More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1329 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_1329  alcohol dehydrogenase class 3  100 
 
 
361 aa  723    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.217477 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2454  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  81.99 
 
 
361 aa  590  1e-167  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000626099  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2396  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  81.72 
 
 
361 aa  590  1e-167  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.516126 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1403  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  80.61 
 
 
361 aa  584  1e-166  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0304986  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3767  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  77.29 
 
 
361 aa  573  1.0000000000000001e-162  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0836579  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3651  alcohol dehydrogenase  77.35 
 
 
365 aa  562  1.0000000000000001e-159  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198781  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3472  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  76.45 
 
 
366 aa  558  1e-158  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4165  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  76.54 
 
 
361 aa  559  1e-158  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.356272  normal  0.0548986 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0408  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  75.35 
 
 
361 aa  556  1e-157  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2902  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  74.79 
 
 
361 aa  551  1e-156  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1341  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  75.62 
 
 
361 aa  551  1e-156  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.600384  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12287  zinc-type alcohol dehydrogenase adhE2  76.18 
 
 
361 aa  547  1e-155  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4761  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  77.01 
 
 
362 aa  548  1e-155  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3380  zinc-binding alcohol dehydrogenase  74.59 
 
 
362 aa  545  1e-154  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.286497  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3391  alcohol dehydrogenase  74.59 
 
 
362 aa  545  1e-154  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.508569  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3442  alcohol dehydrogenase  74.59 
 
 
362 aa  545  1e-154  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.174666  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2925  alcohol dehydrogenase  78.12 
 
 
361 aa  541  1e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03740  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  74.93 
 
 
363 aa  541  9.999999999999999e-153  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.147839 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3767  alcohol dehydrogenase  73.68 
 
 
361 aa  538  9.999999999999999e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225708  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18780  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  75.69 
 
 
362 aa  535  1e-151  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.424094 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5066  alcohol dehydrogenase  73.07 
 
 
366 aa  532  1e-150  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0364575 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2885  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  75.07 
 
 
363 aa  531  1e-150  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.897584  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3723  alcohol dehydrogenase  76.74 
 
 
380 aa  531  1e-150  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2766  alcohol dehydrogenase  73.08 
 
 
364 aa  534  1e-150  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.170215  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10580  Zn-dependent alcohol dehydrogenase, class III  73.42 
 
 
364 aa  526  1e-148  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.107313  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15330  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  75.76 
 
 
366 aa  521  1e-147  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0910  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  71.31 
 
 
372 aa  518  1e-146  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.788021  normal  0.0507788 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0092  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  71.59 
 
 
363 aa  509  1e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1449  zinc-binding alcohol dehydrogenase  73.74 
 
 
362 aa  493  9.999999999999999e-139  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0465334 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21860  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  65.1 
 
 
574 aa  465  9.999999999999999e-131  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4646  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  63.54 
 
 
366 aa  380  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0742  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.66 
 
 
368 aa  281  1e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1775  putative alcohol dehydrogenase (zinc-binding)  43.21 
 
 
361 aa  259  6e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1270  alcohol dehydrogenase class III  42.99 
 
 
359 aa  251  1e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.303714  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7131  alcohol dehydrogenase  40.23 
 
 
362 aa  251  1e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3009  alcohol dehydrogenase  37.26 
 
 
361 aa  237  2e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.39042  normal  0.310098 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2469  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.57 
 
 
375 aa  235  1.0000000000000001e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.43107  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0743  alcohol dehydrogenase  37.6 
 
 
366 aa  234  2.0000000000000002e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1664  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.5 
 
 
360 aa  230  2e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0508801  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2883  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.95 
 
 
383 aa  230  3e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5201  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  37.57 
 
 
361 aa  229  4e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2600  alcohol dehydrogenase  41.52 
 
 
363 aa  227  2e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.163819  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5895  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.46 
 
 
359 aa  225  9e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.500089 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0920  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.03 
 
 
377 aa  220  3e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1978  alcohol dehydrogenase  42.54 
 
 
367 aa  218  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.312028  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8254  zinc-type alcohol dehydrogenase AdhD (aldehyde reductase)  37.98 
 
 
361 aa  218  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0114849 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3295  alcohol dehydrogenase  35.29 
 
 
374 aa  216  4e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0344  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  36.26 
 
