More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1824 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_1824  Zinc-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 
374 aa  734    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3061  alcohol dehydrogenase  90.91 
 
 
374 aa  637    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0472  alcohol dehydrogenase  99.47 
 
 
374 aa  729    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4825  putative alcohol dehydrogenase  61.5 
 
 
375 aa  451  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0410996  normal  0.464938 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0401  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  55.47 
 
 
375 aa  409  1e-113  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0344  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  55.47 
 
 
375 aa  409  1e-113  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.422853  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3295  alcohol dehydrogenase  54.84 
 
 
374 aa  399  9.999999999999999e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2469  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  51.87 
 
 
375 aa  395  1e-109  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.43107  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0183  alcohol dehydrogenase  59.63 
 
 
376 aa  389  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0920  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  55.61 
 
 
377 aa  354  2e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2747  alcohol dehydrogenase  53.74 
 
 
403 aa  352  5.9999999999999994e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2610  alcohol dehydrogenase  53.62 
 
 
375 aa  336  2.9999999999999997e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.721019 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3448  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  48.81 
 
 
371 aa  336  3.9999999999999995e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5014  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  57.83 
 
 
366 aa  324  2e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.102148  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0111  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  50.94 
 
 
370 aa  315  7e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.595465  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0101  alcohol dehydrogenase  50.94 
 
 
370 aa  315  7e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0961812 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0120  alcohol dehydrogenase  50.94 
 
 
370 aa  315  7e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0192727 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3947  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  50.4 
 
 
372 aa  313  1.9999999999999998e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.607291  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0742  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.9 
 
 
368 aa  298  1e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2496  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  49.6 
 
 
374 aa  291  1e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10163  zinc-type alcohol dehydrogenase subunit E adhE  48.53 
 
 
383 aa  290  3e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07750  Zn-dependent alcohol dehydrogenase, class III  47.33 
 
 
383 aa  285  7e-76  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.969259  normal  0.331312 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4357  putative alcohol dehydrogenase  48.8 
 
 
378 aa  282  6.000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.323003  normal  0.875115 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1320  alcohol dehydrogenase  47.01 
 
 
372 aa  276  3e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5895  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.82 
 
 
359 aa  272  8.000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.500089 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7131  alcohol dehydrogenase  41.53 
 
 
362 aa  259  6e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1616  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  38.33 
 
 
371 aa  256  3e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.634826  normal  0.536311 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5201  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  41.67 
 
 
361 aa  256  3e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1667  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  38.08 
 
 
373 aa  256  4e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0608  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  38.33 
 
 
370 aa  255  8e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4161  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  37.78 
 
 
370 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.983661  normal  0.423904 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1170  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  37.78 
 
 
370 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.583443  normal  0.562298 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1125  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  37.22 
 
 
370 aa  252  6e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1775  putative alcohol dehydrogenase (zinc-binding)  41.74 
 
 
361 aa  252  9.000000000000001e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1829  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  38.61 
 
 
372 aa  252  9.000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0359093  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4059  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  37.02 
 
 
370 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000294159 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3011  alcohol dehydrogenase  37.5 
 
 
379 aa  251  1e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0290294  hitchhiker  0.000974113 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2473  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  37.5 
 
 
379 aa  251  1e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2571  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  37.5 
 
 
379 aa  251  1e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17400  alcohol dehydrogenase class III  37.5 
 
 
370 aa  249  4e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1510  class III alcohol dehydrogenase  37.5 
 
 
370 aa  249  4e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1938  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  37.26 
 
 
373 aa  249  5e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.831257  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1540  alcohol dehydrogenase  37.92 
 
 
376 aa  248  9e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.47275  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0743  alcohol dehydrogenase  40.68 
 
 
366 aa  248  1e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1558  alcohol dehydrogenase, class III  37.22 
 
 
370 aa  247  2e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.86343  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0545  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.2 
 
 
365 aa  248  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00114618 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2411  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  38.12 
 
 
373 aa  247  2e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0321  alcohol dehydrogenase  36.39 
 
 
370 aa  246  4.9999999999999997e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2311  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  38.4 
 
 
373 aa  245  9.999999999999999e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.965631  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1270  alcohol dehydrogenase class III  40.4 
 
