More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3430 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_3430  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  100 
 
 
374 aa  753    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1473  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  57.1 
 
 
368 aa  431  1e-119  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.420949  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1758  zinc-binding alcohol dehydrogenase  60.55 
 
 
368 aa  415  9.999999999999999e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0220518  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3245  alcohol dehydrogenase  53.99 
 
 
374 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.813592 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6306  alcohol dehydrogenase  54.8 
 
 
375 aa  393  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.767014  normal  0.227399 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5580  alcohol dehydrogenase  54.8 
 
 
375 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606478  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6119  alcohol dehydrogenase  53.95 
 
 
375 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6644  Benzyl alcohol dehydrogenase (Aryl-alcohol dehydrogenase)  52.72 
 
 
366 aa  385  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.143497 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1312  zinc-binding alcohol dehydrogenase  54.24 
 
 
375 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6517  alcohol dehydrogenase  54.24 
 
 
375 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3899  alcohol dehydrogenase  52.63 
 
 
365 aa  388  1e-106  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.323018  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3489  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  52.75 
 
 
375 aa  383  1e-105  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.161991 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4812  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  52.88 
 
 
368 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.693822  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4902  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  52.05 
 
 
368 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172476  normal  0.673042 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0349  zinc-binding alcohol dehydrogenase  50 
 
 
363 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1170  alcohol dehydrogenase  49.59 
 
 
364 aa  355  8.999999999999999e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.168787  normal  0.12018 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3763  zinc-binding alcohol dehydrogenase  46.26 
 
 
376 aa  348  6e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1176  alcohol dehydrogenase  48.23 
 
 
373 aa  338  9.999999999999999e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0089  alcohol dehydrogenase  46.87 
 
 
368 aa  334  1e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.954912  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3334  alcohol dehydrogenase  43.65 
 
 
364 aa  333  3e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.814628  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2120  alcohol dehydrogenase  46.03 
 
 
366 aa  333  3e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1032  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.49 
 
 
362 aa  332  7.000000000000001e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.420541  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1578  alcohol dehydrogenase  44.99 
 
 
368 aa  321  9.999999999999999e-87  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2504  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  48.23 
 
 
371 aa  315  9.999999999999999e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28790  Zn-dependent alcohol dehydrogenase, class III  45.6 
 
 
366 aa  308  1.0000000000000001e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.197382 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4414  aryl-alcohol dehydrogenase  43.99 
 
 
370 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.963565  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1956  alcohol dehydrogenase  45.6 
 
 
365 aa  304  1.0000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0230313 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6462  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.49 
 
 
381 aa  296  4e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0355493  normal  0.217815 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3899  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.82 
 
 
372 aa  287  2e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1664  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.37 
 
 
365 aa  274  2.0000000000000002e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.918832  normal  0.468914 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0304  alcohol dehydrogenase  45.63 
 
 
368 aa  262  6.999999999999999e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.48606 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2709  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  46.34 
 
 
371 aa  253  4.0000000000000004e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.778687  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2391  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.87 
 
 
358 aa  251  1e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.050478  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0725  alcohol dehydrogenase  43.34 
 
 
363 aa  251  1e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6807  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.78 
 
 
361 aa  248  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.842696  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3471  alcohol dehydrogenase  42.01 
 
 
370 aa  242  6e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0151669  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06808  conserved hypothetical protein  35.52 
 
 
326 aa  235  1.0000000000000001e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.286718 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08356  alcohol dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01780)  35.48 
 
 
387 aa  228  1e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7131  alcohol dehydrogenase  37.6 
 
 
362 aa  228  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10671  conserved hypothetical protein  38.17 
 
 
379 aa  222  6e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5201  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  36.51 
 
 
361 aa  222  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0743  alcohol dehydrogenase  35.62 
 
 
366 aa  219  5e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3009  alcohol dehydrogenase  35.77 
 
 
361 aa  217  2.9999999999999998e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.39042  normal  0.310098 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3680  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  36.29 
 
 
372 aa  216  5.9999999999999996e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.030881  normal  0.148071 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1938  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  37.03 
 
 
373 aa  215  9.999999999999999e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.831257  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1270  alcohol dehydrogenase class III  37.36 
 
 
359 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.303714  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0742  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.7 
 
