More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2747 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_2747  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
403 aa  798    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2610  alcohol dehydrogenase  67.47 
 
 
375 aa  470  1.0000000000000001e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.721019 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4825  putative alcohol dehydrogenase  61.5 
 
 
375 aa  449  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0410996  normal  0.464938 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3295  alcohol dehydrogenase  57.68 
 
 
374 aa  432  1e-120  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2469  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  54.81 
 
 
375 aa  426  1e-118  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.43107  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0401  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  59.36 
 
 
375 aa  422  1e-117  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0344  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  59.09 
 
 
375 aa  421  1e-117  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.422853  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0920  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  60.16 
 
 
377 aa  402  1e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0183  alcohol dehydrogenase  59.36 
 
 
376 aa  401  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3061  alcohol dehydrogenase  53.48 
 
 
374 aa  353  4e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0472  alcohol dehydrogenase  53.74 
 
 
374 aa  344  1e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1824  Zinc-containing alcohol dehydrogenase  53.74 
 
 
374 aa  344  1e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0101  alcohol dehydrogenase  51.46 
 
 
370 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0961812 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0111  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  51.46 
 
 
370 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.595465  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0120  alcohol dehydrogenase  51.46 
 
 
370 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0192727 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5014  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  58.18 
 
 
366 aa  334  2e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.102148  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3947  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  52.53 
 
 
372 aa  333  4e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.607291  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3448  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  46.58 
 
 
371 aa  319  6e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4357  putative alcohol dehydrogenase  51.87 
 
 
378 aa  308  1.0000000000000001e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.323003  normal  0.875115 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07750  Zn-dependent alcohol dehydrogenase, class III  50.13 
 
 
383 aa  307  2.0000000000000002e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.969259  normal  0.331312 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2496  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  48.93 
 
 
374 aa  306  3e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0742  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.86 
 
 
368 aa  296  3e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1320  alcohol dehydrogenase  48.38 
 
 
372 aa  295  1e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10163  zinc-type alcohol dehydrogenase subunit E adhE  49.33 
 
 
383 aa  283  6.000000000000001e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0743  alcohol dehydrogenase  43.33 
 
 
366 aa  277  2e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5201  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  43.63 
 
 
361 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1829  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  39.47 
 
 
372 aa  269  7e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0359093  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1540  alcohol dehydrogenase  39.21 
 
 
376 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.47275  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1939  zinc-binding alcohol dehydrogenase  38.95 
 
 
374 aa  266  7e-70  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2411  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  40 
 
 
373 aa  265  8.999999999999999e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7131  alcohol dehydrogenase  42.82 
 
 
362 aa  265  1e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3009  alcohol dehydrogenase  41.69 
 
 
361 aa  265  1e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.39042  normal  0.310098 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2311  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  39.74 
 
 
373 aa  263  3e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.965631  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2571  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  39.15 
 
 
379 aa  263  6e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2473  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  39.15 
 
 
379 aa  263  6e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3011  alcohol dehydrogenase  39.15 
 
 
379 aa  263  6e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0290294  hitchhiker  0.000974113 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1671  Zn-dependent alcohol dehydrogenase class III  38.68 
 
 
376 aa  262  8.999999999999999e-69  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.610289  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3680  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  39.39 
 
 
372 aa  261  2e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.030881  normal  0.148071 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1394  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  38.1 
 
 
370 aa  261  2e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0239994  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0817  alcohol dehydrogenase, class III  37.63 
 
 
376 aa  260  3e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3021  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  37.11 
 
 
376 aa  260  3e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1557  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  38.89 
 
 
375 aa  259  7e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1667  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  38.42 
 
 
373 aa  259  8e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1032  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  38.16 
 
 
384 aa  258  1e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4588  alcohol dehydrogenase  41.62 
 
 
368 aa  258  1e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.232692 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3530  alcohol dehydrogenase  37.63 
 
 
376 aa  258  1e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00425033 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1270  alcohol dehydrogenase class III  41.53 
 
 
359 aa  256  4e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.303714  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0608  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  40.06 
 
 
370 aa  256  5e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1775  putative alcohol dehydrogenase (zinc-binding)  43.42 
 