 
375 aa  216  5e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.422853  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06925  hypothetical protein  37.84 
 
 
382 aa  216  5e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3680  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  35.77 
 
 
372 aa  216  5e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.030881  normal  0.148071 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0401  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.98 
 
 
375 aa  216  5.9999999999999996e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2247  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.17 
 
 
364 aa  214  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.792853 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2307  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.95 
 
 
372 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2889  histidine kinase  34.14 
 
 
368 aa  214  2.9999999999999995e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.834376  hitchhiker  0.00334697 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1540  alcohol dehydrogenase  37.23 
 
 
376 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.47275  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2311  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  37.77 
 
 
373 aa  211  1e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.965631  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4825  putative alcohol dehydrogenase  35.41 
 
 
375 aa  211  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0410996  normal  0.464938 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0183  alcohol dehydrogenase  37.75 
 
 
376 aa  211  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0349  zinc-binding alcohol dehydrogenase  38.02 
 
 
363 aa  211  2e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0004  alcohol dehydrogenase, zinc-binding  37.5 
 
 
377 aa  211  2e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000696036 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000929  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  36.49 
 
 
382 aa  210  3e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03331  putative alcohol dehydrogenase  37.23 
 
 
385 aa  210  3e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2571  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  37.23 
 
 
379 aa  209  4e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1394  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  36.96 
 
 
370 aa  209  4e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0239994  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1980  alcohol dehydrogenase  39.66 
 
 
360 aa  210  4e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1938  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  37.23 
 
 
373 aa  210  4e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.831257  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3011  alcohol dehydrogenase  37.23 
 
 
379 aa  209  4e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0290294  hitchhiker  0.000974113 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2799  alcohol dehydrogenase  41.52 
 
 
363 aa  209  4e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000199621 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2473  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  37.23 
 
 
379 aa  209  4e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2251  alcohol dehydrogenase  36.51 
 
 
375 aa  209  5e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0052  alcohol dehydrogenase class III  36.68 
 
 
376 aa  208  1e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.657136 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3767  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.41 
 
 
376 aa  208  1e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1667  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  36.68 
 
 
373 aa  208  1e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1032  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  37.77 
 
 
384 aa  208  1e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0545  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.46 
 
 
365 aa  207  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00114618 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2411  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  37.5 
 
 
373 aa  207  3e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2747  alcohol dehydrogenase  37.96 
 
 
403 aa  206  4e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0741  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.97 
 
 
370 aa  206  6e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0746  alcohol dehydrogenase class 3  36.76 
 
 
382 aa  206  7e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.38906  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3530  alcohol dehydrogenase  36.14 
 
 
376 aa  205  8e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00425033 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1557  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  36.41 
 
 
375 aa  205  9e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2526  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  36.14 
 
 
379 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.879983  normal  0.6792 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2408  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  36.14 
 
 
379 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.943982  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2419  alcohol dehydrogenase  36.14 
 
 
379 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1939  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.68 
 
 
374 aa  205  1e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3073  zinc-binding alcohol dehydrogenase  38.24 
 
 
363 aa  205  1e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1438  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.41 
 
 
374 aa  205  1e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1940  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  36.14 
 
 
379 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.390441  normal  0.834541 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2174  alcohol dehydrogenase  36.14 
 
 
379 aa  204  1e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1671  Zn-dependent alcohol dehydrogenase class III  37.23 
 
 
376 aa  204  2e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.610289  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0459  glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase  36.49 
 
 
369 aa  204  2e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4059  alcohol dehydrogenase  36.14 
 
 
376 aa  204  2e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3245  alcohol dehydrogenase  36.99 
 
 
374 aa  204  3e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.813592 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3672  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.77 
 
 
366 aa  203  3e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.618419  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1786  alcohol dehydrogenase  36.41 
 
 
379 aa  203  4e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2191  alcohol dehydrogenase  36.41 
 
 
379 aa  203  4e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.934833  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1837  alcohol dehydrogenase  36.41 
 
 
379 aa  203  4e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.245686 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2610  alcohol dehydrogenase  37.15 
 
 
375 aa  202  5e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.721019 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3679  alcohol dehydrogenase  36.67 
 
 
367 aa  202  7e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1473  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.44 
 
 
368 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.420949  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>