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1829  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  36.49 
 
 
372 aa  207  2e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0359093  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0408  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  36.16 
 
 
361 aa  206  5e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0817  alcohol dehydrogenase, class III  36.39 
 
 
376 aa  206  6e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1270  alcohol dehydrogenase class III  37.71 
 
 
359 aa  206  6e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.303714  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17400  alcohol dehydrogenase class III  36.49 
 
 
370 aa  206  6e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0321  alcohol dehydrogenase  36.12 
 
 
370 aa  205  8e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3129  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.41 
 
 
368 aa  205  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0277629 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2174  alcohol dehydrogenase  36.93 
 
 
379 aa  204  2e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2054  alcohol dehydrogenase class III  36.39 
 
 
379 aa  204  2e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2311  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  36.07 
 
 
373 aa  204  2e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.965631  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2408  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  36.93 
 
 
379 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.943982  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4825  putative alcohol dehydrogenase  37.29 
 
 
375 aa  204  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0410996  normal  0.464938 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1940  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  36.93 
 
 
379 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.390441  normal  0.834541 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2526  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  36.93 
 
 
379 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.879983  normal  0.6792 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3028  alcohol dehydrogenase  35.77 
 
 
370 aa  204  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000388356 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1786  alcohol dehydrogenase  36.66 
 
 
379 aa  204  2e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2191  alcohol dehydrogenase  36.66 
 
 
379 aa  204  2e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.934833  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2419  alcohol dehydrogenase  36.93 
 
 
379 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1837  alcohol dehydrogenase  36.66 
 
 
379 aa  204  2e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.245686 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0874  alcohol dehydrogenase  35.22 
 
 
383 aa  204  3e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.101876  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4059  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  36.31 
 
 
370 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000294159 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1032  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  36.46 
 
 
384 aa  203  5e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0459  glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase  36.39 
 
 
369 aa  202  7e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1394  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.5 
 
 
370 aa  202  8e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0239994  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1230  alcohol dehydrogenase  34.96 
 
 
368 aa  202  9e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.291862  normal  0.236106 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05434  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 
380 aa  201  9.999999999999999e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.106976  normal  0.0393191 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3972  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  33.6 
 
 
372 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.98607 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1125  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.41 
 
 
370 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8750  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.88 
 
 
359 aa  201  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.144332 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3021  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  35.31 
 
 
376 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3009  alcohol dehydrogenase  34.51 
 
 
361 aa  201  1.9999999999999998e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.39042  normal  0.310098 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0052  alcohol dehydrogenase class III  36.66 
 
 
376 aa  200  3e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.657136 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4639  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  34.68 
 
 
369 aa  200  3e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.124156  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1616  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  36.04 
 
 
371 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.634826  normal  0.536311 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0746  alcohol dehydrogenase class 3  35.39 
 
 
382 aa  200  3.9999999999999996e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.38906  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2272  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.56 
 
 
374 aa  199  3.9999999999999996e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1438  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.58 
 
 
374 aa  199  5e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3405  formaldehyde dehydrogenase (glutathione)  36.12 
 
 
372 aa  199  6e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.244128  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4161  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  36.04 
 
 
370 aa  199  6e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.983661  normal  0.423904 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0121  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.31 
 
 
368 aa  199  6e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3587  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  34.68 
 
 
369 aa  199  7e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>