More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4902 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4902  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  100 
 
 
368 aa  736    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172476  normal  0.673042 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4812  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  95.37 
 
 
368 aa  706    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.693822  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6644  Benzyl alcohol dehydrogenase (Aryl-alcohol dehydrogenase)  65.11 
 
 
366 aa  489  1e-137  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.143497 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1473  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  56.04 
 
 
368 aa  410  1e-113  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.420949  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1758  zinc-binding alcohol dehydrogenase  58.24 
 
 
368 aa  402  1e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0220518  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6306  alcohol dehydrogenase  56.21 
 
 
375 aa  397  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.767014  normal  0.227399 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1312  zinc-binding alcohol dehydrogenase  55.65 
 
 
375 aa  394  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6517  alcohol dehydrogenase  55.65 
 
 
375 aa  394  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3245  alcohol dehydrogenase  54.55 
 
 
374 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.813592 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5580  alcohol dehydrogenase  55.93 
 
 
375 aa  394  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606478  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6119  alcohol dehydrogenase  54.52 
 
 
375 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3899  alcohol dehydrogenase  50.41 
 
 
365 aa  380  1e-104  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.323018  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3430  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  52.05 
 
 
374 aa  374  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3763  zinc-binding alcohol dehydrogenase  52.33 
 
 
376 aa  374  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3489  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  51.37 
 
 
375 aa  369  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.161991 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0089  alcohol dehydrogenase  50.27 
 
 
368 aa  356  3.9999999999999996e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.954912  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0349  zinc-binding alcohol dehydrogenase  51.78 
 
 
363 aa  352  5e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1578  alcohol dehydrogenase  47.12 
 
 
368 aa  342  5.999999999999999e-93  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1170  alcohol dehydrogenase  46.56 
 
 
364 aa  339  5e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.168787  normal  0.12018 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3899  zinc-binding alcohol dehydrogenase  47.43 
 
 
372 aa  330  3e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1956  alcohol dehydrogenase  49.86 
 
 
365 aa  327  3e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0230313 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3334  alcohol dehydrogenase  43.45 
 
 
364 aa  323  2e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.814628  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1176  alcohol dehydrogenase  48.33 
 
 
373 aa  322  5e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4414  aryl-alcohol dehydrogenase  46.87 
 
 
370 aa  322  9.000000000000001e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.963565  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6462  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  46.83 
 
 
381 aa  317  3e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0355493  normal  0.217815 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2120  alcohol dehydrogenase  45.33 
 
 
366 aa  304  1.0000000000000001e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2504  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  45.33 
 
 
371 aa  302  6.000000000000001e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1664  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.14 
 
 
365 aa  299  4e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.918832  normal  0.468914 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1032  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.45 
 
 
362 aa  288  8e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.420541  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28790  Zn-dependent alcohol dehydrogenase, class III  45.6 
 
 
366 aa  286  5e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.197382 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0725  alcohol dehydrogenase  44.66 
 
 
363 aa  262  6e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0304  alcohol dehydrogenase  45.22 
 
 
368 aa  259  5.0000000000000005e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.48606 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6807  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.87 
 
 
361 aa  249  7e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.842696  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08356  alcohol dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01780)  38.1 
 
 
387 aa  243  3.9999999999999997e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3471  alcohol dehydrogenase  42.08 
 
 
370 aa  242  7.999999999999999e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0151669  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06808  conserved hypothetical protein  38.36 
 
 
326 aa  241  2e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.286718 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2391  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.97 
 
 
358 aa  240  2.9999999999999997e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.050478  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2709  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  42.12 
 
 
371 aa  223  4.9999999999999996e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.778687  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1510  class III alcohol dehydrogenase  37.63 
 
 
370 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05434  conserved hypothetical protein  35.09 
 
 
380 aa  220  3e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.106976  normal  0.0393191 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2089  alcohol dehydrogenase  40.23 
 
 
372 aa  220  3.9999999999999997e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.864443  normal  0.876446 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0742  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.34 
 
 
368 aa  217  2e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17400  alcohol dehydrogenase class III  37.1 
 
 
370 aa  218  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7131  alcohol dehydrogenase  38.19 
 
 
362 aa  216  4e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000929  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  36.56 
 
 
382 aa  216  7e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1438  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.29 
 
 
374 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1424  alcohol dehydrogenase  39.12 
 
 
360 aa  215  9.999999999999999e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.350206 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3680  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  36.02 
 