 
359 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.303714  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38750  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  37.02 
 
 
371 aa  244  1.9999999999999999e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3680  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  37.36 
 
 
372 aa  244  3e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.030881  normal  0.148071 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1367  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  36.94 
 
 
370 aa  242  7e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1557  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  36.94 
 
 
375 aa  242  7.999999999999999e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3530  alcohol dehydrogenase  35.91 
 
 
376 aa  241  2e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00425033 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1438  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.11 
 
 
374 aa  239  4e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1394  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.28 
 
 
370 aa  239  6.999999999999999e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0239994  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2054  alcohol dehydrogenase class III  35.83 
 
 
379 aa  238  1e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0746  alcohol dehydrogenase class 3  35.36 
 
 
382 aa  238  1e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.38906  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06925  hypothetical protein  35.36 
 
 
382 aa  238  2e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3028  alcohol dehydrogenase  36.46 
 
 
370 aa  238  2e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000388356 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2251  alcohol dehydrogenase  36.8 
 
 
375 aa  237  2e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1032  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  36.67 
 
 
384 aa  237  2e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2174  alcohol dehydrogenase  35.96 
 
 
379 aa  236  3e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2526  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  35.96 
 
 
379 aa  236  3e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.879983  normal  0.6792 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0052  alcohol dehydrogenase class III  35.28 
 
 
376 aa  237  3e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.657136 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1940  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  35.96 
 
 
379 aa  236  3e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.390441  normal  0.834541 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03331  putative alcohol dehydrogenase  36.19 
 
 
385 aa  237  3e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1786  alcohol dehydrogenase  35.96 
 
 
379 aa  236  3e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2191  alcohol dehydrogenase  35.96 
 
 
379 aa  236  3e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.934833  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1837  alcohol dehydrogenase  35.96 
 
 
379 aa  236  3e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.245686 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2408  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  35.96 
 
 
379 aa  236  3e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.943982  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2419  alcohol dehydrogenase  35.96 
 
 
379 aa  236  3e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0375  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  36.39 
 
 
376 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2956  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  37.92 
 
 
369 aa  235  8e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00985195  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2166  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  35.83 
 
 
369 aa  235  8e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0269  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  35.83 
 
 
376 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0817  alcohol dehydrogenase, class III  35.28 
 
 
376 aa  234  1.0000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1671  Zn-dependent alcohol dehydrogenase class III  35 
 
 
376 aa  234  1.0000000000000001e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.610289  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3972  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  35.2 
 
 
372 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.98607 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3021  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  36.39 
 
 
376 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3418  alcohol dehydrogenase  36.11 
 
 
369 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.128659  normal  0.268531 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3405  formaldehyde dehydrogenase (glutathione)  35.14 
 
 
372 aa  233  3e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.244128  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000929  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  34.53 
 
 
382 aa  234  3e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0874  alcohol dehydrogenase  34.9 
 
 
383 aa  233  4.0000000000000004e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.101876  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18780  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  37.92 
 
 
362 aa  233  4.0000000000000004e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.424094 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4227  alcohol dehydrogenase  35.56 
 
 
376 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00409479 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5633  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  37.36 
 
 
369 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0161  zinc-binding dehydrogenase  35.03 
 
 
376 aa  232  6e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2272  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.83 
 
 
374 aa  232  6e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04416  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  37.15 
 
 
369 aa  232  8.000000000000001e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2034  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.28 
 
 
369 aa  232  9e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.294916 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0101  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.28 
 
 
369 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.618314  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0985  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  37.08 
 
 
369 aa  232  1e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0004  alcohol dehydrogenase, zinc-binding  35.28 
 
 
377 aa  231  1e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000696036 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3009  alcohol dehydrogenase  38.64 
 
 
361 aa  231  2e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.39042  normal  0.310098 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1939  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35 
 
 
374 aa  231  2e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2089  alcohol dehydrogenase  40.11 
 
 
372 aa  230  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.864443  normal  0.876446 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0108  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  37.08 
 
 
369 aa  230  3e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8254  zinc-type alcohol dehydrogenase AdhD (aldehyde reductase)  38.66 
 
 
361 aa  230  3e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0114849 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>