More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6644 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_6644  Benzyl alcohol dehydrogenase (Aryl-alcohol dehydrogenase)  100 
 
 
366 aa  745    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.143497 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4902  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  65.11 
 
 
368 aa  489  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172476  normal  0.673042 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4812  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  64.01 
 
 
368 aa  484  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.693822  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1473  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  54.37 
 
 
368 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.420949  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6119  alcohol dehydrogenase  55.49 
 
 
375 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6306  alcohol dehydrogenase  55.21 
 
 
375 aa  397  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.767014  normal  0.227399 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1312  zinc-binding alcohol dehydrogenase  55.21 
 
 
375 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1758  zinc-binding alcohol dehydrogenase  55.34 
 
 
368 aa  397  1e-109  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0220518  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5580  alcohol dehydrogenase  54.93 
 
 
375 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606478  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6517  alcohol dehydrogenase  55.21 
 
 
375 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3245  alcohol dehydrogenase  52.6 
 
 
374 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.813592 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3430  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  52.72 
 
 
374 aa  385  1e-106  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3899  alcohol dehydrogenase  52.19 
 
 
365 aa  388  1e-106  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.323018  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3763  zinc-binding alcohol dehydrogenase  50.96 
 
 
376 aa  374  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3489  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  51.64 
 
 
375 aa  371  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.161991 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0349  zinc-binding alcohol dehydrogenase  50.27 
 
 
363 aa  367  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2120  alcohol dehydrogenase  49.45 
 
 
366 aa  345  6e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1578  alcohol dehydrogenase  47.27 
 
 
368 aa  341  1e-92  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0089  alcohol dehydrogenase  47.92 
 
 
368 aa  337  1.9999999999999998e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.954912  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1956  alcohol dehydrogenase  47.27 
 
 
365 aa  333  4e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0230313 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4414  aryl-alcohol dehydrogenase  45.92 
 
 
370 aa  327  3e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.963565  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28790  Zn-dependent alcohol dehydrogenase, class III  48.08 
 
 
366 aa  322  5e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.197382 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1176  alcohol dehydrogenase  46.28 
 
 
373 aa  319  5e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3334  alcohol dehydrogenase  43.32 
 
 
364 aa  318  6e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.814628  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3899  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.11 
 
 
372 aa  317  1e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1170  alcohol dehydrogenase  43.45 
 
 
364 aa  316  5e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.168787  normal  0.12018 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6462  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45.88 
 
 
381 aa  312  5.999999999999999e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0355493  normal  0.217815 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2504  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  46.7 
 
 
371 aa  310  4e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1032  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.08 
 
 
362 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.420541  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1664  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.37 
 
 
365 aa  281  1e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.918832  normal  0.468914 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0304  alcohol dehydrogenase  44.57 
 
 
368 aa  263  4.999999999999999e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.48606 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0725  alcohol dehydrogenase  43.02 
 
 
363 aa  253  3e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6807  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.66 
 
 
361 aa  244  9.999999999999999e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.842696  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2391  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.72 
 
 
358 aa  245  9.999999999999999e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.050478  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06808  conserved hypothetical protein  35.62 
 
 
326 aa  244  1.9999999999999999e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.286718 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3471  alcohol dehydrogenase  40.33 
 
 
370 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0151669  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08356  alcohol dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01780)  37.75 
 
 
387 aa  233  3e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34292  Alcohol dehydrogenase, class III, bacterial-like protein  37.54 
 
 
334 aa  233  3e-60  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.149646  normal  0.265783 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2709  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  41.1 
 
 
371 aa  231  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.778687  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0742  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.16 
 
 
368 aa  229  7e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10671  conserved hypothetical protein  36.63 
 
 
379 aa  221  9.999999999999999e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2469  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.22 
 
 
375 aa  222  9.999999999999999e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.43107  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05434  conserved hypothetical protein  34.73 
 
 
380 aa  217  2e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.106976  normal  0.0393191 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3680  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  35.77 
 
 
372 aa  217  2e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.030881  normal  0.148071 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03331  putative alcohol dehydrogenase  34.77 
 
 
385 aa  214  9.999999999999999e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1667  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  34.77 
 
 
373 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1938  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  34.5 
 
 
373 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.831257  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0459  glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase  35.5 
 