 
372 aa  214  1.9999999999999998e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.030881  normal  0.148071 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1938  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  35.48 
 
 
373 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.831257  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0817  alcohol dehydrogenase, class III  36.29 
 
 
376 aa  214  2.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0874  alcohol dehydrogenase  36.46 
 
 
383 aa  213  2.9999999999999995e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.101876  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3028  alcohol dehydrogenase  35.75 
 
 
370 aa  212  7.999999999999999e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000388356 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1667  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  35.22 
 
 
373 aa  211  2e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0746  alcohol dehydrogenase class 3  36.02 
 
 
382 aa  211  2e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.38906  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1671  Zn-dependent alcohol dehydrogenase class III  34.95 
 
 
376 aa  210  3e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.610289  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38750  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  35.22 
 
 
371 aa  210  3e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3009  alcohol dehydrogenase  34.99 
 
 
361 aa  210  3e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.39042  normal  0.310098 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0459  glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase  36.56 
 
 
369 aa  209  5e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3530  alcohol dehydrogenase  34.95 
 
 
376 aa  209  5e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00425033 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2473  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  34.95 
 
 
379 aa  209  7e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2571  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  34.95 
 
 
379 aa  209  7e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3011  alcohol dehydrogenase  34.95 
 
 
379 aa  209  7e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0290294  hitchhiker  0.000974113 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3405  formaldehyde dehydrogenase (glutathione)  34.96 
 
 
372 aa  208  1e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.244128  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1939  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.68 
 
 
374 aa  208  1e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1032  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  35.86 
 
 
384 aa  208  1e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1829  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  35.75 
 
 
372 aa  208  1e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0359093  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3767  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  37.43 
 
 
361 aa  208  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0836579  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06925  hypothetical protein  36.29 
 
 
382 aa  208  1e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03331  putative alcohol dehydrogenase  36.02 
 
 
385 aa  207  2e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1540  alcohol dehydrogenase  35.48 
 
 
376 aa  207  2e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.47275  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0321  alcohol dehydrogenase  34.95 
 
 
370 aa  207  3e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1394  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.95 
 
 
370 aa  206  4e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0239994  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2174  alcohol dehydrogenase  35.48 
 
 
379 aa  206  5e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2408  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  35.48 
 
 
379 aa  206  5e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.943982  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2419  alcohol dehydrogenase  35.48 
 
 
379 aa  206  5e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2526  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  35.48 
 
 
379 aa  206  5e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.879983  normal  0.6792 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1940  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  35.48 
 
 
379 aa  206  5e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.390441  normal  0.834541 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2054  alcohol dehydrogenase class III  34.95 
 
 
379 aa  206  8e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3679  alcohol dehydrogenase  36.51 
 
 
367 aa  206  8e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3972  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  34.15 
 
 
372 aa  206  8e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.98607 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10671  conserved hypothetical protein  37.74 
 
 
379 aa  205  1e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5970  alcohol dehydrogenase class III  34.42 
 
 
369 aa  205  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.66491 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1839  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.12 
 
 
370 aa  205  1e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.75863  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1270  alcohol dehydrogenase class III  36.75 
 
 
359 aa  204  2e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.303714  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0408  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  37.91 
 
 
361 aa  204  2e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2251  alcohol dehydrogenase  34.68 
 
 
375 aa  204  2e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34292  Alcohol dehydrogenase, class III, bacterial-like protein  35.22 
 
 
334 aa  204  2e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.149646  normal  0.265783 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1179  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  34.85 
 
 
370 aa  203  3e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.457911  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1786  alcohol dehydrogenase  34.95 
 
 
379 aa  204  3e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2191  alcohol dehydrogenase  34.95 
 
 
379 aa  204  3e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.934833  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4059  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  34.68 
 
 
370 aa  204  3e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000294159 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1837  alcohol dehydrogenase  34.95 
 
 
379 aa  204  3e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.245686 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4825  putative alcohol dehydrogenase  36.73 
 
 
375 aa  203  4e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0410996  normal  0.464938 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2411  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  34.68 
 
 
373 aa  203  4e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1125  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.68 
 
 
370 aa  202  6e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0169  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  35.75 
 
 
371 aa  202  7e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0241  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  35.75 
 
 
371 aa  202  7e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.667436  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1170  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  35.22 
 
 
370 aa  202  8e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.583443  normal  0.562298 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0052  alcohol dehydrogenase class III  35.22 
 
 
376 aa  201  9.999999999999999e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.657136 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0101  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.6 
 
 
369 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.618314  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>