 
368 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1510  class III alcohol dehydrogenase  37.03 
 
 
370 aa  212  7.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1557  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  37 
 
 
375 aa  211  1e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2396  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  37.47 
 
 
361 aa  211  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.516126 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000929  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  35.75 
 
 
382 aa  211  2e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1667  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  36.76 
 
 
373 aa  211  2e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3028  alcohol dehydrogenase  35.41 
 
 
370 aa  209  6e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000388356 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06925  hypothetical protein  35.48 
 
 
382 aa  209  8e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3011  alcohol dehydrogenase  36.22 
 
 
379 aa  208  1e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0290294  hitchhiker  0.000974113 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2571  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  36.22 
 
 
379 aa  208  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0746  alcohol dehydrogenase class 3  36.02 
 
 
382 aa  208  1e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.38906  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2473  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  36.22 
 
 
379 aa  208  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0608  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  36.39 
 
 
370 aa  207  2e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3280  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.12 
 
 
368 aa  207  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17400  alcohol dehydrogenase class III  36.49 
 
 
370 aa  207  3e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3405  formaldehyde dehydrogenase (glutathione)  36.73 
 
 
372 aa  205  8e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.244128  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3679  alcohol dehydrogenase  35.6 
 
 
367 aa  205  8e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10580  Zn-dependent alcohol dehydrogenase, class III  36.46 
 
 
364 aa  205  1e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.107313  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03331  putative alcohol dehydrogenase  35.75 
 
 
385 aa  205  1e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38750  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  35.5 
 
 
371 aa  205  1e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34292  Alcohol dehydrogenase, class III, bacterial-like protein  36.87 
 
 
334 aa  204  1e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.149646  normal  0.265783 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0408  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  35.14 
 
 
361 aa  205  1e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1125  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.41 
 
 
370 aa  204  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0321  alcohol dehydrogenase  35.14 
 
 
370 aa  204  2e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1540  alcohol dehydrogenase  35.41 
 
 
376 aa  203  3e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.47275  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18780  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  36.04 
 
 
362 aa  204  3e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.424094 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1671  Zn-dependent alcohol dehydrogenase class III  35.39 
 
 
376 aa  204  3e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.610289  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0004  alcohol dehydrogenase, zinc-binding  36.19 
 
 
377 aa  203  3e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000696036 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1940  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  35.66 
 
 
379 aa  203  4e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.390441  normal  0.834541 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2419  alcohol dehydrogenase  35.66 
 
 
379 aa  203  4e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2174  alcohol dehydrogenase  35.66 
 
 
379 aa  203  4e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2411  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  35.68 
 
 
373 aa  203  4e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2408  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  35.66 
 
 
379 aa  203  4e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.943982  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2526  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  35.66 
 
 
379 aa  203  4e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.879983  normal  0.6792 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1939  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.41 
 
 
374 aa  202  6e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1829  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34.96 
 
 
372 aa  202  9e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0359093  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1786  alcohol dehydrogenase  35.12 
 
 
379 aa  202  9e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2191  alcohol dehydrogenase  35.12 
 
 
379 aa  202  9e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.934833  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1032  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  35.12 
 
 
384 aa  202  9e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1837  alcohol dehydrogenase  35.12 
 
 
379 aa  202  9e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.245686 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8750  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.41 
 
 
359 aa  201  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.144332 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0545  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.5 
 
 
365 aa  201  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00114618 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2902  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  35.41 
 
 
361 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0052  alcohol dehydrogenase class III  35.41 
 
 
376 aa  201  1.9999999999999998e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.657136 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2311  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  36.22 
 
 
373 aa  200  3e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.965631  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3767  alcohol dehydrogenase  35.14 
 
 
361 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225708  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2469  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.8 
 
 
375 aa  200  3.9999999999999996e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.43107  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4059  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  34.32 
 
 
370 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000294159 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0817  alcohol dehydrogenase, class III  34.32 
 
 
376 aa  199  5e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1980  alcohol dehydrogenase  36.44 
 
 
360 aa  199  5e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1703  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
368 aa  199  6e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198202  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4059  alcohol dehydrogenase  35.68 
 
 
376 aa  199  6e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0522  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  33.6 
 
 
368 aa  199  7e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3651  alcohol dehydrogenase  35.58 
 
 
365 aa  199  7e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198781  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>