 
369 aa  212  5.999999999999999e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0408  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  35.44 
 
 
361 aa  213  5.999999999999999e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1829  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34.86 
 
 
372 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0359093  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1540  alcohol dehydrogenase  34.95 
 
 
376 aa  212  7.999999999999999e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.47275  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0746  alcohol dehydrogenase class 3  34.77 
 
 
382 aa  212  9e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.38906  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2473  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  34.14 
 
 
379 aa  211  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2571  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  34.14 
 
 
379 aa  211  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3011  alcohol dehydrogenase  34.14 
 
 
379 aa  211  2e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0290294  hitchhiker  0.000974113 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1786  alcohol dehydrogenase  34.77 
 
 
379 aa  211  2e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2191  alcohol dehydrogenase  34.77 
 
 
379 aa  211  2e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.934833  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1837  alcohol dehydrogenase  34.77 
 
 
379 aa  211  2e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.245686 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2251  alcohol dehydrogenase  34.77 
 
 
375 aa  210  3e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000929  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  34.13 
 
 
382 aa  210  4e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06925  hypothetical protein  34.13 
 
 
382 aa  209  5e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2054  alcohol dehydrogenase class III  34.5 
 
 
379 aa  208  1e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4000  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.41 
 
 
368 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.137605  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0269  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  33.96 
 
 
376 aa  208  2e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2174  alcohol dehydrogenase  34.5 
 
 
379 aa  207  2e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1940  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  34.5 
 
 
379 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.390441  normal  0.834541 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0052  alcohol dehydrogenase class III  34.41 
 
 
376 aa  207  2e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.657136 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2408  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  34.5 
 
 
379 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.943982  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2526  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  34.5 
 
 
379 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.879983  normal  0.6792 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2419  alcohol dehydrogenase  34.5 
 
 
379 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1939  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.23 
 
 
374 aa  207  3e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4784  alcohol dehydrogenase  35.14 
 
 
368 aa  207  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00530396  normal  0.688561 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3021  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  33.69 
 
 
376 aa  206  4e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0375  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  33.69 
 
 
376 aa  206  5e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0161  zinc-binding dehydrogenase  33.96 
 
 
376 aa  206  6e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1270  alcohol dehydrogenase class III  35.33 
 
 
359 aa  206  7e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.303714  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4833  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.14 
 
 
368 aa  205  8e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.170406  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3387  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  35.41 
 
 
369 aa  205  1e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0945129  normal  0.744246 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0004  alcohol dehydrogenase, zinc-binding  34.32 
 
 
377 aa  205  1e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000696036 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2956  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.59 
 
 
369 aa  204  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00985195  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1671  Zn-dependent alcohol dehydrogenase class III  33.96 
 
 
376 aa  204  2e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.610289  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0183  alcohol dehydrogenase  38.67 
 
 
376 aa  204  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3530  alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
376 aa  204  2e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00425033 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5114  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  34.59 
 
 
369 aa  204  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0101  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.42 
 
 
369 aa  203  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.618314  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0522  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  33.78 
 
 
368 aa  204  3e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0605  bifunctional: glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase/alcohol dehydrogenase class III  34.05 
 
 
368 aa  203  4e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.378006  normal  0.42713 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4227  alcohol dehydrogenase  33.42 
 
 
376 aa  203  4e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00409479 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0608  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  34.96 
 
 
370 aa  203  4e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7131  alcohol dehydrogenase  34.62 
 
 
362 aa  203  4e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1438  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.96 
 
 
374 aa  203  4e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0069  bifunctional: glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase/alcohol dehydrogenase class III  33.78 
 
 
368 aa  202  5e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0483  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  33.24 
 
 
368 aa  202  5e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27799  hitchhiker  0.00130269 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2411  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  34.41 
 
 
373 aa  202  5e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3972  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  32.25 
 
 
372 aa  202  6e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.98607 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0535  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  33.51 
 
 
368 aa  202  9e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0817  alcohol dehydrogenase, class III  33.69 
 
 
376 aa  201  9.999999999999999e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1032  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  33.96 
 
 
384 aa  202  9.999999999999999e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1557  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  33.15 
 
 
375 aa  202  9.999999999999999e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12287  zinc-type alcohol dehydrogenase adhE2  32.79 
 
 
361 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>