 
361 aa  255  8e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1438  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.84 
 
 
374 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1125  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  37.57 
 
 
370 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1938  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  37.63 
 
 
373 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.831257  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0269  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  36.58 
 
 
376 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1616  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  37.57 
 
 
371 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.634826  normal  0.536311 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0375  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  36.05 
 
 
376 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3073  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.07 
 
 
363 aa  253  5.000000000000001e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4227  alcohol dehydrogenase  36.05 
 
 
376 aa  252  7e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00409479 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0161  zinc-binding dehydrogenase  37.04 
 
 
376 aa  252  8.000000000000001e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2054  alcohol dehydrogenase class III  38.4 
 
 
379 aa  252  1e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1558  alcohol dehydrogenase, class III  37.83 
 
 
370 aa  251  1e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.86343  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38750  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  38.26 
 
 
371 aa  251  1e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0459  glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase  38.36 
 
 
369 aa  251  1e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4161  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  37.04 
 
 
370 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.983661  normal  0.423904 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1786  alcohol dehydrogenase  38.83 
 
 
379 aa  251  2e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2191  alcohol dehydrogenase  38.83 
 
 
379 aa  251  2e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.934833  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1837  alcohol dehydrogenase  38.83 
 
 
379 aa  251  2e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.245686 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2526  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  38.83 
 
 
379 aa  250  3e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.879983  normal  0.6792 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2419  alcohol dehydrogenase  38.83 
 
 
379 aa  250  3e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0052  alcohol dehydrogenase class III  37.57 
 
 
376 aa  250  3e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.657136 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0545  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.45 
 
 
365 aa  250  3e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00114618 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1940  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  38.83 
 
 
379 aa  250  3e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.390441  normal  0.834541 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2174  alcohol dehydrogenase  38.83 
 
 
379 aa  250  3e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2251  alcohol dehydrogenase  36.51 
 
 
375 aa  250  3e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1170  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  37.04 
 
 
370 aa  250  3e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.583443  normal  0.562298 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2408  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  38.83 
 
 
379 aa  250  3e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.943982  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2272  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  37.99 
 
 
374 aa  250  4e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17400  alcohol dehydrogenase class III  38.36 
 
 
370 aa  249  5e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0321  alcohol dehydrogenase  37.83 
 
 
370 aa  249  6e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1510  class III alcohol dehydrogenase  38.36 
 
 
370 aa  249  8e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4059  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  36.24 
 
 
370 aa  248  9e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000294159 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03331  putative alcohol dehydrogenase  37.08 
 
 
385 aa  247  2e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1980  alcohol dehydrogenase  40.97 
 
 
360 aa  248  2e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1367  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  37.3 
 
 
370 aa  247  3e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0004  alcohol dehydrogenase, zinc-binding  37.04 
 
 
377 aa  247  3e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000696036 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10580  Zn-dependent alcohol dehydrogenase, class III  38.44 
 
 
364 aa  246  6.999999999999999e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.107313  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3427  alcohol dehydrogenase  35.79 
 
 
376 aa  246  8e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4059  alcohol dehydrogenase  36.84 
 
 
376 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3767  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  36.59 
 
 
361 aa  244  3e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0836579  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2454  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  39.66 
 
 
361 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000626099  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3472  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  37.01 
 
 
366 aa  243  5e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0995  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  43.1 
 
 
362 aa  243  5e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0675195  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0746  alcohol dehydrogenase class 3  35.68 
 
 
382 aa  243  6e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.38906  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3767  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.32 
 
 
376 aa  243  6e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000929  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  35.68 
 
 
382 aa  242  7e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3972  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  37.71 
 
 
372 aa  242  7e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.98607 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1179  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  35.62 
 
 
370 aa  242  7.999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.457911  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04416  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  38.36 
 
 
369 aa  241  1e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06925  hypothetical protein  35.42 
 
 
382 aa  242  1e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3405  formaldehyde dehydrogenase (glutathione)  37.43 
 
 
372 aa  241  2e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.244128  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1341  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  38.2 
 
 
361 aa  241  2e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.600384  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>